[R-br] OFF TOPIC - Criar função no emacs para trocar # por ###
Rafael Tieppo
rafaeltieppo em yahoo.com.br
Quinta Novembro 5 12:35:40 BRST 2015
Prezado, espero colaborar,Favor add no seu '.emacs'
;;-----------------------------------------------------------------------------
;; Define C-y para fazer linha com 3 sinais de #
(global-set-key [?\C-y] (kbd "C-u 0 3 #"))
;;-----------------------------------------------------------------------------
Vc pode trocar o y pelo que for mais conveniente para vc.
obs: adaptado do Walmes
Saudações Rafael Tieppo
State University of Mato Grosso - Department of Agricultural Engineering
site: http://www2.unemat.br/rafaeltieppo blog: https://sistemasagricolas.wordpress.com
"Evite o desperdício: antes de imprimir pense na sua responsabilidade com o ambiente".
On Thursday, November 5, 2015 11:00 AM, "r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Enviar submissões para a lista de discussão R-br para
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1. Re: Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí?
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4. Re: Campanha de crowdfunding envolvendo o R e Bioestatística
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5. OFF TOPIC - Criar função no emacs para trocar # por ###
(Augusto Ribas)
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Message: 1
Date: Wed, 4 Nov 2015 16:31:08 -0200
From: André Figueiras Rutz <rutzaf em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí?
Message-ID:
<CAE7MPajKj=PL_67o9n-m7bh=8NJxENkErQhUpS-h7my1HWyy1Q em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Caro Leonardo,
Acompanhando as perguntas e respostas aprendi coisas interessantes como
referência de início de estudo. Sua vontade em ajudar foi sim bastante
útil. Obrigado pela sua contribuição.
André Rutz
Psicólogo
Em 04/11/2015 11:53, "Leonardo Ferreira Fontenelle" <
leonardof em leonardof.med.br> escreveu:
> Em Ter 3 nov. 2015, às 22:33, andremoreirazoo escreveu:
>
> [...]
>
> Felipe, acho que o caminho é esse mesmo, mas você poderia me ajudar com
> comentários nas linhas dos comandos?
>
> Apesar de gostar de estudar estatística a matemática da coisa não é o
> meu forte. Então, uma ajuda para sabe do que se tratacada
> comando/resultado me faria entender melhor.
>
>
> André,
>
> Partindo do princípio de que você saiba os fundamentos de como usar o R,
> você pode completar seu conhecimento lendo a ajuda para cada comando que
> Felipe usou. Mesmo assim, eu não recomendo que você escreva código assim.
> Como você disse, a parte matemática não é seu forte; se você tiver
> conhecimento suficiente para escrever alguma coisa, ela provavelmente já
> foi escrita. Pior ainda, você pode acabar deixando de usar uma alternativa
> melhor, pois existe mais de uma forma de calcular intervalos de confiança.
>
> Por exemplo, o código que Felipe propões calcula o intervalo de confiança
> da diferença de proporções usando o que se costuma chamar método de Wald.
> Só que o R já dispõe de uma função para calcular o intervalo de confiança
> para a diferença de proporções, que é o prop.test(). Essa função utiliza o
> método dos escores de Wilson, que é uma alternativa superior ao método de
> Wald
> <http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download?doi=10.1.1.408.7107&rep=rep1&type=pdf>,
> especialmente quando a amostra é pequena o suficiente para que isso faça
> alguma diferença.
>
> Repito que existem pacotes como o "PropCIs" e o "binom" com funções que
> provavelmente vão atender às suas necessidades, além dos pacotes de
> epidemiologia.
>
> Se você precisa de ajuda para interpretar as estimativas fornecidas pelo
> R, você precisa de um livro de estatística (ou epidemiologia). Se você
> precisa ajuda para chegar a essas estimativas com o R, a gente pode lhe
> ajudar. Mas, agora me ocorreu, talvez você nem precise do R. Dependendo da
> complexidade das análises que você pretende realizar, você pode usar o
> www.openepi.com.
>
> Espero ter ajudado mais do que confundido :)
>
> Leonardo Ferreira Fontenelle <http://lattes.cnpq.br/9234772336296638>
>
>
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
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Message: 2
Date: Wed, 4 Nov 2015 18:33:28 -0200
From: Felipe <felipe.e.barletta em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí?
Message-ID: <563A6B98.5070403 em gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"
André,
Como o Leonardo disse no e-mail anterior, há pacotes que já calculam
medidas como diferença de proporção OR, seus respectivos IC e outras
medidas que podem atender suas necessidades no seu estudo.
Além dos pacotes que ele já sugeriu, outro que pode consultar é o epiR:
https://cran.r-project.org/web/packages/epiR/epiR.pdf
Outra sugestão de leitura que gostaria de é o material da professora
Silvia Shimakura:
http://leg.ufpr.br/~silvia/CE008/
http://leg.ufpr.br/~silvia/CE001/node68.html
Veja qual forma se apresenta mais interessante para seu aprendizado, mas
quando escrevo as funções no R como calculadora, acredito que os
exemplos se tornam mais didáticos mesmo que já implementados em alguns
pacotes do R.
E como solicitou segue alguns comentários acerca dos comandos que enviei
anteriormente:
## Carregando os dados da tabela que enviou no e-mail
dados<-matrix(c(250,15,34,14),ncol=2,byrow=T)
## Verificando a existência de associação entre os parasitas através da
Estatística Qui-quadrado
## Quando utilizamos o teste o argumento sim=500, há um alerta pois há
casela com frequência logo um pressuposto de validade do teste não foi
atendido.
## Uma alternativa então é calcular o p-valor através de simulação ou o
teste exato de Fisher. Note que quando simulamos o p-valor não é
necessário usar a correção de continuidade de Yates.
Q<-chisq.test(dados,sim=500)
Q
Q$observed ### frequência observada
Q$expected ### frequência esperada
##Há evidências de se rejeitar H0
# Comandos para obtenção da diferença entre proporções e seu IC(95%)
## Calculando as proporções entre Cryptosporidium negativo e
Cryptosporidium positivo
p11<-(dados[1,1]/(sum(dados[1,])))
p22<-(dados[1,1]/(sum(dados[1,])))
d<-p11-p21 # diferença entre as proporções
vd<-((p11*(1-p11))/(sum(dados[1,])-1)) +
((p21*(1-p21))/(sum(dados[2,])-1)) ## Estimativa para a variância
dvd<-sqrt(vd) ## raíz quadrada da variância
z<-qnorm(0.975) #percentil da Normal padrão
li<- d - (z*dvd) # Limite inferior
ls<- d + (z*dvd) # Limite superior
cbind(d,li,ls) # Intervalo de Confiança de 95%. Como o valor zero não
está contido no IC a diferença é significativa ao nível de 95% de confiança.
##Razão de Chances ou Odds Ratio (OR) e IC95%(OR)
OR<-(dados[1,1]*dados[2,2])/(dados[1,2]*dados[2,1]) ## Calculando a
/*odds ratio (n11*n22/n12*n21)
*/## Quando OR=1 indica chances iguais. Se for OR>1, o grupo 1 apresenta
maior chance que o grupo 2.
## Para o cálculo do IC para a OR, usamos o logaritmo da OR na base /e./
vf<-(1/dados[1,1])+(1/dados[1,2])+(1/dados[2,1]+(1/dados[2,2]))
##Estimativa para variância
dpf<-sqrt(vf) ## raíz quadrada da variância
z<-qnorm(0.975) #Percentil da Normal padrão
liOR<-exp(log(OR)-z*dpf) #Limite inferior
lsOR<-exp(log(OR)+z*dpf) # Limite Superior
cbind(OR,liOR,lsOR)
## A chance de não haver Cryptosporidium e Giardia é 6,8 vezes maior que
a presença podendo variar entre 3 e 15,4 vezes ao nível de confiança de 95%.
--
Atenciosamente
Felipe E. Barletta Mendes
Estatístico - Conre3 9766-A
+55 (41)-92077191
+55 (41)-33287216
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Message: 3
Date: Wed, 4 Nov 2015 18:17:27 -0300
From: Marcos Vital <marcosvital em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] quem é o autor de tanks.R ???
Message-ID:
<CAKLUGQ_d+SyHWigkh=byZMer0+=jiDdYyJt1WQB8Aczc1dLncQ em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Olá, Rodrigo.
Fiz uma postagem falando da sua função, e mencionando alguns outros
joguinhos no R.
Está aqui, caso queira dar uma olhada:
https://cantinhodor.wordpress.com/2015/10/25/tiros-explosoes-e-destruicao-a-grandiosa-batalha-dos-tanques-de-guerra-no-r/
Abraços!
--
Marcos Vinícius Carneiro Vital
Universidade Federal de Alagoas
Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde
Setor de Biodiversidade e Ecologia
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Message: 4
Date: Wed, 4 Nov 2015 18:20:38 -0300
From: Marcos Vital <marcosvital em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Campanha de crowdfunding envolvendo o R e
Bioestatística
Message-ID:
<CAKLUGQ9W5A2kT0jqZexPAu4u=nOTpuBgHknAVqUhLDjarnubEQ em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Oi, pessoal
Estou passando só para divulgar nossa campanha de financiamento uma última
vez, pois estamos a uma semana do final.
Relembrando: estamos usando uma campanha de financiamento coletivo para
equipar o nosso laboratório e produzir material didático sobre diversos
assuntos, incluindo um bocado de Bioestatística e suas aplicações no R.
A campanha está aqui, para quem se interessar:
http://www.kickante.com.br/campanhas/ciencia-livre-ecologia-e-bioestatistica-para-todos-0
Abraços!
--
Marcos Vinícius Carneiro Vital
Universidade Federal de Alagoas
Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde
Setor de Biodiversidade e Ecologia
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Message: 5
Date: Thu, 5 Nov 2015 10:38:13 -0300
From: Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com>
To: R-br Lista <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] OFF TOPIC - Criar função no emacs para trocar # por
###
Message-ID:
<CACMkfRwN6HdTp_912PKHpLWYzJjLCaL+zAxkffuu9y26VTWGHQ em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Ola a todos.
Bem eu tenho usado o emacs como ide para o R, mas sempre tive alguns
problemas com identação. Pelo que entendo, no emacs, ele le comentário como
três #, tipo ###.
Mais ou menos esse problema, mas com hashtag
http://stackoverflow.com/questions/26312317/wrong-indentation-of-comments-in-emacs
Assim quando eu ponho o comentário como um #, se dou um enter logo a frente
desse #, o emacs identa e joga la pra frente.
Pesquisando no google, eu achei gente reclamando da mesma coisa, e a
solução que vi foi desligar a identação automática, o que é ruim, porque é
legal o código identado bonitinho.
Dai eu pensei, se teria como fazer uma função e deixar no .emacs , para que
o emacs pega-se toda hora que eu digita-se #, ele transformasse em ###,
porque ### funciona perfeito, mas é chato digitar três ###.
Ai estou lendo esse tutorial
https://www.masteringemacs.org/article/mastering-key-bindings-emacs
E vendo que da para alterar o key-map do teclado, se entendi bem, e trocar
teclas para outras funções, mas não estou conseguindo implementar isso pra
deixar no .emacs para quando iniciar o emacs, toda hora que eu digitar #,
na tela vira três ###
Será que alguém poderia dar uma luz aqui?
--
Grato
Augusto C. A. Ribas
Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org>
Github: https://github.com/Squiercg
Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056
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Subject: Legenda do Digest
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Fim da Digest R-br, volume 59, assunto 5
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