[R-br] duvida sobre função try {base}

David Valentim Dias dvdscripter em gmail.com
Sexta Maio 10 16:51:59 BRT 2013


Bom que o problema se resolveu com os exemplos acima dos colegas da lista.
Checagem de erro no R fora da biblioteca padrão é um caos mesmo. Poderia
muito bem retornar algo diferente de string (NA por exemplo) e você ia
checar e substituir como foi sugerido acima.

Abraços


Em 10 de maio de 2013 15:34, Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com> escreveu:

> #
> sapply(teste, function(x)tryCatch(log(x), error =
> function(...)"verificar"))
> #
>
> Isso era o que eu queria :), funcionou perfeitamente.
>
> David, o taxisize retorna uma mensagem de erro que é uma String. Por
> exemplo eu guardava os resultados numa matriz de characters, onde uma
> coluna é o nome que usei para fazer a busca, a resposta quando da certo são
> o nome sugerido, um score que é referente a se o nome não esta
> desatualiado, se tem erro de digitação, se não mudou que são as coisas que
> eu guardo.
>
> Ai usando o try() tava ficando uma mensagem enorme nas células, ai no r so
> imprimia 1 coluna por vez,  ai eu queria que ele deixa-se uma palavra menor
> so para facilitar a visualização, ja que se não deu certo eu quero
> verificar caso a caso mesmo, ou posso tentar denovo so com o que falhou,
> porque existem muitos erros de nome de especie muito antigas, que mudou,
> essas coisas que não é para dar certo mesmo
> Mas acho que usando esse tryCatch ai dar certo agora.
> Eu imaginei que seria melhor deixar um exemplo mais simples, que produzia
> o mesmo efeito aqui, o efeito é mais ou menos o mesmo.
>
> Mas muito obrigado pelas resposta. me ajudaram muito.
>
> Abraços
> Augusto Ribas
>
>
> Em 10 de maio de 2013 14:54, Henrique Dallazuanna <wwwhsd em gmail.com>escreveu:
>
> Tente assim:
>>
>> sapply(teste, function(x)tryCatch(log(x), error =
>> function(...)"verificar"))
>>
>>
>> 2013/5/9 Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com>
>>
>>> Ola, eu gostaria de saber, se tem como eu mudar de forma simples a
>>> mensagem de erro que o R envia  ao tentar usar uma função e receber um
>>> erro.
>>>
>>> Por exemplo:
>>>
>>> #Imagine que eu tenho a seguinte lista, e precise aplicar uma função
>>>
>>> #Exemplo de lista de dados
>>> teste<-list(2, "a", 1 , 10 , "b")
>>> teste
>>>
>>> #Preparando um lugar para guardar os resultados
>>> saida<-list()
>>>
>>> #Se eu tentar fazer um loop com for, ele vai parar
>>> #quando chegar a letra, porque nao da para fazer o log de caracter
>>> for( i in 1:length(teste)) {
>>>   saida[i] <-log(teste[i])
>>> }
>>>
>>> #nesse caso o loop para e eu nao tenho  a saida que desejo
>>> saida
>>>
>>> #Mas então eu tentei usar a função try
>>> #minha ideia era que se der para calcular, calcule
>>> #senão de uma msg de erro e siga em frente pro proximo
>>>
>>> for( i in 1:length(teste)) {
>>>   saida[[i]] <-try( log(teste[[i]][1]) )
>>> }
>>>
>>> #agora eu tenho minha saida, com erro onde não deu para calcular, isso
>>> que eu queria
>>> saida
>>>
>>> #o que eu queria saber se é possivel fazer o seguinte
>>> #se der certo, execute a função, senão imprima o erro que eu falar
>>> #nesse caso eu gostaria de uma saida desse tipo:
>>>
>>> saida.exemplo<-list(0.6931472,"Verificar",0,2.302585,"Verificar")
>>> saida.exemplo
>>>
>>> #############################################################
>>>
>>> Esse exemplo eu peguei na função try.
>>>
>>> Mas na verdade eu estou usando o pacote taxize
>>> (http://ropensci.github.io/taxize_/)
>>> para conferir nomes de especies, e para conferir listas grandes, as
>>> vezes para quando a conexão com a internet falha, ou o nome da especie
>>> não é encontrado, resumindo eu queria saber se existe uma forma de
>>> falar pro R, fazer isso (minha função), se der erro retorne isso
>>> (minha mensagem).
>>>
>>> Agradeço desde ja a atenção.
>>>
>>> --
>>> Grato
>>> Augusto C. A. Ribas
>>>
>>> Site Pessoal: http://recologia.com.br/
>>> Github: https://github.com/Squiercg
>>> Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056
>>> _______________________________________________
>>> R-br mailing list
>>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>> código mínimo reproduzível.
>>>
>>
>>
>>
>> --
>> Henrique Dallazuanna
>> Curitiba-Paraná-Brasil
>> 25° 25' 40" S 49° 16' 22" O
>>
>> _______________________________________________
>> R-br mailing list
>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
>
>
>
> --
> Grato
> Augusto C. A. Ribas
>
> Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org>
> Github: https://github.com/Squiercg
> Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>



-- 
Biostatistician Consultant and Cogito Programmer's
http://www.facebook.com/CogitoConsultoriaEstatistica
Curriculum: http://lattes.cnpq.br/7541377569511492
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130510/a97cd1dc/attachment.html>


Mais detalhes sobre a lista de discussão R-br