[R-br] Digest R-br, volume 41, assunto 31
Edson Lira
edinhoestat em yahoo.com.br
Sexta Maio 30 11:56:54 BRT 2014
Veja se ajuda.
??kappa
require(epiR)
Exemplo
## Kidney samples from 291 salmon were split with one half of the
## samples sent to each of two laboratories where an IFAT test
## was run on each sample. The following results were obtained:
## Lab 1 positive, lab 2 positive: 19
## Lab 1 negative, lab 2 positive: 6
## Lab 1 positive, lab 2 negative: 10
## Lab 1 negative, lab 2 negative: 256
dat <- as.table(matrix(c(19,6,10,256), nrow = 2, byrow = TRUE))
colnames(dat) <- c("L1-pos","L1-neg")
rownames(dat) <- c("L2-pos","L2-neg")
dat
epi.kappa(dat, method = "fleiss", alternative = "greater", conf.level = 0.95)
[ ]'s.
Edson Lira
Estatístico
Manaus-Amazonas
Em Sexta-feira, 30 de Maio de 2014 10:43, Diogo Caribe de Sousa <dogosousa em yahoo.com.br> escreveu:
Caros,
Estou precisando fazer o índice de Kappa, mas não estou conseguindo. Tenho dois vetores, com o nome das classes do modelo e da realidade de campo. Os vetores são do tipo string. Alguém tem alguma sugestão?
Abraços
Em Sexta-feira, 30 de Maio de 2014 8:45, "r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Enviar submissões para a lista de discussão R-br para
r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou
corpo da mensagem para
r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br
Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo
endereço
r-br-owner em listas.c3sl.ufpr.br
Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será
mais específica que "Re: Contents of R-br
digest..."
Tópicos de Hoje:
1. Re: IDW (Éder Comunello)
2. Link para elaboração de mapas (Edson Lira)
3. Re: Manual de uso do R (Edson Lira)
4. Re: Bibliografia (David Feitosa)
5. correlação robusta em dados longitudinais
(Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil)
6. Re: IDW (Elias T. Krainski)
7. Re: Bibliografia (Elias T. Krainski)
8. Re: Manual de uso do R (Elton Gean Araújo Araújo)
9. Re: Manual de uso do R (claudia christina sobrinho do nascimento)
10. Re: Fwd: Representação de gráfico tipo torta em um shapefile
(ASANTOS)
11. RES: Link para elaboração de mapas (Mauro Sznelwar)
12. INLA short course with Elias (Paulo Justiniano)
13. Re: sos (Edson
Lira)
----------------------------------------------------------------------
Message: 1
Date: Thu, 29 May 2014 11:16:47 -0400
From: Éder Comunello <comunello.eder em gmail.com>
To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] IDW
Message-ID:
<CABmC8gnR7Z_qU1Ccv_xbY2TtWDb14WRtjwTULVqkbGZfbf=V5g em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Elias, bom dia!
Reconheço o mérito das suas colocações, só complementei!
Aproveitando a deixa... A exemplo do material do Jackson Aquino,
mantenho
também para consulta um material seu, "Introdução à análise de dados
espacialmente referenciados". Tenho aqui uma versão de 2012. Tens alguma
edição mais atual ou intenção de transformar esse material em livro?
Grato,
Éder Comunello <c <comunello.eder em gmail.com>omunello.eder em gmail.com>
Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]
Em 29 de maio de 2014 07:18, Elias T. Krainski <eliaskrainski em yahoo.com.br>
escreveu:
> humilhou... :)
>
>
> On 29/05/14 12:36, Éder Comunello wrote:
>
> Hélio, bom dia!
>
> Faz sentido interpolar? Acredito que sim, partindo
do princípio que a
> dependência espacial pode existir, mas seu método não permitiu detectá-la.
> Acredito que a causa mais comum seja o esquema de amostragem utilizado,
> sobretudo no que se refere à distância entre amostras. No caso particular,
> você conseguiu modelar em algumas áreas e não em outras, dando margem à
> essa interpretação.
>
> O colega Elias já postou uma solução, mas acrescento o código abaixo,
> caso ainda tenha interesse em utilizar o {gstat}.
>
> Em termos gerais, a ideia de operação no {gstat} é similar a do {geoR},
> no sentido em que você vai precisar criar um grid pra receber o resultado
> da interpolação. O espaçamento da grade será a resolução da interpolação. O
> ponto principal é que tem que trabalhar com objetos da classe 'sp'.
>
> Verifique os parâmetros número de vizinhos (nmax) e
peso/potência da
> distância (idp). No {gstat} por default utilizam-se todos os pontos e o
> idp=2.
>
> Atte.,
>
> ### <code r>
> sapply(c("gstat", "sp", "geoR", "RColorBrewer"), require, character.only=T)
>
> data(parana); names(parana)
> hist(parana$data, col=3)
> points(parana, pt.divide='quart')
>
> ### Criar objeto 'sp'
> pr <- data.frame(x=parana$coords[,1], y=parana$coords[,2],
> chuva=parana$data)
> names(pr); coordinates(pr) <- ~x+y
> class(pr)
> plot(pr, asp=1, axes=T, pch=20); polygon(parana$borders, border=2)
>
> ### Criar 'grid'
> bbox(pr)
> lim <- round(bbox(pr)+c(-1,-1, 1, 1)*50); lim ### amplia a área do bbox
> grid <- expand.grid(x=seq(lim[1,1],lim[1,2], by=10),
> y=seq(lim[2,1],lim[2,2], by=10))
> grid ->
grid.pt
> gridded(grid) = ~x+y ### SpatialPixels
> coordinates(grid.pt) = ~x+y ### SpatialPoints
>
> ### IDW Default
> idw <- idw(pr$chuva~1, pr, grid)
> idw.pt <- idw(chuva~1, pr, grid.pt)
>
> ### Visualização
> spplot(idw, "var1.pred", main = "IDW Default")
> spplot(idw.pt, "var1.pred", main = "IDW default - Mapa Pontuado")
> image(idw); polygon(parana$borders); points(pr)
>
> ### Variando parâmetros
> idw.data <- data.frame(
> default = idw(chuva ~ 1, pr, grid)$var1.pred, ### nmax=todos &
> idp=2
> idw6 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, nmax=6)$var1.pred,
> idw9 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, nmax=9)$var1.pred,
>
idp1 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 1)$var1.pred,
> idp4 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 4)$var1.pred,
> idp8 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 8)$var1.pred)
>
> grid.data <- SpatialPixelsDataFrame(grid, idw.data)
> dput(names(grid.data))
>
> spplot(grid.data, c("default", "idw6", "idw9", "idp1", "idp4", "idp8"),
> main = "IDW", col.regions=rainbow(16)
> # idp: numeric; specify the inverse distance weighting power
> # nmax: the number of nearest observations that should be used
> ### </code>
>
>
>
>
> Éder Comunello <c <comunello.eder em gmail.com>omunello.eder em gmail.com>
> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]
>
>
>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing listR-br em listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
-------------- Próxima Parte ----------
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URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/798804be/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 2
Date: Thu, 29 May 2014 08:25:27 -0700 (PDT)
From: Edson Lira <edinhoestat em yahoo.com.br>
To: R-br Lista <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject:
[R-br] Link para elaboração de mapas
Message-ID:
<1401377127.34381.YahooMailNeo em web160105.mail.bf1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Eder, Mauro e caros amigos da lista, encontrei um material para elaboração de mapas com o R que achei muito bom, abaixo o link.
http://www.social-statistics.org/?p=764
[ ]'s
Edson Lira
Estatístico
Manaus-Amazonas
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/8ec70cd2/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 3
Date: Thu, 29 May 2014 08:27:41 -0700 (PDT)
From: Edson Lira <edinhoestat em yahoo.com.br>
To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>, Alan
Rodrigo Panosso <arpanosso em yahoo.com.br>
Subject: Re: [R-br] Manual de uso do R
Message-ID:
<1401377261.20167.YahooMailNeo em web160104.mail.bf1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Concordo com a opinião dos colegas, o livro é muito bom mesmo. Com certeza irá estimular muitos alunos a iniciarem-se no uso do R.
Parabens Jackson!!!
[ ]'s.
Edson Lira
Estatístico
Manaus-Amazonas
Em Quinta-feira, 29 de Maio de 2014 10:37, David Feitosa <contato em davidfeitosa.com> escreveu:
Eu já li a obra em pdf.
Muito boa mesmo, principalmente para quem não é da área de desenvolvimento.
Atenciosamente,
David Feitosa
(\_(\
(=°;°)
(("")("")
Em 29 de maio de 2014 11:14, Alan Rodrigo Panosso <arpanosso em yahoo.com.br> escreveu:
Fantástico! Parabéns!!!!
>
>Alan Rodrigo Panosso
>----------------------------------------------------------------------------
>Departamento de Matemática -
>Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira - FEIS - UNESP
>Alameda Rio de Janeiro, 266
>15 385 - 000 - Ilha Solteira - SP.-Brasil
>E_mail: alanrp em mat.feis.unesp.br ou
>arpanosso em yahoo.com.br
>Tel.: (18) 3743-1968
>
>
>
>
>Em Quinta-feira, 29 de Maio de 2014 6:08, Rodrigo Muniz <uenf.rodrigo em gmail.com> escreveu:
>
>
>
>
>Parabens, Jakson, tanto pela iniciativa quanto pela qualidade do material, vi que embora seja voltada para analise de dados sociais poderei utilizar em minhas análises pela didática apresentada e pela programação.
>Mais uma vez parabéns...
>Att...
>
>
>
>2014-05-29 9:23 GMT-03:00 Jakson Alves de Aquino <jalvesaq em gmail.com>:
>
>On 29-05-2014 07:49, Éder Comunello wrote:
>>> Já utilizo seu material há um bom tempo e pela qualidade e utilidade do
>>> mesmo, já esperava que saísse na forma de livro. Parabéns!
>>
>>Obrigado a você e a todos os outros da lista que fizeram comentários!
>>
>>
>>> Sou do tempo antigo :D, e gostaria de saber se também vai ter versão
>>> impressa. Caso sim, gentileza
informar como adquirir.
>>
>>Não há nenhuma previsão de produção de versão impressa. Acho que não
>>haverá, mas, se houver, anunciarei aqui.
>>
>>--
>>Jakson
>>
>>_______________________________________________
>>R-br mailing list
>>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>>
>
>
>
>--
>
>Rodrigo A. Muniz
>Eng. Agrônomo. Ms Produção Vegetal (UENF)
>Doutorando em Engenharia de Sistemas Agrícolas
(ESALQ/USP)
>E-mail - muniz.ra em usp.br
>Cel (19) 98300-4333 (Pessoal)
>
>
>
>_______________________________________________
>R-br mailing list
>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>_______________________________________________
>R-br mailing list
>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
_______________________________________________
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------------------------------
Message: 4
Date: Thu, 29 May 2014 12:27:39 -0300
From: David Feitosa <contato em davidfeitosa.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Bibliografia
Message-ID:
<CAL1rLtoZTdqbfwvuV0u9vL4vz8=SKxbKBYRvqmXPzTDBF_SPbA em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Marcus,
Sou formado em Ciências da Computação.
Eu tentei
alguns livros sobre o assunto, mas achei a linguagem muito
"pesada".
Darei uma olhada na sua sugestão. Obrigado! [?]
Atenciosamente,
David Feitosa
(\_(\
(=°;°)
(("")("")
Em 29 de maio de 2014 11:56, Marcus Nunes <marcus.nunes em gmail.com> escreveu:
> David,
>
> Acho que a definição de "didática" vai variar muito de pessoa para pessoa.
> Particularmente, tenho formação em Matemática e estudei Processos
> Estocásticos, em 2006, através de A First Course in Stochastic Processes,
> de Samuel Karlin e Howard Taylor -
> http://www.amazon.com/Course-Stochastic-Processes-Second-Edition/dp/0123985528/ref=sr_1_2?ie=UTF8&qid=1401375184&sr=8-2&keywords=karlin+taylor
>
>
> Este era o livro clássico da disciplina de Processos Estocásticos do
> Mestrado da UFRGS.
>
>
> 2014-05-29 11:40 GMT-03:00 David Feitosa <contato em davidfeitosa.com>:
>
>> Caríssimos, bom dia.
>>
>> Desculpe se o assunto já tiver sido discutido na lista,
>> mas os senhores poderiam indicar bibliografia que fosse didática sobre
>> Estatística em Geral e Processos Estocásticos?
>>
>> Poderia ser em Inglês e, não necessariamente, associada ao R.
>> Claro que se puder ser, melhor ainda. [?]
>>
>> Obrigado!
>>
>>
Atenciosamente,
>>
>> David Feitosa
>>
>> (\_(\
>> (=°;°)
>> (("")("")
>>
>> _______________________________________________
>> R-br mailing list
>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
>
>
>
> --
> Marcus Nunes
> http://marcusnunes.me/
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/054ef567/attachment-0001.html>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo não-texto foi limpo...
Nome: 330.gif
Tipo: image/gif
Tamanho: 96 bytes
Descrição: não disponível
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/054ef567/attachment-0001.gif>
------------------------------
Message: 5
Date: Thu, 29 May 2014 14:17:50 -0300
From: Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
<emmanuel.brasil em gmail.com>
To: R BR lista <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] correlação robusta em dados longitudinais
Message-ID:
<CAFfGvyKX+4Xq6teF9VJMN17fomesnfb2RLYyrrTGcTUyV7fM3w em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Amigos de R,
Estou conduzindo uma análise de dados longitudinais com a função nlme::lme.
POr enquanto o melhor modelo que tenho é expresso como:
f7 <- lme(Velocidade ~ lado + as.factor(dia) ,data=l,random =
~1|Id/Arteria,correlation=corAR1(.8,form=~dia))
Nessa função eu gostaria que a correlçao fosse considerada para os
diferentes grupos dado para a variável lado, porque que graficamente me
parece ser diferente. Mas eu não consegui colocar esse argumento dentro de
corAR1. Mas esse nem é o problema que me preocupa mais.
A leitura fonte que tenho indica que sempre que possivel, deve-se utilizar
uma correlaçao robusta, pois assim provavelmente evita-se o erro de assumir
uma estrutura incorreta da
correlação, apesar de eu ter experimentado
várias.
Mas eu não achei no pacote nlme qualquer função/argumento que me levasse
acreditar que uma correlçao robusta esteja disponível. Alguem saberia saber
no lugar de corAR1 é possivel utilizar alguma coisa que funcionasse como
uma correlação robusta?
Abraço,
Dr. Pedro Emmanuel A. A. do Brasil
http://blog.ipec.fiocruz.br/lapclin-chagas/
Curriculum Lattes: http://lattes.cnpq.br/6597654894290806
ResearchGate.net: https://www.researchgate.net/profile/Pedro_Brasil2/
Instituto Nacional de Infectologia/Instituto de Pesquisa Clínica Evandro
Chagas
Fundação Oswaldo Cruz
Rio de Janeiro - Brasil
Av. Brasil 4365,
CEP
21040-360,
Tel 55 21 3865-9648
e-mail: pedro.brasil em ipec.fiocruz.br
e-mail: emmanuel.brasil em gmail.com
---Apoio aos softwares livres
www.zotero.org - gerenciamento de referências bibliográficas.
www.broffice.org ou www.libreoffice.org - textos, planilhas ou
apresentações.
www.epidata.dk - entrada de dados.
www.r-project.org - análise de dados.
www.ubuntu.com - sistema operacional
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/21b5880e/attachment-0001.html>
------------------------------
Message:
6
Date: Thu, 29 May 2014 20:21:53 +0200
From: "Elias T. Krainski" <eliaskrainski em yahoo.com.br>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] IDW
Message-ID: <53877AC1.9030708 em yahoo.com.br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"
Éder, essa e' a ultima versao...
On 29/05/14 17:16, Éder Comunello wrote:
> Elias, bom dia!
>
> Reconheço o mérito das suas colocações, só complementei!
>
> Aproveitando a deixa... A exemplo do material do Jackson Aquino,
> mantenho também para consulta um material seu, "Introdução à análise
> de dados espacialmente referenciados".
Tenho aqui uma versão de 2012.
> Tens alguma edição mais atual ou intenção de transformar esse material
> em livro?
>
> Grato,
>
>
> Éder Comunello <c
> <mailto:comunello.eder em gmail.com>omunello.eder em gmail.com
> <mailto:omunello.eder em gmail.com>>
> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]
>
>
> Em 29 de maio de 2014 07:18, Elias T. Krainski
> <eliaskrainski em yahoo.com.br <mailto:eliaskrainski em yahoo.com.br>> escreveu:
>
> humilhou... :)
>
>
> On 29/05/14 12:36, Éder Comunello wrote:
>> Hélio, bom dia!
>>
>> Faz sentido interpolar? Acredito que sim, partindo do princípio
>> que a dependência espacial pode existir, mas seu método não
>> permitiu detectá-la. Acredito que a causa mais comum seja o
>> esquema de amostragem utilizado, sobretudo no que se refere à
>> distância entre amostras. No caso particular, você conseguiu
>> modelar em algumas áreas e não em outras, dando margem à essa
>> interpretação.
>>
>> O colega Elias já postou uma solução, mas acrescento o
código
>> abaixo, caso ainda tenha interesse em utilizar o {gstat}.
>>
>> Em termos gerais, a ideia de operação no {gstat} é similar a do
>> {geoR}, no sentido em que você vai precisar criar um grid pra
>> receber o resultado da interpolação. O espaçamento da grade será
>> a resolução da interpolação. O ponto principal é que tem que
>> trabalhar com objetos da classe 'sp'.
>>
>> Verifique os parâmetros número de vizinhos (nmax) e peso/potência
>> da distância (idp). No {gstat} por default utilizam-se todos os
>> pontos e o idp=2.
>>
>> Atte.,
>>
>> ### <code r>
>> sapply(c("gstat", "sp", "geoR", "RColorBrewer"),
require,
>> character.only=T)
>>
>> data(parana); names(parana)
>> hist(parana$data, col=3)
>> points(parana, pt.divide='quart')
>>
>> ### Criar objeto 'sp'
>> pr <- data.frame(x=parana$coords[,1], y=parana$coords[,2],
>> chuva=parana$data)
>> names(pr); coordinates(pr) <- ~x+y
>> class(pr)
>> plot(pr, asp=1, axes=T, pch=20); polygon(parana$borders, border=2)
>>
>> ### Criar 'grid'
>> bbox(pr)
>> lim <- round(bbox(pr)+c(-1,-1, 1, 1)*50); lim ### amplia a área
>> do bbox
>> grid <- expand.grid(x=seq(lim[1,1],lim[1,2], by=10),
>>
y=seq(lim[2,1],lim[2,2], by=10))
>> grid -> grid.pt <http://grid.pt>
>> gridded(grid) = ~x+y ### SpatialPixels
>> coordinates(grid.pt <http://grid.pt>) = ~x+y ### SpatialPoints
>>
>> ### IDW Default
>> idw <- idw(pr$chuva~1, pr, grid)
>> idw.pt <http://idw.pt> <- idw(chuva~1, pr, grid.pt <http://grid.pt>)
>>
>> ### Visualização
>> spplot(idw, "var1.pred", main = "IDW Default")
>> spplot(idw.pt <http://idw.pt>, "var1.pred", main = "IDW default -
>> Mapa Pontuado")
>> image(idw); polygon(parana$borders); points(pr)
>>
>> ### Variando parâmetros
>> idw.data <- data.frame(
>> default = idw(chuva ~ 1, pr, grid)$var1.pred, ###
>> nmax=todos & idp=2
>> idw6 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, nmax=6)$var1.pred,
>> idw9 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, nmax=9)$var1.pred,
>> idp1 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 1)$var1.pred,
>> idp4 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 4)$var1.pred,
>> idp8 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp =
8)$var1.pred)
>>
>> grid.data <- SpatialPixelsDataFrame(grid, idw.data)
>> dput(names(grid.data))
>>
>> spplot(grid.data, c("default", "idw6", "idw9", "idp1", "idp4",
>> "idp8"), main = "IDW", col.regions=rainbow(16)
>> # idp: numeric; specify the inverse distance weighting power
>> # nmax: the number of nearest observations that should be used
>> ### </code>
>>
>>
>>
>>
>> Éder Comunello <c
>> <mailto:comunello.eder em gmail.com>omunello.eder em gmail.com
>> <mailto:omunello.eder em gmail.com>>
>> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]
>>
>>
>>
>>
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Message: 7
Date: Thu, 29 May 2014 20:23:55 +0200
From: "Elias T. Krainski" <eliaskrainski em yahoo.com.br>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Bibliografia
Message-ID: <53877B3B.4020809 em yahoo.com.br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"
Ha dois livros bons de processos estocasticos. Um mais aplicado e outro
com resultados mais teoricos (sem aprofundar na prova dos resultados).
http://www.maths.lth.se/matstat/staff/georg/
On 29/05/14 16:40, David Feitosa wrote:
> Caríssimos, bom dia.
>
> Desculpe se o assunto já tiver sido discutido na lista,
> mas os senhores poderiam indicar bibliografia que fosse didática sobre
> Estatística em Geral e Processos Estocásticos?
>
> Poderia ser em Inglês
e, não necessariamente, associada ao R.
> Claro que se puder ser, melhor ainda.
>
> Obrigado!
>
> Atenciosamente,
>
> David Feitosa
>
> (\_(\
> (=°;°)
> (("")("")
>
>
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Tipo: image/gif
Tamanho: 96 bytes
Descrição: não disponível
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Message: 8
Date: Thu, 29 May 2014 12:55:36 -0700 (PDT)
From: Elton Gean Araújo Araújo <egarauj em yahoo.com.br>
To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] Manual de uso do R
Message-ID:
<1401393336.35171.YahooMailNeo em web142706.mail.bf1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Parabéns Jackson!
Muito bom ter este conhecimento compartilhado.
Abraços.
Elton Gean Araújo
Mestre em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ - USP.
Professor da Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.
Campus de Paranaíba
Em Quarta-feira, 28 de Maio de 2014 15:51, Fernando Antonio de souza <nandodesouza em gmail.com> escreveu:
Parabéns Jackson. Este livro será refência ao curso de introdução ao R que leciono aqui na UFAL
Em 28 de maio de 2014 13:09, Jakson Alves de Aquino <jalvesaq em gmail.com> escreveu:
Olá,
>
>
>Peço licença a vocês para anunciar que o meu trabalho "R para cientistas sociais" foi publicado como livro eletrônico pela Editus (Editora da Universidade Estadual de Santa Cruz, Bahia). Aproveito a oportunidade para parabenizar a Editus por disponibilizar livremente suas publicações digitais:
>
>
>http://www.uesc.br/editora/index.php?item=conteudo_livros_digitais.php
>
>
>
>Embora
voltado para as necessidades mais comuns de cientistas sociais, acredito que o livro pode ser um manual útil a todos os que estão aprendendo a usar o R. Os dados necessários para reproduzir os exemplos estão em:
>
>
>http://www.lepem.ufc.br/jaa/RparaCS.php
>
>
>
>--
>Jakson Alves de Aquino
>Universidade Federal do Ceará
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Message: 9
Date: Thu, 29 May 2014 19:37:42 -0300
From: claudia christina
sobrinho do nascimento
<claudiachris em ig.com.br>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Manual de uso do R
Message-ID:
<CABKDUPNK8AZVW0qr1Fp79F2AW_WeK_cB=82tTjtdgmxVc+UBtA em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Parabéns! E obrigada por divulgar.
Em 29 de maio de 2014 11:37, David Feitosa <contato em davidfeitosa.com>
escreveu:
> Eu já li a obra em pdf.
> Muito boa mesmo, principalmente para quem não é da área de desenvolvimento.
>
>
>
>
Atenciosamente,
>
> David Feitosa
>
> (\_(\
> (=°;°)
> (("")("")
>
>
> Em 29 de maio de 2014 11:14, Alan Rodrigo Panosso <arpanosso em yahoo.com.br>
> escreveu:
>
> Fantástico! Parabéns!!!!
>>
>> Alan Rodrigo Panosso
>>
>> ----------------------------------------------------------------------------
>> Departamento de Matemática -
>> Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira - FEIS - UNESP
>> Alameda Rio de Janeiro, 266
>> 15 385 - 000 - Ilha Solteira - SP.-Brasil
>> E_mail: alanrp em mat.feis.unesp.br ou
>> arpanosso em yahoo.com.br
>> Tel.: (18) 3743-1968
>>
>>
>>
>> Em Quinta-feira, 29 de Maio de 2014 6:08, Rodrigo Muniz <
>> uenf.rodrigo em gmail.com> escreveu:
>>
>>
>> Parabens, Jakson, tanto pela iniciativa quanto pela qualidade do
>> material, vi que embora seja voltada para analise de dados sociais poderei
>> utilizar em minhas análises pela didática apresentada e pela programação.
>> Mais uma vez parabéns...
>> Att...
>>
>>
>> 2014-05-29 9:23 GMT-03:00 Jakson Alves de Aquino <jalvesaq em gmail.com>:
>>
>> On 29-05-2014 07:49, Éder Comunello wrote:
>> > Já utilizo
seu material há um bom tempo e pela qualidade e utilidade do
>> > mesmo, já esperava que saísse na forma de livro. Parabéns!
>>
>> Obrigado a você e a todos os outros da lista que fizeram comentários!
>>
>> > Sou do tempo antigo :D, e gostaria de saber se também vai ter versão
>> > impressa. Caso sim, gentileza informar como adquirir.
>>
>> Não há nenhuma previsão de produção de versão impressa. Acho que não
>> haverá, mas, se houver, anunciarei aqui.
>>
>> --
>> Jakson
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>> código mínimo reproduzível.
>>
>>
>>
>>
>> --
>> *Rodrigo A. Muniz*
>> Eng. Agrônomo. Ms Produção Vegetal (UENF)
>> Doutorando em Engenharia de Sistemas Agrícolas (ESALQ/USP)
>> E-mail - muniz.ra em usp.br
>> Cel (19) 98300-4333 (Pessoal)
>>
>>
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>> código mínimo reproduzível.
>>
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>> código mínimo reproduzível.
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> código mínimo reproduzível.
>
--
Cláudia Christina Sobrinho do Nascimento
nutricionista
Residência terapia nutricional (HUPE/UERJ)
Aperfeiçoamento vigilância alimentar e nutricional (ENSP/FIOCRUZ)
Mestre e doutoranda saúde coletiva/epidemiologia (IMS/UERJ)
cel.997332776
P *- ANTES DE IMPRIMIR ESTE OU QUALQUER OUTRO DOCUMENTO, PENSE EM SEU
COMPROMISSO COM O MEIO AMBIENTE. -*
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Message: 10
Date: Thu, 29 May 2014 19:17:57 -0400
From: ASANTOS <alexandresantosbr em yahoo.com.br>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br, ecomunel em gmail.com
Subject: Re: [R-br] Fwd: Representação de gráfico tipo torta em um
shapefile
Message-ID: <5387C025.6000404 em yahoo.com.br>
Content-Type:
text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"
Boa noite Éder,
Tentei seguir seu roteiro usando maptools::unionSpatialPolygons()
e não deu certo a dissolução de bacias, fiz:
require(shapefiles)
library(maptools)
library(gpclib)
library(rgdal)
library(PBSmapping)
#Shapefile e dados
links <- c(
"https://www.dropbox.com/s/3ph2630xicpexo0/dem.crop.final.tif",
"https://www.dropbox.com/s/3ph2630xicpexo0/dem.crop.final.tif",
"https://www.dropbox.com/s/3ph2630xicpexo0/dem.crop.final.tif",
"https://www.dropbox.com/s/3ph2630xicpexo0/dem.crop.final.tif")
if (sum(sapply(basename(links), file.exists))<4) {
lapply(links, function(a) tryCatch(download.file(a,
dest=basename(a), mode='wb'),
error=function(...)
message("ERRO!")))} else message('OK!')
#
#abrido shapefile
#
bacias <- readOGR(".", "sa_bas_ll_r500m")
CRS.new <- CRS("+proj=longlat +datum=WGS84")
proj4string(bacias) <- CRS.new
plot(bacias)
str(bacias)
## Separando os ID dos atributos do LEVEL2, pois tenho 6 níveis de bacias
IDlevel2<- cut(bacias em data$LEVEL2, range(bacias em data$LEVEL2),
include.lowest=TRUE)
## Bacias "dissolvidas" para o nível 2
Dissolve_bacia <- unionSpatialPolygons(bacias ,Dissolve_bacia)
Dissolve_bacia_2 <- SpatialPolygons2PolySet(DissolveResult)
## Representação gráfica
plotPolys(Dissolve_bacia_2 , proj =
TRUE,col="wheat1",xlab="longitude",ylab="latitude")
E a figura resultante em plotPolys não são minhas bacias no nível 2.
Poderia me dizer o que estou fazendo de errado,
Obrigado,
--
======================================================================
Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
Campus Cáceres
Caixa Postal 244
Avenida dos Ramires, s/n
Bairro: Distrito Industrial
Cáceres - MT
CEP: 78.200-000
Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO)
e-mails:alexandresantosbr em yahoo.com.br
alexandre.santos em cas.ifmt.edu.br
Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680
======================================================================
Em 26/05/2014 15:12, Éder Comunello escreveu:
Alexandre, boa tarde!
Sugiro que você trabalhe com o mapa de bacias "dissolvidas" para o nível
2. Para isso você pode fazer uso de maptools::unionSpatialPolygons().
Para fins de visualização você pode ainda utilizar outras funções de
simplificação.
Feito isso, além de
visualizar mais rápido, você poderá obter o
centróide dos polígonos dissolvidos pra locar os gráficos de torta.
Depois de rodar o sp::over() você precisa tabular as frequências por
bacia e adicionar a coordenada de cada uma.
A entrada do add.pie() é individual, então você poderá pensar num laço
ou uma função da família apply pra entradas múltiplas.
Atte.,
Éder Comunello <c
<mailto:comunello.eder em gmail.com>omunello.eder em gmail.com
<mailto:omunello.eder em gmail.com>>
Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]
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------------------------------
Message: 11
Date: Thu, 29 May 2014 21:14:42 -0300
From: "Mauro Sznelwar" <sznelwar em uol.com.br>
To: <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>, "'Edson Lira'"
<edinhoestat em yahoo.com.br>
Subject: [R-br] RES: Link para elaboração de mapas
Message-ID: <017c01cf7b9c$28245ca0$786d15e0$@com.br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Muito obrigado, parece ótimo, ainda
vou tentar rodar os comandos que
aparecem lá.
Eder, Mauro e caros amigos da lista, encontrei um material para elaboração
de mapas com o R que achei muito bom, abaixo o link.
http://www.social-statistics.org/?p=764
[ ]'s
Edson Lira
Estatístico
Manaus-Amazonas
---
Este email está limpo de vírus e malwares porque a proteção do avast! Antivírus está ativa.
http://www.avast.com
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URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/8af19984/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 12
Date: Thu, 29 May 2014 15:36:44 -0300 (BRT)
From: Paulo Justiniano <paulojus em leg.ufpr.br>
To: leg_l em leg.ufpr.br
Cc: rbras_l em rbras.org.br
Subject: [R-br] INLA short course with Elias
Message-ID: <alpine.DEB.2.00.1405291529480.31612 em pataxo.est.ufpr.br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"
O Elias Krainski vai passar uns dias aqui em Curitiba e
no período
vai apresentar um curso sobre o INLA.
A enfase será mais na motivaçãoe "entranhas" do INLA (e nao apenas no uso
do pacote e exemplos de dados)
A seguir um resumo, tb em www.leg.ufpr.br/seminarios
todos interessados são bem vindos
Local: LEG/UFPR
Periodo: 09-13/06/2014
Horario: 10:00 - 12:00
-------------------------------------------------------------------------------
The main objective of this course is to look at the ideas behind INLA.
INLA has a history which can be followed by looking bacl at the sequence
of works by Prof. H. Rue's.
We start on the MCMC algorithms, including single site and block updates
and the Gaussian approximation as a proposal.
Then, the INLA algorithm is used as one further step more wich makes
sampling from the posterior no longer needed for most inference tasks.
An working example is used to show, in details, how the algorithms
work.
At end we can see that any additive linear model with
conditional independent likelihood can be easily included in the
framework.
If time allows, we will look at the INLA package and at some tricks
implemented to deal with more complex models.
------------------------------
Message: 13
Date: Fri, 30 May 2014 04:44:38 -0700 (PDT)
From: Edson Lira <edinhoestat em yahoo.com.br>
To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] sos
Message-ID:
<1401450278.8566.YahooMailNeo em web160104.mail.bf1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
a=c(1,3,5,4,3, NA, NA)
max(a,na.rm=T)
[ ]'s.
Edson Lira
Estatístico
Manaus-Amazonas
Em Terça-feira, 27 de Maio de 2014 15:33, Luiz Roberto Martins Pinto <luizroberto.uesc em gmail.com> escreveu:
Caros,
tenho um vetor
a=c(1,3,5,4,3, NA, NA)
preciso encontrar o valor máximo deste vetor, neste caso encontrar o 5
utilizei
max(a)
Resultado:
[1] NA
O que devo fazer?
Luiz Roberto.
Luiz Roberto Martins Pinto
Prof. Pleno/DCET/UESC
Laboratório de Estatística Computacional
Universidade Estadual de Santa
Cruz
Ilhéus-Bahia
luizroberto.uesc em gmail.com
skype: lrmpinto
http://lattes.cnpq.br/2732314327604831
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URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140530/43ca707f/attachment.html>
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Subject: Legenda do Digest
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Fim da Digest R-br, volume 41, assunto 31
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