[R-br] Importação de planilha de contingência

Segunda Fevereiro 15 19:14:07 BRST 2016

Olá Salah,

Tentei da maneira que você me sugeriu, mas infelizmente não deu certo.Recebo as seguintes mensagens de erro:

# Importando o arquivo no formato CSV
Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote,  :  double 'row.names' are not allowed
# Importando o arquivo no formato XLSXError in findPerl(verbose = verbose) :   perl executable not found. Use perl= argument to specify the correct path.Error in file.exists(tfn) : invalid 'file' argument
Att.,
Marie
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Marie-Christine RufenerMestranda em Oceanografia Biológica Laboratório de Estatística Ambiental (LEA)Universidade Federal de Rio Grande (FURG)Tel.: +55 (53)9911-9794~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
From: salah3.1416 em gmail.com
Date: Mon, 15 Feb 2016 17:03:24 -0200
Subject: Re: [R-br] Importação de planilha de contingência

    Olá Marie

    indique que sua primeira coluna é o row.names, caso contrário ele
    irá carregar como uma variável (coluna) e no R colunas sem nome será
    acrescentado o nome default "X" ( se tiveres várias colunas sem
    nome, será: X, X.1, X.2, ...)

    Lembre-se que row.names devem ter nomes únicos(não repetidos).

    segue sugestão:

    ## arquivo no formato CSV

    ## read.csv2 vem como default sep=";" e dec=","

    dados = read.csv2("endereço/nomeArquivo.csv", row.names = 1)

    library(gdata)

    ## arquivo no formato XLSX

    dados = read.xls("endereço/nomeArquivo.xlsx", sheet = 1, row.names =
    1)

    saudações

    Em 15/02/2016 16:15, Marie-Christine .
      escreveu:

      Olá Thiago,

        Desculpa.
          Sou nova aqui neste fórum e não sabia a maneira mais correta
          de expor a minha dúvida.
        Talvez
          eu deva contextualizar, antes de tudo, melhor o caso de uma
          das minhas planilhas.
          Abaixo exponho-lhe parte da minha planilha:

                Abu
                  sp
                Abu
                  vai
                Aca
                  bi

                AS-A-C
                0
                0
                0

                AS-A-D
                1
                0
                0

                AS-B-A
                1
                0
                1

                AS-B-B
                0
                0
                0

                AS-B-C
                0
                0
                0

                AS-B-D
                0
                0
                0

        As
          linhas da primeira coluna correspondem às minhas estações de
          amostragens (AS-A-C, etc). Já a primeira linha da 2 a 3 coluna
          corresponde ao nome das minhas espécies estudadas (Abu sp,
          etc), com suas respectivas abundâncias para cada estação de
          coleta.

          Para importar esta planilha
            eu usei tanto a função read.csv() quanto read.table() e
            read.delim().

          No caso da função read.csv
            usei os argumentos básicos (sep=";" e header=T). A mesma
            coisa fiz báscimanete com o read.table.
            Para função read.delim() eu descobri que, se eu acrescentar
            o argumento check.names=FALSE, eu consigo importar a
            planilha da forma desejada. 
          Isto é, obtenho um
            data.frame na forma de tabela de contingência sem o ''X'' no
            lugar da primeira célula.

          O problema, contudo, é que
            dessa forma o R interpreta minha primeira coluna como sendo
            um fator com 23 níveis. Eu preciso que  as estações também
            sejam interpretadas como um cabecalho. Se, por exemplo, você
            der um View(aravo$spe - exemplo do pacote ade4), observe que
            as estações de coleta constam como cabecalho (as linhas não
            estão enumeradas).
            No meu caso, como o R lê a minha primeira linha como um
            fator, quando dou um View() da minha planilha, minhas linhas
            estão enumeradas e só depois delas é que começa a planilha.

            No caso quando eu uso a função ftable() do pacote stats,
            aparece a seguinte mensagem de erro:

            Error in table(x, exclude
              = exclude) : 
              attempt to make a table
              with >= 2^31 elements

        E
          quando eu uso a função read.xls() do pacote gdata, o seguinte
          erro aparece:

          Error in findPerl(verbose =
            verbose) : 
            perl executable not found.
            Use perl= argument to specify the correct path.
          Error in file.exists(tfn) :
            invalid 'file' argument

        Eu já
          tentei modificar esse argumento "perl", mas de nada adiantou.

        Bom,
          não sei se consegui ser clara o suficiente desta vez. Caso
          não, posso tentar detalhar mais e inclusive te enviar a minha
          planilha para dar uma olhada.

          Desde já muito obrigada pela sua atenção

          Date: Mon, 15 Feb 2016 12:03:25 -0200

          From: thiago.serafim em gmail.com

          To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br

          Subject: Re: [R-br] Importação de planilha de contingência

          Olá Marie.
            É difícil te ajudar se você não fornecer algumas
              informações básicas.

              "Sempre que importo,
                  o R atribui um ''X'' no lugar da primeira célula da
                  minha planilha, aonde, contudo, não deveria constar
                  nada."
              Que função você usou
                  para "importar" o arquivo? Com quais argumentos?
                  Tentou usar outros argumentos? Quais?

              "Já tentei usar a
                  função ftable() e read.xls(), mas não consegui
                  aplicá-las."

              Não conseguiu aplicar
                  porque? O que acontece? Também aparece X na primeira
                  célula? Ocorre um erro? Se sim, qual a mensagem?

              Quais pacotes você
                  está usando? Quando executo read.xls(), recebo a
                  mensagem "Error:
                  could not find function "read.xls""

              Acho que esse é um
                  bom começo.

              Atenciosamente,
              Thiago

            2016-02-15 11:31 GMT-02:00
              Marie-Christine . <machris55 em hotmail.com>:

                      Olá,

                      Estou querendo fazer uma análise RLQ pelo
                        pacote ade4. 
                      Para isso, preciso fazer uso de diversas
                        funções do pacote, tais como dudi.coa(),
                        dudi.hillsmith() e dudi.pca().
                      Para fazer esta análise necessito usar três
                        planilhas diferentes, cada qual está no formato
                        de contingência (vide exemplo do pacote com o
                        banco de dados ''aravo'').
                      Entretanto estou com problemas para importar
                        as minhas planilhas do excel (que já estão no
                        formato de tabela de contingência) e aplicar
                        essas funções em cima delas.
                      Sempre que importo, o R atribui um ''X'' no
                        lugar da primeira célula da minha planilha,
                        aonde, contudo, não deveria constar nada.
                      Já tentei usar a função ftable() e
                        read.xls(), mas não consegui aplicá-las.

                        Alguém teria alguma solução para resolver o meu
                        problema?

                        Att.,

                        Marie

                            Diese
                              E-Mail wurde von einem virenfreien
                              Computer gesendet, der von Avast geschützt
                              wird.

                              www.avast.com

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