[R-br] ggplot2

geovane barbosa geovanecb em yahoo.com.br
Quinta Setembro 26 16:32:18 BRT 2013


Consegui modificar agora ele esta trazendo apenas a cor azul, porém quero a cor preta, segue em o código. Usei o comando linetype, porém ele esta fazendo as modificações de estilo da linha na cor azul.


c <- ggplot(data2.fem.3raca, aes(y=Pasajuste.fem, x=IDADEA, linetype=factor(Cor2)))

p5<-c + stat_smooth(method="loess",span=0.75)+ xlab("years")+ylab("Systolic blood pressure (mmHg)")+scale_colour_hue(name="Ethnicity")+xlim(35,74)+ylim(105,130)+labs(title = "Female")+opts(legend.position = "none")

 
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Prof. Geovane Carlos Barbosa
UCL - Faculdade do Centro Leste
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 De: geovane barbosa <geovanecb em yahoo.com.br>
Para: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com> 
Cc: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> 
Enviadas: Quinta-feira, 26 de Setembro de 2013 16:00
Assunto: ggplot2
 




Olá pessoal boa tarde 


tenho comando abaixo que gera uma linha suave sobre os meus dados, ou seja, uma loess com span=0.75. Estou classificando a variável pressão por categorias de raça, tenho 3 categorias, porem gostaria de colocar cores neutras como faço? tipo assim    Negros _____________,   Pardos ------------------, Brancos +++++++.

Algo proximo a isso, como faço?



c <- ggplot(data2.masc.3raca, aes(y=Padajuste.masc, x=IDADEA, colour=factor(Cor2)))

p8<- c + stat_smooth(method="lm")+ xlab("years")+ylab("Diastolic blood pressure (mmHg)")+scale_colour_hue(name="Ethnicity")+labs(title = "Male")+ylim(67,81)







 
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Enviadas: Quinta-feira, 19 de Setembro de 2013 0:15
Assunto: Re: [R-br] loess ggplot2
 


isso nao e' um bug.. e' uma msg de aviso te dizendo que nao e' o loess que esta' sendo utilizado...



Em 17 de setembro de 2013 16:46, geovane barbosa <geovanecb em yahoo.com.br> escreveu:

Pois é consultei uma lista fora me disseram que é um bug que ocorre no ggplot2.
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>Prof. Geovane Carlos Barbosa
>UCL - Faculdade do Centro Leste
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> De: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
>Para: geovane barbosa <geovanecb em yahoo.com.br> 
>Cc: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> 
>Enviadas: Terça-feira, 17 de Setembro de 2013 16:37
>
>Assunto: Re: [R-br] loess ggplot2
> 
>
>
>entao, neste caso, vc precisa ler direitinho a documentacao.... o ggplot esta' te dizendo que optou por usar o GAM ao inves de loess... e, com GAM, e' um esquema diferente para escolha de parametros de alisamento.... (minha - fraca - memoria nao se recorda de "span" para GAMs)....
>
>
>
>Em 17 de setembro de 2013 15:36, geovane barbosa <geovanecb em yahoo.com.br> escreveu:
>
>Obrigado benilton 
>>
>>
>>
>>
>>abraços 
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>Uma outra dúvida, esta dando uma menssagem, na hora de plotar o gráfico, andei pesquisando eles informaram que não é erro, apenas um bug do ggplot2. Veja o erro 
>>
>>
>>geom_smooth: method="auto" and size of largest group is >=1000, so using gam with formula: y ~ s(x, bs = "cs"). Use 'method = x' to change the smoothing method.
>>geom_smooth: method="auto" and size of largest group is >=1000, so using gam with formula: y ~ s(x, bs = "cs"). Use 'method = x' to change the smoothing method.
>>geom_smooth: method="auto" and size of largest group is >=1000, so using gam with formula: y ~ s(x, bs = "cs"). Use 'method = x' to change the smoothing method.
>>geom_smooth: method="auto" and size of largest group is >=1000, so using gam with formula: y ~ s(x, bs = "cs"). Use 'method = x' to change the smoothing method.
>> 
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>>Prof. Geovane Carlos Barbosa
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>> De: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
>>Para: r-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>; geovane barbosa <geovanecb em yahoo.com.br> 
>>Enviadas: Terça-feira, 17 de Setembro de 2013 15:27
>>Assunto: Re: [R-br] loess ggplot2
>> 
>>
>>
>>0.75 e' provavelmente o valor utilizado (seguindo as recomendacoes da ajuda foi q cheguei a este numero).
>>
>>
>>se vc nao estiver confiante, fixe manualmente o valor que vc queira...
>>
>>
>>b
>>
>>
>>
>>Em 17 de setembro de 2013 15:02, geovane barbosa <geovanecb em yahoo.com.br> escreveu:
>>
>>Olá pessoal boa tarde. 
>>>
>>>
>>>
>>>
>>>estou utilizando um comando do ggplot2 de método de suavização da seguinte forma: 
>>>
>>>
>>>6<-c + stat_smooth(method="auto")+ xlab("years")+ylab("")+scale_colour_hue(name=" ")+xlim(35,74)+ylim(105,130)+labs(title = "")
>>>c <- ggplot(data, aes(y=pressured, x=age, colour=factor(race)))
>>>
>>>
>>>
>>>
>>>A pergunta é, qual o span ele está utilizando como default?
>>>
>>>
>>>abraços
>>>
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>>>Prof. Geovane Carlos Barbosa
>>>UCL - Faculdade do Centro Leste
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>>> De: Raphael Saldanha <rfsaldanha em outlook.com>
>>>Para: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> 
>>>Enviadas: Terça-feira, 17 de Setembro de 2013 8:37
>>>Assunto: Re: [R-br] Banco de dados muito grande
>>> 
>>>
>>>
>>>Seguindo a sugestão do pessoal, tendo o arquivo em TXT, você pode usar o read.fwf, ou o read.csv (read.csv2 para ponto-e-virgula) para arquivos CSV.
>>>
>>>Havendo necessidade de permanecer no Excel, faça um teste com um arquivo menor, com apenas uma dezena de linhas, para ver se há algum problema/incompatibilidade no pacote que faz a leitura, ou no cabeçalho do arquivo, ou alguma outra coisa.
>>>
>>>---
>>>
>>>
>>>Atenciosamente,
>>>Raphael Saldanha
>>>
>>>
>>>rfsaldanha em outlook.com
>>>
>>>
>>>
>>>________________________________
>>>From: sznelwar em uol.com.br
>>>To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>>Date: Tue, 17 Sep 2013 08:31:53 -0300
>>>Subject: Re: [R-br] Banco de dados muito grande
>>>
>>>
>>>
>>>On 09/16/2013 06:11 PM, Edson Lira wrote:
>>>> Caros amigos, boa 
noite, tenho um banco de dados com 10 mb e 176 mil
>>>> linhas com 11 
colunas.
>>>>
>>>> Estou usando:
>>>>
>>>> 
tra<-read.xlsx("/Users/edsonlira/Minuza/Dados_geral.xlsx",1,header=T,encoding=
>>>> 
"UTF-8")
>>>>
>>>> Me mostra o seguinte erro:
>>>> Erro em 
.jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl,  
:
>>>>    java.lang.OutOfMemoryError: Java heap 
space
>>>>
>>>> O que devo fazer?
>>>>
>>>> [ ]'s.
>>>> Edson 
Lira
>>>> Estatístico
>>>> Manaus-Amazonas
>>>
>>>
>>>Edson,
>>>
>>>Não 
acho este banco em si grande. Já trabalhei com bancos na ordem de 
>>>milhões de 
linhas sem problema.
>>>
>>>Observe algumas coisas:
>>>
>>>1- Pela mensagem de 
erro, o problema está ocorrendo no Java 
>>>(java.lang.OutOfMemoryError: Java 
heap space)
>>>
>>>2- Sempre trabalhe com tipos de arquivos mais simples, o csv 
por 
>>>exemplo. Assim você não depende de outros pacotes 
....
>>>
>>>[]s
>>>Tura
>>>
>>>
>>>Aproveitando a 
sugestão do Tura. seria talvez conveniente transformar em .txt e 
experimentar. 
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