[R-br] grafico de efeitos espaciais - est. espacial
Edson Ferreira
edsonlontra em yahoo.com.br
Sábado Novembro 22 19:07:04 BRST 2014
Paz e Bem !!
estou com o seguinte codigo, para modelos CAR com dados de contagem (Poisson)
e gostaria de plotar no grid criado um grafico em tom de cinzacom os efeitos espaciais e um outro com a média de cada regiãonão estou conseguindo.neste modelo qual a saída q mostra o valor estimado pro rho.?desde ja obrigado
############################ CARBayes Leroux vs CAR #######################################
#####################################################################
rm(list=ls())
require(spatstat)
require(lattice)
require(MASS)
require(coda)
require (MCMCpack)
require(plotrix)
require(CARBayes)
########## simulação
x.easting= 1:10
x.northing <- 1:10
Grid <- expand.grid(x.easting, x.northing)
n <- nrow(Grid)
distance <-array(0, c(n,n))
W <-array(0, c(n,n))
for(i in 1:n)
{
for(j in 1:n)
{
temp <- (Grid[i,1] - Grid[j,1])^2 + (Grid[i,2] - Grid[j,2])^2
distance[i,j] <- sqrt(temp)
if(temp==1) W[i,j] <- 1
}
}
x1= rnorm(n) # variavel 1
x2= rnorm(n) # variavel 2
E= rep(50,n) # valor esperado para cada regiao
theta= rnorm(n, sd=0.05) #
phi <- mvrnorm(n=1, mu=rep(0,n), Sigma=0.4 * exp(-0.1 * distance))
risk <- exp(-0.2 + 0.1 * x1 + 0.1*x2 + theta + phi)
fitted <- E * risk
Y <- rpois(n=n, lambda=fitted)
formula <- Y ~ x1 + x2 + offset(log(E))
model <- poisson.lerouxCAR(formula=formula, W=W, burnin=50, n.sample=1000)
model$formula
model$samples
model$fitted.values
model$random.effects
model$residuals
model$W.summary
model$DIC
model$p.d
model$summary.results
model$model
model$accept
AttEdson
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