[R-br] Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí?

[Leonardo Ferreira Fontenelle]

André,

Parabéns por não se conformar com o qui-quadrado. Há um bom tempo o
valor p não é suficiente numa publicação biomédica, e você está certo em
procurar extrair mais informação de seus dados. Do ponto de vista
estatístico, a razão de chances (*odds ratio*) se ajusta melhor para
dados dessa natureza, mas a razão de prevalência (razão de proporções) e
a diferença de proporções podem ser mais interpretáveis.

O pacote PropCIs e, provavelmente, um ou mais pacotes voltados para a
epidemiologia incluem funções para tudo isso; além do prop.diff(), que
já vem de fábrica. (Alternativamente, você poderia transformar essa
tabela num data frame com duas variáveis dicotômicas (crytposporidium e
giardia), e gerar as medidas de associação através de regressão linear
generalizada (função glm()).)

Mas, pelo que entendi, sua primeira dificuldade é conceitual. Se os
livros de estatística ao seu alcance não o ajudarem, recomendo abrir
um livro de epidemiologia, especialmente nos capítulos sobre medidas
de ocorrência (aparentemente, prevalência) e as medidas de
associação cabíveis.

Dependendo dos objetivos de sua investigação, você pode estar
interessado em uma medida de associação entre criptospídeos e giárdias
ajustada para os fatores citados (período climático, etc.). Para isso,
vai precisar ler sobre análise estratificada (ou, alternativamente,
regressão múltipla). Alguns livros de epidemiologia tratam bem o
suficiente disso, mas acho ser mais provável que você encontre uma boa
explicação num livro de estatística.

Espero ter ajudado!

Att,

Leonardo Ferreira Fontenelle[1]


Em Ter 3 nov. 2015, às 16:19, André Lucas de Oliveira Moreira escreveu:
> Prezados membros da lista R-br,
>
> Solicito a ajuda de vocês para resolver o seguinte problema:
>
> Tenho duas espécies de parasitas e alguns fatores que podem estar
> associados a incidência deles, como o período climático e a própria
> presença de um dos parasitas. Então executei o qui-quadrado para os
> seguintes dados:
>


> Giardia negativa


> Giardia positiva


> Cryptosporidium negativo


> 79,9% (250/313)


> 4,8% (15/313)


> Cryptosporidium positivo


> 10,9% (34/313)


> 4,5% (14/313)


>
> O resultado do chi-quadrado é siginificativo, mas como
> interpretar/extrair mais informações além do fato de os fatores
> estarem associados? O teste fala que há associação, mas apenas 4,5%
> das amostras continham os dois parasitas ao mesmo tempo. Pesquisei
> bastante sobre isso e o que achei foi algo muito sucinto sobre odds
> ratio, mas não entendi, nem saberia fazer no R.
>
> Agradecido, André
>
> --
>
> *MSc. André Lucas de O. Moreira*
> http://lattes.cnpq.br/7258065668864153
> http://www.wikiaves.com.br/perfil_andrelukinhas 79 8837-3562 79
> 9132-9093
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