[R-br] RES: Modelo Linear Generalizado

Alisson Lucrécio alisson.lucrecio em ifgoiano.edu.br
Terça Outubro 6 00:21:14 BRT 2015


Walmes, obrigado por sua ajuda, esta sendo de grande valia. Você poderia me
ajudar também em como calcular o IC por perfil de verossimilhança para os
tratamentos A e B?

Muito obrigado.

Alisson Lucrecio da Costa

2015-10-05 22:11 GMT-03:00 Alisson Lucrécio <
alisson.lucrecio em ifgoiano.edu.br>:

> Mauro,
>
> A função as.layer esta no pacote latticeExtra. Tive que usar o biocLite
> para instalar o pacote.
>
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("latticeExtra")
>
> Att.,
>
> Alisson
>
>
> 2015-10-05 21:07 GMT-03:00 Mauro Sznelwar <sznelwar em uol.com.br>:
>
>> Não consegui esta função! Eu usei a biblioteca lattice para o xyplot,
>> rodou o primeiro mas este não rodou porque não reconhece o as.layer
>>
>>
>>
>> xyplot(imoveis/(moveis+imoveis)~sqrt(tem), data=db,
>>        jitter.x=TRUE, ylim=c(0, NA))+
>>     as.layer(xyplot(p~sqrt(tem), data=pred, type="l"))
>>
>>
>>
>>
>>
>> O fato de não serem significativos não é problema. Tem que ter em mente
>> que parametrização você usou e as hipóteses decorrentes. Nessa
>> parametrização de estimativas por cela (~trat-1), quando um trat tem
>> estimativa 0, significa que a prob de mobilidade é 0.5. Então esse teste de
>> hipótese, apesar de feito e retornado, não traz nada de interessante na
>> maioria dos casos. Eu considero que os interesses sejam sobre as diferenças
>> entre trat e não se eles tem ou não prob=0.5.
>>
>> Vamos agora aos potenciais problemas. Os níveis A, B, B-12 e B-24 tem
>> probabilidades amostrais nas bordas, ou seja, 0 e 1. Na binomial, o espaço
>> de p é (0, 1), ou seja, não os incluem. No glm, tais valores são obtidos no
>> limite, quando \eta = X\beta vai para -\infty ou \infty, o p aproxima de 0
>> ou 1. Aplique o inverso da função de ligação em -23 e verá que isso é zero.
>> Pelo  sufixo que usou nos tratamentos, isso tem cara avaliação no tempo,
>> com algumas testemunhas (sem sufixo), como é de costume em muitos
>> experimentos. Uma solução, seria ajustar a curva para usando de T-0 à T-12.
>> As testemunhas ficam de fora. Obtenha para elas o IC por perfil de
>> verossimilhança, pois, embora o limite inferir e estimativa sejam 0, o
>> limite superior será algo >0 (inverta o raciocínio para a outra borda).
>>
>> ## Estimativa zero implica em prob=0.5.
>> glm_out$family$linkinv(0)
>> glm_out$family$linkinv(-23)
>>
>> sub_data$tem <- as.numeric(gsub(x=sub_data$tratamento, "\\D", ""))
>>
>> db <- subset(sub_data, !is.na(tem))
>>
>> xyplot(imoveis/(moveis+imoveis)~sqrt(tem), data=db,
>>        jitter.x=TRUE)
>>
>> m0 <- glm(cbind(imoveis, moveis) ~ sqrt(tem),
>>           family=binomial, data=db)
>> summary(m0)
>>
>> pred <- data.frame(tem=seq(0, 24, length.out=30))
>>
>> pred$p <- predict(m0, newdata=pred, type="response")
>>
>> xyplot(imoveis/(moveis+imoveis)~sqrt(tem), data=db,
>>        jitter.x=TRUE, ylim=c(0, NA))+
>>     as.layer(xyplot(p~sqrt(tem), data=pred, type="l"))
>>
>> À disposição.
>>
>> Walmes.
>>
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