[R-br] RES: Criar função para tirar a média entre grupos sob condições dadas
ASANTOS
alexandresantosbr em yahoo.com.br
Sábado Janeiro 30 18:00:29 BRST 2016
Obrigado Éder,
Na verdade não tinha atentado a isso, mas agora deu outro erro,
sendo:
Error in apply(results, 1, function(x) { :
dim(X) must have a positive length
> str(tableFE99)
Error in head(tableFE99) : objeto 'tableFE99' não encontrado
O CRM que estou usando é:
### <code r>
require(RCurl); require(XML)
## Função de leitura da tabela
readFE<- function (x, URL = ""){
url0 <- URL
url1 <- gsub("(^.*)(/s/.*)(\\?.*$)",
"https://dl.dropboxusercontent.com\\2", url0); url1
page <- getURL(url1)
classes <- c(rep("factor", 6), rep("numeric", 4), "factor")
tableFE <- readHTMLTable(page, head=T, colClasses=classes)[[1]]
x<-NULL
results <- x
results <- x
results<-results[!apply(results,1,function(x){any(x=="(NULL)")}),]
results<-subset(results, !(latitude == "0.00000000" | longitude ==
"0.00000000"))
results
}
#--#
## Tentativa de leitura da tabela
tableFE99<-readFE(URL="https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1")
str(tableFE99)
### </code>
--
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Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
Campus Cáceres
Caixa Postal 244
Avenida dos Ramires, s/n
Bairro: Distrito Industrial
Cáceres - MT CEP: 78.200-000
Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO)
e-mails:alexandresantosbr em yahoo.com.br
alexandre.santos em cas.ifmt.edu.br
Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680
OrcID: orcid.org/0000-0001-8232-6722
Researchgate: https://www.researchgate.net/profile/Alexandre_Santos10
LinkedIn: https://br.linkedin.com/in/alexandre-dos-santos-87961635
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Em 30/01/2016 14:43, Éder Comunello escreveu:
> Senhores, boa tarde!
>
> Na forma que sugeri é necessário alterar o link "default" do dropbox
> pra acessar diretamente o arquivo.
>
> ### <code r>
> require(RCurl); require(XML)
> url0 <-
> "https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1"
> url1 <- gsub("(^.*)(/s/.*)(\\?.*$)",
> "https://dl.dropboxusercontent.com\\2", url0); url1
>
> page <- getURL(url1)
> # page <- getURL(url1, ssl.verifypeer = FALSE)
> classes <- c(rep("factor", 6), rep("numeric", 4), "factor")
> tableFE <- readHTMLTable(page, head=T, colClasses=classes)[[1]]
> str(tableFE)
> ### </code>
>
>
> ================================================
> Éder Comunello
> PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)
> Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)
> Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]
>
>
>
>
> Em 30 de janeiro de 2016 12:17, Paulo Nogueira Starzynski
> <paulons em gmail.com <mailto:paulons em gmail.com>> escreveu:
>
> Alexandre,
> no teste que fiz aqui, o problema é na leitura da tabela. A função
> getURL não está retornando conteúdo que a função readHTMLTable
> possa extrair.
>
> >URL="https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1"
> > page <- RCurl::getURL(URL) > page [1] "<html>\r\n <head><title>Found</title></head>\r\n <body>\r\n <h1>Found</h1>\r\n <p>The resource was found at <a href=\"https://dl.dropboxusercontent.com/content_link/tkauy9obP7pgxKYpb9j5ZR2LCSUTe2iJpaULTWEN4RzdfR6AtirbNWGtt8q9Ncex/file?dl=1\
> <https://dl.dropboxusercontent.com/content_link/tkauy9obP7pgxKYpb9j5ZR2LCSUTe2iJpaULTWEN4RzdfR6AtirbNWGtt8q9Ncex/file?dl=1%5C>">https://dl.dropboxusercontent.com/content_link/tkauy9obP7pgxKYpb9j5ZR2LCSUTe2iJpaULTWEN4RzdfR6AtirbNWGtt8q9Ncex/file?dl=1</a>;\r\nyou should be redirected automatically.\r\n\r\n<!-- --></p>\r\n <hr noshade>\r\n <div align=\"right\">WSGI Server</div>\r\n </body>\r\n</html>\r\n"
>
>
> Abraços,
> Paulo
>
> Em 30 de janeiro de 2016 12:16, ASANTOS
> <alexandresantosbr em yahoo.com.br
> <mailto:alexandresantosbr em yahoo.com.br>> escreveu:
>
> Bom dia Éder,
>
>
> Tentei criar uma função com os comandos de leitura da
> tabela em HTML e também não funfou, posso pedir novamente sua
> ajuda, Obrigado,
>
>
>
> ## Função de leitura da tabela
> readFE<- function (x, URL = ""){
>
> page <- getURL(URL)
> classes <- c(rep("factor", 6), rep("numeric", 4), "factor")
> tableFE <- readHTMLTable(page, head=T, colClasses=classes)[[1]]
> x<-NULL
> results <- x
> results <- x
> results<-results[!apply(results,1,function(x){any(x=="(NULL)")}),]
> results<-subset(results, !(latitude == "0.00000000" |
> longitude == "0.00000000"))
> results
> }
> #--#
>
>
>
>
>
> ## Tentativa de leitura da tabela
> tableFE<-readFE(URL="https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1"
> <https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1>)
> head(tableFE)
> #---------------
>
>
>
>
> --
> ======================================================================
> Alexandre dos Santos
> Proteção Florestal
> IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
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> Caixa Postal 244
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> Em 29/01/2016 08:41, Éder Comunello escreveu:
>> Alexandre, bom dia!
>>
>> Não havia atentado para o problema na importação das tabelas,
>> sendo necessário definir as classes. Além disso, na função
>> você deve se referir a "db" antes que "tableFE" e "x" é
>> definido internamente por lapply().
>>
>>
>> ### <code r>
>> require(RCurl); require(XML)
>> url0 <-
>> "https://www.dropbox.com/s/znmr0lwda2y6fc5/BD_teste2.html?dl=1"
>> url1 <- gsub("(^.*)(/s/.*)(\\?.*$)",
>> "https://dl.dropboxusercontent.com\\2", url0); url1
>> # [1]
>> "https://dl.dropboxusercontent.com/s/znmr0lwda2y6fc5/BD_teste2.html"
>>
>> page <- getURL(url1)
>> tableFE <- readHTMLTable(page, head=T)[[1]]
>> str(tableFE) ### todas variáveis estão como fatores - corrigir!
>>
>> classes <- c(rep("factor", 6), rep("numeric", 4), "factor")
>> tableFE <- readHTMLTable(page, head=T, colClasses=classes)[[1]]
>> str(tableFE) ### OK!
>> head(tableFE)
>>
>> ##Agregando os resultados
>> aggPestFE <- function(db=tableFE, key="descricao"){
>> lista <- split(db, db[key])
>> result <- lapply(lista, function(x) aggregate(x[,7:8],
>> by=list(x[,3],x[,2],x[,5]), mean))
>> return(result)
>> }
>>
>> ### Devido aos "defaults", obtém mesmos resultados nas três
>> formas que seguem:
>> aggPestFE()[5]
>> aggPestFE(tableFE)[5]
>> aggPestFE(tableFE, "descricao")[5]
>> # $`Lagartas Desfolhadoras`
>> # Group.1 Group.2 Group.3 formiga_area qtd_destruido
>> # 1 GN Chale 26 0 62.5
>> # 2 RD Corrego da Coruja 26 0 50.0
>> # 3 GN Aeroporto II 28 0 75.0
>>
>> ### </code>
>>
>>
>> ================================================
>> Éder Comunello
>> PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)
>> Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)
>> Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]
>>
>>
>>
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> R-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
> forneça código mínimo reproduzível.
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