[R-br] Como listar arquivos faltantes usando R

[Rodrigo Coster]

Pra criar um vetor com todos possiveis valores, tu pode usar expand.grid().
Se eu entendi certo, isso deve bastar:
apply(expand.grid('MCD12Q1.A', 2001:2011, 'h', 10:14, 'v',
sprintf('%02.0f', 8:13), '.hdf'), 1, paste, collapse='')



2013/3/19 Leandro Marino <leandromarino em leandromarino.com.br>

> Thiago
>
> A função dir lista todos os arquivos de um diretório. Logo vc pode montar
> um vetor com os nomes de todos os arquivos e chegar com o dir(). O que
> estiver no primeiro e não estiver no segundo é o que você precisa baixar
>
> Enviado de um dispositivo móvel.
> Sent from a mobile device.
> Em 19/03/2013 18:51, "Thiago V. dos Santos" <thi_veloso em yahoo.com.br>
> escreveu:
>
> Elias,
>>
>> Obrigado pela dica, mas... Você poderia elaborá-la, por favor?
>>
>> Obrigado,
>> Thiago.
>>
>>
>> ----- Original Message -----
>> From: Elias Teixeira Krainski <eliaskrainski em yahoo.com.br>
>> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>> Cc:
>> Sent: Tuesday, March 19, 2013 4:07 PM
>> Subject: Re: [R-br] Como listar arquivos faltantes usando R
>>
>> Em problema similar ao seu eu faço uma tabela
>> em R com ano nas linhas e meses nas colunas
>>
>> Exemplo (no seu caso nao sei a posicao de mes):
>> a <- dir('diretorioDosArquivos')
>> table(substr(a, 10, 13)) ### anos
>>
>>
>>
>> On Tue, 2013-03-19 at 13:53 -0700, Thiago V. dos Santos wrote:
>> > Olá pessoal,
>> >
>> > Baixei centenas de imagens de satélite e agora devo conferir se tenho
>> todas que realmente vou precisar. A nomenclatura das imagens segue o padrão:
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h10v08.hdf
>> > MCD12Q1.A2001.h10v09.hdf
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h10v10.hdf
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h10v11.hdf
>> >
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h11v08.hdf
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h11v09.hdf
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h11v10.hdf
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h11v11.hdf
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h11v12.hdf
>> >
>> > MCD12Q1.A2001.h11v13.hdf
>> >
>> > e assim por diante
>> >
>> > onde 2001 é o ano e vai de 2001 a 2011.
>> > h10 é um componente horizontal da imagem e vai de a 10 a 14.
>> > v08 é um componente vertical da imagem e vai de a 08 a 13.
>> >
>> > O que preciso fazer é o seguinte: varrer uma lista de todas as imagens
>> possíveis, que vão de 2001 a 2011, h10 a h14 e v08 a v13, e testar se tem
>> alguma que está faltando. Para isso eu uso a função "file.exists" dentro de
>> três loops: "ano", "h" e "v".
>> >
>> > No final da mensagem estou colando o código que usei para fazer isso.
>> Ele até funciona, mas não salva a lista inteira, e sim somente o último
>> nome. Estou fazendo alguma coisa errada no loop. Acredito também que fazer
>> três loops não é a maneira mais otimizada de fazer isso, porém foi a
>> primeira que veio na minha cabeça.
>> >
>> > Alguém pode ajudar, criticando o código?
>> >
>> > Obrigado desde já,
>> > Thiago.
>> >
>> >
>> > ##################################################################
>> > # Gather all files
>> > dir <- ('/Users/dossa013/data/MODIS/MCD12Q1/original')
>> > files <- list.files(dir, pattern='hdf', full.names=T)
>> >
>> > # Set beginning and ending years
>> > byear <- 2001
>> > eyear <- 2011
>> >
>> > # Set tiles
>> > h1 <- 10
>> > h2 <- 14
>> > v1 <- 08
>> > v2 <- 13
>> >
>> > # Loop over year and then over tiles
>> > for (x in byear:eyear) {
>> >   for (y in h1:h2)      {
>> >     for (z in v1:v2)     {
>> >       name <-
>> paste('/Users/dossa013/data/MODIS/MCD12Q1/original/MCD12Q1.A',x,'.h',y,'v',z,'.hdf',
>> sep='')
>> >       if (file.exists(name)==F)
>> >
>> >       missing <- name
>> >
>> >   } # end of v
>> >  } # end of h
>> > } # end of year
>> > > missing
>> > [1]
>> "/Users/dossa013/data/MODIS/MCD12Q1/original/MCD12Q1.A2011.h14v9.hdf"
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