[R-br] Problemas lendo .dbf no R
Augusto Ribas
ribas.aca em gmail.com
Quinta Novembro 13 11:53:21 BRST 2014
Opa, talvez você possa tentar o seguinte:
Um exemplo, suponto que vc tenha 20 arquivos:
Quando voce da arquivos <- list.files(pattern="\\.dbf$"), você gostaria de
ver algo como isso que fiz no vetor1 certo?
> vetor1<-paste("corte_estrada_aneis",1:20,".dbf",sep="")
> vetor1
[1] "corte_estrada_aneis1.dbf" "corte_estrada_aneis2.dbf"
"corte_estrada_aneis3.dbf"
[4] "corte_estrada_aneis4.dbf" "corte_estrada_aneis5.dbf"
"corte_estrada_aneis6.dbf"
[7] "corte_estrada_aneis7.dbf" "corte_estrada_aneis8.dbf"
"corte_estrada_aneis9.dbf"
[10] "corte_estrada_aneis10.dbf" "corte_estrada_aneis11.dbf"
"corte_estrada_aneis12.dbf"
[13] "corte_estrada_aneis13.dbf" "corte_estrada_aneis14.dbf"
"corte_estrada_aneis15.dbf"
[16] "corte_estrada_aneis16.dbf" "corte_estrada_aneis17.dbf"
"corte_estrada_aneis18.dbf"
[19] "corte_estrada_aneis19.dbf" "corte_estrada_aneis20.dbf"
Mas o que você ve na verdade é o que está no vetor 2, certo, porque ta tudo
na ordem lexicografia,(Essa palavra é bonita né? Nem sei se escrevi certo,
desculpa)
> vetor2<-sort(vetor1)
> vetor2
[1] "corte_estrada_aneis10.dbf" "corte_estrada_aneis11.dbf"
"corte_estrada_aneis12.dbf"
[4] "corte_estrada_aneis13.dbf" "corte_estrada_aneis14.dbf"
"corte_estrada_aneis15.dbf"
[7] "corte_estrada_aneis16.dbf" "corte_estrada_aneis17.dbf"
"corte_estrada_aneis18.dbf"
[10] "corte_estrada_aneis19.dbf" "corte_estrada_aneis1.dbf"
"corte_estrada_aneis20.dbf"
[13] "corte_estrada_aneis2.dbf" "corte_estrada_aneis3.dbf"
"corte_estrada_aneis4.dbf"
[16] "corte_estrada_aneis5.dbf" "corte_estrada_aneis6.dbf"
"corte_estrada_aneis7.dbf"
[19] "corte_estrada_aneis8.dbf" "corte_estrada_aneis9.dbf"
Mas beleza, você ta vendo o vetor 2 na saida do arquivos <-
list.files(pattern="\\.dbf$"), quando da arquivos.
Uma possibilidade seria reordenar o seu arquivos, antes de fazer a leitura,
da seguinte formula.
Crie um vetor de numeros, usando uma expressão regular para pegar somente
os números, das string do arquivo, depois transforme em numero pro R
entender:
> numeros<-as.numeric(gsub("[a-z_.]", "\\1", vetor2))
> numeros
[1] 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 1 20 2 3 4 5 6 7 8 9
> vetor2
[1] "corte_estrada_aneis10.dbf" "corte_estrada_aneis11.dbf"
"corte_estrada_aneis12.dbf"
[4] "corte_estrada_aneis13.dbf" "corte_estrada_aneis14.dbf"
"corte_estrada_aneis15.dbf"
[7] "corte_estrada_aneis16.dbf" "corte_estrada_aneis17.dbf"
"corte_estrada_aneis18.dbf"
[10] "corte_estrada_aneis19.dbf" "corte_estrada_aneis1.dbf"
"corte_estrada_aneis20.dbf"
[13] "corte_estrada_aneis2.dbf" "corte_estrada_aneis3.dbf"
"corte_estrada_aneis4.dbf"
[16] "corte_estrada_aneis5.dbf" "corte_estrada_aneis6.dbf"
"corte_estrada_aneis7.dbf"
[19] "corte_estrada_aneis8.dbf" "corte_estrada_aneis9.dbf"
Veja que a numeração ta na ordem dos arquivos, agora ordene pelos numeros
usando order, que ele vai te dar a ordem que você quer pros indices.
> order(numeros)
[1] 11 13 14 15 16 17 18 19 20 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 12
> numeros[order(numeros)]
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Agora você aplica a ordem dos numeros no seu arquivos, que você pegou o ls
do diretorio.
> vetor2[order(numeros)]
[1] "corte_estrada_aneis1.dbf" "corte_estrada_aneis2.dbf"
"corte_estrada_aneis3.dbf"
[4] "corte_estrada_aneis4.dbf" "corte_estrada_aneis5.dbf"
"corte_estrada_aneis6.dbf"
[7] "corte_estrada_aneis7.dbf" "corte_estrada_aneis8.dbf"
"corte_estrada_aneis9.dbf"
[10] "corte_estrada_aneis10.dbf" "corte_estrada_aneis11.dbf"
"corte_estrada_aneis12.dbf"
[13] "corte_estrada_aneis13.dbf" "corte_estrada_aneis14.dbf"
"corte_estrada_aneis15.dbf"
[16] "corte_estrada_aneis16.dbf" "corte_estrada_aneis17.dbf"
"corte_estrada_aneis18.dbf"
[19] "corte_estrada_aneis19.dbf" "corte_estrada_aneis20.dbf"
>
Ai você le tudo usando essa ordem
for (nome_arquivo in arquivos){
g[i] <- read.dbf(paste("I:/qgis_1/exercicio_buffer_L1/testes/teste_1/",
nome_arquivo,sep=""))
}
Eu acho que isso deve funcionar.
Bem espero ter mais ajudado que atrabalhado :)
Em 12 de novembro de 2014 03:08, Paulo Pimenta <paulopimenta6 em hotmail.com>
escreveu:
> Prezados,
>
> Estou com um problema ao ler arquivos .dbf no R. Abaixo segue a lógica que
> usei em meu código para fazer a leitura:
>
>
> ##########################################################################################
>
>
>
> ###########################################################################################
> ##comando para ler um arquivo ".dbf"
>
> ##
> ##
>
> ##
> ##library("foreign")
>
> ##
> ##
>
> ##
> ##read.dbf("I:/qgis_1/exercicio_buffer_L1/testes/teste_1/corte_estrada_aneis.dbf")
> ##
> ##
>
> ##
>
> ###########################################################################################
> ##
> ##Salvando tudo em forma de lista
>
> library("foreign")
>
> setwd("I:/qgis_1/exercicio_buffer_L1/testes/teste_1")
>
> arquivos <- list.files(pattern="\\.dbf$")
>
> x <- lapply(arquivos, read.dbf)
>
> ##Exportando os comprimentos de cada estrada cortada por um anel
>
> for (i in 1:91){
>
> y[[i]] <- x[[i]]
> vector_length[i] <- sum(y[[i]][,2])
>
> }
>
>
> ##########################################################################################
>
> Assim como mostrado no exemplo acima estou lendo um arquivo chamado "corte_estrada_aneis.dbf",
> todavia possui um banco com 91 desses arquivos numerados de forma que seus
> nomes ficam, por exemplo: corte_estrada_aneis.1dbf,
> corte_estrada_aneis2.dbf, corte_estrada_aneis3.dbf, ... até finalmente corte_estrada_aneis91.dbf.
> O problema na leitura dos .dbf consiste que a lógica acima usada por mim
> faz com que a ordenação saia errada, ou seja, ele faz a leitura dos
> arquivos corte_estrada_aneis1.dbf, corte_estrada_aneis12.dbf, corte_estrada_aneis13.dbf
> e assim por diante. Uma tentativa minha, porém não muito bem sucedida foi a
> seguinte:
>
>
> #########################################################################################
>
> library("foreign")
>
> for (i in 1:9){
>
> g[i] <-
> read.dbf("I:/qgis_1/exercicio_buffer_L1/testes/teste_1/corte_estrada_aneis[i].dbf")
>
> }
>
> g
>
>
> #########################################################################################
>
> Mas como tudo esta contido em " " o índice [i] será lido literalmente.
> Peço ajuda aos colegas para poder solucinar este problema, seja com a minha
> lógica ou com alguma idéia diferente.
>
> Abraços a todos!
>
> Paulo Henrique de A. S. Pimenta.
>
> Graduando em Meteorologia (Bacharelado) - IAG/USP.
> Fone: +5511981318435.
>
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Grato
Augusto C. A. Ribas
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