[R-br] Ler arquivo .zip

Jônatan jdtatsch em gmail.com
Sexta Abril 10 12:53:18 BRT 2015


Eu sugiro dar uma olhada em ?getData do pacote raster.



url2<-"
ftp://ftp.glcf.umd.edu/glcf/SRTM/media/GLCF.TSM.B3-010.00.Finished_B-01sec-Degree-United_States/Degree_Tiles/n000/SRTM_fB01_n000w177/SRTM_fB01_n000w177.tif.gz
"

# file2<-'SRTM_fB01_n000w177'##Tamanho do arquivo: 66k
file2 <- basename(url2)

#
utils::download.file(url2,destfile=paste(file2,".zip",sep=""),mode='b',method='wget')
utils::download.file(url2, destfile = file2, mode='b', method='wget')

#r2<-raster::raster(unzip(paste(file2,".zip",sep=""),paste(file2,".tif",sep="")))
## unzip: Extract files from or list a *zip archive*.

## alternativa com gunzip
cmd <- paste("gunzip", file2)
system(cmd)
r2 <- raster::raster(gsub("\\.gz", "", file2))


2015-04-10 11:05 GMT-03:00 Luciano F. Sgarbi <luciano.f.sgarbi em gmail.com>:

> Bom dia pessoal.
>
> Gostaria de saber se algum de vocês tem a solução para o seguinte problema:
>
> Estou baixando uns arquivos raster (pelo R) e gostaria de salva-los em uma
> pasta para posteriormente usá-los.
>
> O problema é que para um formato de arquivo e site eu estou conseguindo
> (Exemplo 1 no código abaixo), entretanto, para o outro conjunto eu não
> consigo ler os arquivos de jeito nenhum.
>
> Qualquer ajuda sera super bem vinda..
>
> ###
>
> ##Inicio: Exemplo 1
> require(raster)
> url1<-"ftp://srtm.csi.cgiar.org/SRTM_v41/SRTM_Data_ArcASCII/srtm_03_08.zip
> "
> file1<-'srtm_03_08'##Tamanho do arquivo: 395k
>
> utils::download.file(url1,destfile=paste(file1,".zip",sep=""),mode='b',method='wget')
>
> r1<-raster::raster(unzip(paste(file1,".zip",sep=""),paste(file1,".asc",sep="")))
> r1
> ##Fim: Exemplo 1
>
> ##Aqui está o problema
> ##Tentativa 1
> url2<-"
> ftp://ftp.glcf.umd.edu/glcf/SRTM/media/GLCF.TSM.B3-010.00.Finished_B-01sec-Degree-United_States/Degree_Tiles/n000/SRTM_fB01_n000w177/SRTM_fB01_n000w177.tif.gz
> "
> file2<-'SRTM_fB01_n000w177'##Tamanho do arquivo: 66k
>
> utils::download.file(url2,destfile=paste(file2,".zip",sep=""),mode='b',method='wget')
>
> r2<-raster::raster(unzip(paste(file2,".zip",sep=""),paste(file2,".tif",sep="")))
> zip.file.extract(paste(file2,".zip",sep=""),paste(file2,".tif",sep=""))
>
> ##Tentativa 2
> temp<-tempfile()
> utils::download.file(url2,destfile=temp,mode='b',method='wget')
> raster::raster(temp)
> raster(paste(temp,'/',file2,".tif",sep=""))
>
> ###Informações do OS
>
>                             sysname
> release
>                              "Linux"
>  "3.2.0-39-generic-pae"
>                                       version
>          nodename
> "#62-Ubuntu SMP Wed Feb 27 22:25:11 UTC 2013"
>              "aa"
>                                       machine
>             login
>                                        "i686"
>         "unknown"
>                                          user
>    effective_user
>                                          "aa"
>              "aa"
>
> > sessionInfo()
> R version 3.1.3 (2015-03-09)
> Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit)
> Running under: Ubuntu precise (12.04.5 LTS)
>
> locale:
>  [1] LC_CTYPE=pt_BR.UTF-8       LC_NUMERIC=C
> LC_TIME=pt_BR.UTF-8        LC_COLLATE=pt_BR.UTF-8
>  [5] LC_MONETARY=pt_BR.UTF-8    LC_MESSAGES=pt_BR.UTF-8
>  LC_PAPER=pt_BR.UTF-8       LC_NAME=C
>  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C
> LC_MEASUREMENT=pt_BR.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
>
> attached base packages:
> [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base
>
> other attached packages:
> [1] RCurl_1.95-4.1 bitops_1.0-6   rgdal_0.9-2    raster_2.2-31  sp_1.0-15
>      downloader_0.3
>
> loaded via a namespace (and not attached):
> [1] digest_0.6.4    grid_3.1.3      lattice_0.20-30 tools_3.1.3
>
>
> --
>
> *Luciano F. Sgarbi*
> * Currículo Lattes <http://lattes.cnpq.br/9788198135883354>*
>
> *Laboratório de Ecologia Teórica e Síntese**Departamento de
> Ecologia, Instituto de Ciências Biológicas V.*
> *Universidade Federal de Goiás, campus II, Goiânia-GO, Brasil*
>
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##  Jônatan Dupont Tatsch
##  Professor do Departamento de Física
##  Centro de Ciências Exatas e Naturais (CCNE)
##  Universidade Federal de Santa Maria
##  Faixa de Camobi, Prédio 13 - Campus UFSM - Santa Maria, RS, Brasil -
97105-900
##  Telefone: +55(55)33012083
##  www.ufsm.br/meteorologia
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