[R-br] problemas com leitura de data.frame()
alanarocha em sapo.pt
alanarocha em sapo.pt
Segunda Junho 24 08:55:43 BRT 2013
Boa tarde,
eu estou a fazer uma leitura de bases de dados em que tenho de excluir
colunas,
Casos|DoseTH9|DoseTH6|DoseTH3|DoseTC3|DoseTC6|DoseTC9
54020104|930|900|900|390|1170|2700
54020178|1860|930|900|420|840|630
54020303|1860|2790|2700|1620|1440|1530
54020492|930|930|900|420|840|720
54020637|1080|480|870|2970|2700|2520
54020698|2790|1590|930|390|720|2340
54020714|930|930|900|390|390|390
54030032|1860|750|780|720|780|720
54030048|3720|3720|3600|840|840|840
54030135|780|420|60|390|390|420
54030164|2700|2790|2790|720|780|360
54030208|930|930|900|420|420|360
54030297|2700|3720|3720|1170|1170|540
54030300|1860|930|900|420|420|720
54030303|930|930|1800|420|750|780
54030338|930|900|930|390|360|390
54030344|1680|1860|1860|780|780|840
54030349|1860|1800|1800|840|780|780
54030358|360|390|270|150|150|60
dados=read.table("dadaos",header=T,sep="|") #DoseTH6|DoseTH3|
eu quero excluir todas as colunas menos as colunas 4 e 5 e para isso fiz:
dados[,-c(1,2,3,6,7)]
e foi-me devolvido o seguinte:
DoseTC3 DoseTC6
1 900,0 390,0
2 900,0 420,0
3 2.700,0 1.620,0
4 900,0 420,0
5 870,0 2.970,0
6 930,0 390,0
em vez de me devolver as colunas 4 e 5 DoseTH3 e DoseTC3.
Se eu fizer:
dados[,-c(1,2,5,6,7)]
devolve-me:
DoseTH3 DoseTC3
1 900,0 900,0
2 930,0 900,0
3 2.790,0 2.700,0
4 930,0 900,0
5 480,0 870,0
6 1.590,0 930,0
se estou a escluir a coluna DoseTC3 como é que é possível ser lida?
e depois obviamente o teste de Wilcoxon não devolve nada.
Como posso resolver isto?
Cumprimentos Ana
Quoting r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br:
> Enviar submissões para a lista de discussão R-br para
> r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou
> corpo da mensagem para
> r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo
> endereço
> r-br-owner em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será
> mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."
>
>
> Tópicos de Hoje:
>
> 1. Re: Selecionar casos - Função (FHRB Toledo)
> 2. Re: Selecionar casos - Função
> (Sérgio Henrique almeida da silva ju)
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>
> Message: 1
> Date: Sun, 23 Jun 2013 20:16:11 -0300
> From: FHRB Toledo <fernandohtoledo em gmail.com>
> To: R-Br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] Selecionar casos - Função
> Message-ID:
> <CAN55XP4hDwxKv0jmqyUdY9+NBh_+EG4YP_0SR-4Ub7mevK5VXw em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> row.names a logical value indicating whether the row names of x are to be
> written along with x to the ?le
>
> Colocando row.names = FALSE você resolve seu problema!
>
> att,
> FH
>
>
> 2013/6/23 Sérgio Henrique almeida da silva ju <sergio.edfisica em gmail.com>
>
>> Fernando
>>
>> Não entendi! Qual comando eu uso pra ignorar? Não achei
>>
>>
>> Em 23 de junho de 2013 20:04, FHRB Toledo
>> <fernandohtoledo em gmail.com>escreveu:
>>
>> André,
>>>
>>> Uma busca no google, página 37:
>>> http://cran.r-project.org/web/packages/xlsx/xlsx.pdf
>>>
>>> att,
>>> FH
>>>
>>>
>>> 2013/6/23 Sérgio Henrique almeida da silva ju <sergio.edfisica em gmail.com>
>>>
>>>> Resolvi usando a biblioteca xlsx
>>>>
>>>> for (nm in Nms) write.xlsx(Res[[nm]], paste(nm, 'xls',
>>>> sep='.'),sheetName=paste(nm), col.names=TRUE)
>>>>
>>>> Porém isso cria nos meus bancos de dados uma variável com o nome em
>>>> branco que é a a posição da linha;
>>>> Ex,:
>>>>
>>>>
>>>> codigo sexo idade 1 10001 m 19 2 10001 m 19 3 10001 m 20 4 10001 m
>>>> 20
>>>> Como ignorar isso, para que a variável não seja criada no meu banco?
>>>>
>>>> Abraços
>>>>
>>>>
>>>> Em 23 de junho de 2013 17:30, Sérgio Henrique almeida da silva ju <
>>>> sergio.edfisica em gmail.com> escreveu:
>>>>
>>>> Essa biblioteca não está mais disponível! :-(
>>>>>
>>>>>
>>>>> Em 23 de junho de 2013 17:28, Raphael Saldanha
>>>>> <rfsaldanha em outlook.com>escreveu:
>>>>>
>>>>> Compreendo.
>>>>>>
>>>>>> Tente este:
>>>>>>
>>>>>> library(xlsReadWrite)
>>>>>> write.xls(mydata, "c:/mydata.xls")
>>>>>>
>>>>>> De: http://www.statmethods.net/input/exportingdata.html
>>>>>>
>>>>>> ---
>>>>>>
>>>>>> Atenciosamente,
>>>>>> Raphael Saldanha
>>>>>>
>>>>>> rfsaldanha em outlook.com
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> ------------------------------
>>>>>> Date: Sun, 23 Jun 2013 16:49:28 -0300
>>>>>> From: sergio.edfisica em gmail.com
>>>>>>
>>>>>> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>>>>> Subject: Re: [R-br] Selecionar casos - Função
>>>>>>
>>>>>> o problema é que estes arquivos devem ser salvos dentro de arquivos
>>>>>> zip com formato xls, a empresa deseja usa diretamente esses
>>>>>> arquivos, não
>>>>>> sei o motivo... para evitar todo trabalho manual eu estou tentando fazer
>>>>>> isso diretamente pelo R.
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Em 23 de junho de 2013 16:45, Raphael Saldanha <rfsaldanha em outlook.com
>>>>>> > escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Você pode salvar como CSV. O Excel costuma reconhecer e abrir o
>>>>>> arquivo sem problemas:
>>>>>>
>>>>>> ?write.csv2
>>>>>>
>>>>>> ---
>>>>>>
>>>>>> Atenciosamente,
>>>>>> Raphael Saldanha
>>>>>>
>>>>>> rfsaldanha em outlook.com
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> ------------------------------
>>>>>> Date: Sun, 23 Jun 2013 16:12:27 -0300
>>>>>> From: beniltoncarvalho em gmail.com
>>>>>> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>>>>> Subject: Re: [R-br] Selecionar casos - Função
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Você terá de esperar a ajuda de alguém que use Excel... Salvar como
>>>>>> texto, como indiquei, não te impede de abrir no Excel...
>>>>>> On 23 Jun 2013 14:41, "Sérgio Henrique almeida da silva ju" <
>>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> wrote:
>>>>>>
>>>>>> Obrigado amigo
>>>>>>
>>>>>> Mas nesse caso surge um problema em dados como fatores, por exemplo,
>>>>>> no meu caso ele cria um \m\ ou \f\, como resolver isso?
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Em 23 de junho de 2013 14:35, ctrucios <ctrucios em gmail.com> escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Oi, eu utilizou a função write.table. Aqui um exemplo
>>>>>> write.table(TC95,"TC95.xls", sep="\t",col.names=TRUE, row.names=FALSE,
>>>>>> quote=TRUE, na="NA")
>>>>>> Em 23/06/2013 14:31, "Sérgio Henrique almeida da silva ju" <
>>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Só mais uma pergunta
>>>>>>
>>>>>> Como posso salvar esses arquivos em excel?
>>>>>> Eu tentei o comando da biblioteca WriteXLS, mas não rodou
>>>>>>
>>>>>> for (nm in Nms) WriteXLS(Res[[nm]], ExcelFileName = paste(nm, 'xls',
>>>>>> sep='.'))
>>>>>>
>>>>>> tem algum jeito melhor de salvar?
>>>>>>
>>>>>> Obrigado
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Em 23 de junho de 2013 12:51, Sérgio Henrique almeida da silva ju <
>>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Obrigado
>>>>>>
>>>>>> Deu tudo certinho!
>>>>>>
>>>>>> Abraços
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Em 23 de junho de 2013 01:28, Benilton Carvalho <
>>>>>> beniltoncarvalho em gmail.com> escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Para dividir em subconjuntos, use o comando split().
>>>>>>
>>>>>> Res = split(dados, dados$codigo)
>>>>>>
>>>>>> Daí, combine com um for() loop para gravar (ou mesmo um lapply).
>>>>>>
>>>>>> Nms = names(Res)
>>>>>> for (nm in Nms) write.table(Res[[nm]], file=paste(nm, 'txt', sep='.'))
>>>>>>
>>>>>> (código não-testado)
>>>>>>
>>>>>> Sobre gravar compactado, vc pode mudar o nome do arquivo para uma
>>>>>> conexão gzip ou, se bem me lembro, zip. Veja a ajuda para os comandos de
>>>>>> mesmo nome.
>>>>>>
>>>>>> b
>>>>>> On 22 Jun 2013 23:23, "Sérgio Henrique almeida da silva ju" <
>>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> wrote:
>>>>>>
>>>>>> Prezados
>>>>>>
>>>>>> Gostaria de fazer uma função que através de um banco formasse diversos
>>>>>> outros bancos selecionados por uma variável.
>>>>>>
>>>>>> Exemplo:
>>>>>>
>>>>>> codigo <- c(rep("10001",10), rep("10005",15),rep("20001",20))
>>>>>> sexo <- c(rep("m",20),rep("f",25))
>>>>>> idade <- rnorm(45,20)
>>>>>>
>>>>>> dados <-
>>>>>> cbind(as.data.frame(codigo),as.data.frame(sexo),as.data.frame(idade))
>>>>>>
>>>>>> Quero quebrar esse banco dados em diversos outros bancos pela variável
>>>>>> codigo
>>>>>>
>>>>>> como:
>>>>>>
>>>>>> dados1 <- dados[which(dados$codigo=="10001"),]
>>>>>> .
>>>>>> .
>>>>>> .
>>>>>> dadosn <- dados[which(dados$codigo=="n"),]
>>>>>>
>>>>>> Posso fazer uma table(codigo) e jogar os valores dentro desse comando,
>>>>>> mas não sei como fazer isso, deixando a função mais automática.
>>>>>>
>>>>>> Outra pergunta tem como eu saber esses bancos comprimidos através do
>>>>>> R, por exemplo em ZIP ou RAR?
>>>>>>
>>>>>> Obrigado
>>>>>> --
>>>>>> Sérgio Henrique Almeida da Silva Junior
>>>>>> Doutorando em Epidemiologia em Saúde Pública
>>>>>> Escola Nacional de Saúde Pública Sérgio Arouca - ENSP/FIOCRUZ
>>>>>> http://lattes.cnpq.br/1611345552843383
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>>>>>> código mínimo reproduzível.
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>>>
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>>> código mínimo reproduzível.
>>>
>>
>>
>>
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>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL:
> <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130623/07dba559/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 2
> Date: Sun, 23 Jun 2013 20:17:30 -0300
> From: Sérgio Henrique almeida da silva ju <sergio.edfisica em gmail.com>
> To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] Selecionar casos - Função
> Message-ID:
> <CAEuVWs3Ujsr3JWnwaWPPGMxOkV9799rc9WuXrhnsAbRjMHsehg em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Valeu amigo!
>
> Eu tinha colocado TRUE.
>
> Abraços
>
>
> Em 23 de junho de 2013 20:16, FHRB Toledo
> <fernandohtoledo em gmail.com>escreveu:
>
>> row.names a logical value indicating whether the row names of x are to be
>> written along with x to the ?le
>>
>> Colocando row.names = FALSE você resolve seu problema!
>>
>> att,
>> FH
>>
>>
>> 2013/6/23 Sérgio Henrique almeida da silva ju <sergio.edfisica em gmail.com>
>>
>>> Fernando
>>>
>>> Não entendi! Qual comando eu uso pra ignorar? Não achei
>>>
>>>
>>> Em 23 de junho de 2013 20:04, FHRB Toledo
>>> <fernandohtoledo em gmail.com>escreveu:
>>>
>>> André,
>>>>
>>>> Uma busca no google, página 37:
>>>> http://cran.r-project.org/web/packages/xlsx/xlsx.pdf
>>>>
>>>> att,
>>>> FH
>>>>
>>>>
>>>> 2013/6/23 Sérgio Henrique almeida da silva ju <sergio.edfisica em gmail.com
>>>> >
>>>>
>>>>> Resolvi usando a biblioteca xlsx
>>>>>
>>>>> for (nm in Nms) write.xlsx(Res[[nm]], paste(nm, 'xls',
>>>>> sep='.'),sheetName=paste(nm), col.names=TRUE)
>>>>>
>>>>> Porém isso cria nos meus bancos de dados uma variável com o nome em
>>>>> branco que é a a posição da linha;
>>>>> Ex,:
>>>>>
>>>>>
>>>>> codigo sexo idade 1 10001 m 19 2 10001 m 19 3 10001 m 20 4 10001 m
>>>>> 20
>>>>> Como ignorar isso, para que a variável não seja criada no meu banco?
>>>>>
>>>>> Abraços
>>>>>
>>>>>
>>>>> Em 23 de junho de 2013 17:30, Sérgio Henrique almeida da silva ju <
>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> escreveu:
>>>>>
>>>>> Essa biblioteca não está mais disponível! :-(
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Em 23 de junho de 2013 17:28, Raphael Saldanha <rfsaldanha em outlook.com
>>>>>> > escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Compreendo.
>>>>>>>
>>>>>>> Tente este:
>>>>>>>
>>>>>>> library(xlsReadWrite)
>>>>>>> write.xls(mydata, "c:/mydata.xls")
>>>>>>>
>>>>>>> De: http://www.statmethods.net/input/exportingdata.html
>>>>>>>
>>>>>>> ---
>>>>>>>
>>>>>>> Atenciosamente,
>>>>>>> Raphael Saldanha
>>>>>>>
>>>>>>> rfsaldanha em outlook.com
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> ------------------------------
>>>>>>> Date: Sun, 23 Jun 2013 16:49:28 -0300
>>>>>>> From: sergio.edfisica em gmail.com
>>>>>>>
>>>>>>> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>>>>>> Subject: Re: [R-br] Selecionar casos - Função
>>>>>>>
>>>>>>> o problema é que estes arquivos devem ser salvos dentro de arquivos
>>>>>>> zip com formato xls, a empresa deseja usa diretamente esses
>>>>>>> arquivos, não
>>>>>>> sei o motivo... para evitar todo trabalho manual eu estou
>>>>>>> tentando fazer
>>>>>>> isso diretamente pelo R.
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> Em 23 de junho de 2013 16:45, Raphael Saldanha <
>>>>>>> rfsaldanha em outlook.com> escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>> Você pode salvar como CSV. O Excel costuma reconhecer e abrir o
>>>>>>> arquivo sem problemas:
>>>>>>>
>>>>>>> ?write.csv2
>>>>>>>
>>>>>>> ---
>>>>>>>
>>>>>>> Atenciosamente,
>>>>>>> Raphael Saldanha
>>>>>>>
>>>>>>> rfsaldanha em outlook.com
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> ------------------------------
>>>>>>> Date: Sun, 23 Jun 2013 16:12:27 -0300
>>>>>>> From: beniltoncarvalho em gmail.com
>>>>>>> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>>>>>> Subject: Re: [R-br] Selecionar casos - Função
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> Você terá de esperar a ajuda de alguém que use Excel... Salvar como
>>>>>>> texto, como indiquei, não te impede de abrir no Excel...
>>>>>>> On 23 Jun 2013 14:41, "Sérgio Henrique almeida da silva ju" <
>>>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> wrote:
>>>>>>>
>>>>>>> Obrigado amigo
>>>>>>>
>>>>>>> Mas nesse caso surge um problema em dados como fatores, por exemplo,
>>>>>>> no meu caso ele cria um \m\ ou \f\, como resolver isso?
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> Em 23 de junho de 2013 14:35, ctrucios <ctrucios em gmail.com> escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>> Oi, eu utilizou a função write.table. Aqui um exemplo
>>>>>>> write.table(TC95,"TC95.xls", sep="\t",col.names=TRUE,
>>>>>>> row.names=FALSE, quote=TRUE, na="NA")
>>>>>>> Em 23/06/2013 14:31, "Sérgio Henrique almeida da silva ju" <
>>>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>> Só mais uma pergunta
>>>>>>>
>>>>>>> Como posso salvar esses arquivos em excel?
>>>>>>> Eu tentei o comando da biblioteca WriteXLS, mas não rodou
>>>>>>>
>>>>>>> for (nm in Nms) WriteXLS(Res[[nm]], ExcelFileName = paste(nm, 'xls',
>>>>>>> sep='.'))
>>>>>>>
>>>>>>> tem algum jeito melhor de salvar?
>>>>>>>
>>>>>>> Obrigado
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> Em 23 de junho de 2013 12:51, Sérgio Henrique almeida da silva ju <
>>>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>> Obrigado
>>>>>>>
>>>>>>> Deu tudo certinho!
>>>>>>>
>>>>>>> Abraços
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> Em 23 de junho de 2013 01:28, Benilton Carvalho <
>>>>>>> beniltoncarvalho em gmail.com> escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>> Para dividir em subconjuntos, use o comando split().
>>>>>>>
>>>>>>> Res = split(dados, dados$codigo)
>>>>>>>
>>>>>>> Daí, combine com um for() loop para gravar (ou mesmo um lapply).
>>>>>>>
>>>>>>> Nms = names(Res)
>>>>>>> for (nm in Nms) write.table(Res[[nm]], file=paste(nm, 'txt',
>>>>>>> sep='.'))
>>>>>>>
>>>>>>> (código não-testado)
>>>>>>>
>>>>>>> Sobre gravar compactado, vc pode mudar o nome do arquivo para uma
>>>>>>> conexão gzip ou, se bem me lembro, zip. Veja a ajuda para os
>>>>>>> comandos de
>>>>>>> mesmo nome.
>>>>>>>
>>>>>>> b
>>>>>>> On 22 Jun 2013 23:23, "Sérgio Henrique almeida da silva ju" <
>>>>>>> sergio.edfisica em gmail.com> wrote:
>>>>>>>
>>>>>>> Prezados
>>>>>>>
>>>>>>> Gostaria de fazer uma função que através de um banco formasse
>>>>>>> diversos outros bancos selecionados por uma variável.
>>>>>>>
>>>>>>> Exemplo:
>>>>>>>
>>>>>>> codigo <- c(rep("10001",10), rep("10005",15),rep("20001",20))
>>>>>>> sexo <- c(rep("m",20),rep("f",25))
>>>>>>> idade <- rnorm(45,20)
>>>>>>>
>>>>>>> dados <-
>>>>>>> cbind(as.data.frame(codigo),as.data.frame(sexo),as.data.frame(idade))
>>>>>>>
>>>>>>> Quero quebrar esse banco dados em diversos outros bancos pela
>>>>>>> variável codigo
>>>>>>>
>>>>>>> como:
>>>>>>>
>>>>>>> dados1 <- dados[which(dados$codigo=="10001"),]
>>>>>>> .
>>>>>>> .
>>>>>>> .
>>>>>>> dadosn <- dados[which(dados$codigo=="n"),]
>>>>>>>
>>>>>>> Posso fazer uma table(codigo) e jogar os valores dentro desse
>>>>>>> comando, mas não sei como fazer isso, deixando a função mais
>>>>>>> automática.
>>>>>>>
>>>>>>> Outra pergunta tem como eu saber esses bancos comprimidos através do
>>>>>>> R, por exemplo em ZIP ou RAR?
>>>>>>>
>>>>>>> Obrigado
>>>>>>> --
>>>>>>> Sérgio Henrique Almeida da Silva Junior
>>>>>>> Doutorando em Epidemiologia em Saúde Pública
>>>>>>> Escola Nacional de Saúde Pública Sérgio Arouca - ENSP/FIOCRUZ
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>>>>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>>>>>> código mínimo reproduzível.
>>>>>>>
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> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL:
> <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130623/101720c0/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 3
> Date: Mon, 24 Jun 2013 03:01:16 +0300
> From: Cézar Borges <cezar-fonseca em hotmail.com>
> To: Lista_R <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: [R-br] Gráfico_RDA
> Message-ID: <COL126-W358E2DA6343B764436055FE8A0 em phx.gbl>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Olá Lista,
> alguém sabe me dizer como posso fazer um gráfico para análise de
> redundância (RDA) identificando variáveis categóricas???
> Abs.
>
>
> Att,
>
>
>
> Cézar Fonseca Borges
>
>
>
>
>
>
>
> Mestrando em Ciências Ambientais
>
> UFPA/MPEG/EMBRAPA -
> Amazônia Oriental
>
> Geógrafo
>
> Email: cezar-fonseca em hotmail.com/ caborges em museu-goeldi.br
>
> Lattes: http://lattes.cnpq.br/9805721240137485
>
>
>
>
>
>
>
>
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL:
> <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130624/bf473846/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 4
> Date: Sun, 23 Jun 2013 17:08:39 -0700 (PDT)
> From: Wirton Macedo Coutinho <wirton_coutinho em yahoo.com.br>
> To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: [R-br] Contrastes para interação significativa em GLM
> Message-ID:
> <1372032519.33869.YahooMailNeo em web124702.mail.ne1.yahoo.com>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Boa noite a todos,
>
> Tenho um conjunto de dados em arranjo fatorial que não atendem as
> pressuposições de normalidade e homocesdacidade de variâncias. Para
> contornar esse problema, optei por fazer a análise do mesmo por GLM;
> no entanto,como houve efeito significativo da interação, fiquei na
> dúvida de como proceder para fazer o desdobramento e fazer
> comparações múltiplas entre os tratamentos.
>
> Pesquisando na internet, encontrei um post que recomendava fazê-lo
> por meio de constrastes utilizando o pacote multcomp. Assim o fiz
> (como vcs podem conferir pelo código abaixo). No entanto, como
> migrei recentemente para o R, surgiu a dúvida se isso que fiz está
> correto ou não. Assim, gostaria da opinião de vcs sobre o código ou
> se tem uma outra forma de fazê-lo.
>
>
> da <- expand.grid(rep=1:4, isol=factor(1:6), cult=factor(1:2))
> da$y <- c(4.5, 25.5, 8.5, 12, 123, 19.5, 111.5, 83.5, 10, 4, 4.5,
> 90.5, 46.5, 61.5, 20.5, 33.5, 47.5, 39, 131.5, 68.5, 4,
> 10, 13.5, 10, 9, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 12.5, 4.5, 6.5,
> 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0.5, 0, 2, 2, 0.5, 0.5)
>
> g0 <- glm(y~isol + cult + isol:cult, family=poisson, data=da)
> summary(g0)
> anova(g0, test="Chisq")
>
> isolcult <- interaction(da$isol, da$cult, drop=TRUE)
> m0 <- glm(da$y~isolcult, family=poisson)
> require(multcomp)
> glht.m0 <- glht(m0, mcp(isolcult = "Tukey"))
> summary(glht.m0)
>
>
> Certo de contar com a boa vontade de todos, agradeço antecipadamente.
>
> Att.,
>
> --
> Wirton Macedo Coutinho
> Pesquisador Fitopatologia
> Embrapa Algodão
> Rua Oswaldo Cruz, 1143, Centenário
> Campina Grande PB
> CEP 28428-095
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL:
> <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130623/6307ee40/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 5
> Date: Sun, 23 Jun 2013 20:18:48 -0400
> From: ASANTOS <alexandresantosbr em yahoo.com.br>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Geoprocessamento
> Message-ID: <51C79068.2040407 em yahoo.com.br>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"
>
> Edmar,
> Segue um exemplo simples:
>
> #
> #Vértices da área em utm
> limitex<-c(310141.62,310320.65,310347.07,310166.98,310141.62)
> limitey<-c(8295898.01,8295923.64,8295791.84,8295765.39,8295898.01)
> #
> ##Visualização
> require(sp)
> Pontos <- SpatialPointsDataFrame(SpatialPoints(cbind(limitex,limitey)),
> data=data.frame(ID=1:length(limitex)))
> proj4string(Pontos) <- CRS("+proj=utm +zone=21 +south +datum=WGS84
> +units=m +no_defs")
> require(plotGoogleMaps)
> plotGoogleMaps(Pontos)
> #
> Espero ter ajudado,
>
> --
> ======================================================================
> Alexandre dos Santos
> Proteção Florestal
> Coordenador do curso Técnico em Florestas
> Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal
> IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
> Campus Cáceres
> Caixa Postal 244
> Avenida dos Ramires, s/n
> Bairro: Distrito Industrial
> Cáceres - MT CEP: 78.200-000
> Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO)
> e-mails:alexandresantosbr em yahoo.com.br
> alexandre.santos em cas.ifmt.edu.br
> ======================================================================
>
>
> Em 23/06/2013 18:10, edmar Caldas escreveu:
>>
>> Olá, Um pergunta é possível fazer uma georeferencia (mapa) através do
>> R igual ou parecido a do google. Se sim alguém tiver um código agradeço.
>>
>>
>>
>> _______________________________________________
>> R-br mailing list
>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
>> forneça código mínimo reproduzível.
>
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL:
> <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130623/415e4147/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 6
> Date: Sun, 23 Jun 2013 20:29:28 -0400
> From: ASANTOS <alexandresantosbr em yahoo.com.br>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br, Wirton Macedo Coutinho
> <wirton_coutinho em yahoo.com.br>
> Subject: Re: [R-br] Contrastes para interação significativa em GLM
> Message-ID: <51C792E8.1050800 em yahoo.com.br>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"
>
> Boa noite Wirton,
>
> Vejo problemas com o seu modelo:
> Em summary(g0), o Residual deviance: 431.11 on 36 degrees of freedom
> esta com sobre dispersão e se fizer plot(m0), especificamente no gráfico
> Normal Q-Q versus Desvio padrão residual vera que o ajuste não ficou
> bom. Veja também que sua variável resposta da$y são dados contínuos e
> não discretos e não existe 0 na distribuição de Poisson.
>
> Abraço,
>
> --
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> Alexandre dos Santos
> Proteção Florestal
> Coordenador do curso Técnico em Florestas
> Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal
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> alexandre.santos em cas.ifmt.edu.br
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>
>
>
> Em 23/06/2013 20:08, Wirton Macedo Coutinho escreveu:
>> Boa noite a todos,
>>
>> Tenho um conjunto de dados em arranjo fatorial que não atendem as
>> pressuposições de normalidade e homocesdacidade de variâncias. Para
>> contornar esse problema, optei por fazer a análise do mesmo por GLM;
>> no entanto,como houve efeito significativo da interação, fiquei na
>> dúvida de como proceder para fazer o desdobramento e fazer comparações
>> múltiplas entre os tratamentos.
>>
>> Pesquisando na internet, encontrei um post que recomendava fazê-lo por
>> meio de constrastes utilizando o pacote multcomp. Assim o fiz (como
>> vcs podem conferir pelo código abaixo). No entanto, como migrei
>> recentemente para o R, surgiu a dúvida se isso que fiz está correto ou
>> não. Assim, gostaria da opinião de vcs sobre o código ou se tem uma
>> outra forma de fazê-lo.
>>
>>
>> da <- expand.grid(rep=1:4, isol=factor(1:6), cult=factor(1:2))
>> da$y <- c(4.5, 25.5, 8.5, 12, 123, 19.5, 111.5, 83.5, 10, 4, 4.5,
>> 90.5, 46.5, 61.5, 20.5, 33.5, 47.5, 39, 131.5, 68.5, 4,
>> 10, 13.5, 10, 9, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 12.5, 4.5, 6.5,
>> 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0.5, 0, 2, 2, 0.5, 0.5)
>>
>> g0 <- glm(y~isol + cult + isol:cult, family=poisson, data=da)
>> summary(g0)
>> anova(g0, test="Chisq")
>>
>> isolcult <- interaction(da$isol, da$cult, drop=TRUE)
>> m0 <- glm(da$y~isolcult, family=poisson)
>> require(multcomp)
>> glht.m0 <- glht(m0, mcp(isolcult = "Tukey"))
>> summary(glht.m0)
>>
>>
>> Certo de contar com a boa vontade de todos, agradeço antecipadamente.
>>
>> Att.,
>>
>> --
>> Wirton Macedo Coutinho
>> Pesquisador Fitopatologia
>> Embrapa Algodão
>> Rua Oswaldo Cruz, 1143, Centenário
>> Campina Grande PB
>> CEP 28428-095
>>
>>
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>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
>> forneça código mínimo reproduzível.
>
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> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL:
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>
> ------------------------------
>
> Message: 7
> Date: Sun, 23 Jun 2013 21:32:28 -0300
> From: "edmar Caldas" <edmar_caldas em yahoo.com.br>
> To: <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: [R-br] RES: Geoprocessamento
> Message-ID: <000c01ce7072$500a5480$f01efd80$@yahoo.com.br>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Sou meio leigo nesta parte , qual pacote você está usando?
>
> Ou está acessando direto o google. Ajudou sim, mas não entendi muito.
>
>
>
> Preciso de mais detalhe, tipo tutorial seria bom
>
>
>
>
>
>
>
>
>
> De: R-br [mailto:r-br-bounces em listas.c3sl.ufpr.br] Em nome de ASANTOS
> Enviada em: domingo, 23 de junho de 2013 21:19
> Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Assunto: Re: [R-br] Geoprocessamento
>
>
>
> Edmar,
> Segue um exemplo simples:
>
> #
> #Vértices da área em utm
> limitex<-c(310141.62,310320.65,310347.07,310166.98,310141.62)
> limitey<-c(8295898.01,8295923.64,8295791.84,8295765.39,8295898.01)
> #
> ##Visualização
> require(sp)
> Pontos <- SpatialPointsDataFrame(SpatialPoints(cbind(limitex,limitey)),
> data=data.frame(ID=1:length(limitex)))
> proj4string(Pontos) <- CRS("+proj=utm +zone=21 +south +datum=WGS84 +units=m
> +no_defs")
> require(plotGoogleMaps)
> plotGoogleMaps(Pontos)
> #
> Espero ter ajudado,
>
>
>
> --
> ======================================================================
> Alexandre dos Santos
> Proteção Florestal
> Coordenador do curso Técnico em Florestas
> Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal
> IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
> Campus Cáceres
> Caixa Postal 244
> Avenida dos Ramires, s/n
> Bairro: Distrito Industrial
> Cáceres - MT CEP: 78.200-000
> Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO)
> e-mails:alexandresantosbr em yahoo.com.br
> alexandre.santos em cas.ifmt.edu.br
> ======================================================================
>
>
>
> Em 23/06/2013 18:10, edmar Caldas escreveu:
>
>
>
>
>
> Olá, Um pergunta é possível fazer uma georeferencia (mapa) através do R
> igual ou parecido a do google. Se sim alguém tiver um código agradeço.
>
>
>
>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código
> mínimo reproduzível.
>
>
>
>
>
>
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL:
> <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130623/a1a66a42/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 8
> Date: Mon, 24 Jun 2013 10:34:46 +0100
> From: alanarocha em sapo.pt
> To: sandro.matos em vodafone.com, R-br em listas.c3sl.ufpr.br,
> rcoster em gmail.com
> Subject: [R-br] olá leitura de ficheiros no R
> Message-ID:
> <20130624103446.Horde.tRvVbXCXF3VRyBK2XFHWs0A em mail.sapo.pt>
> Content-Type: text/plain; charset=UTF-8; format=flowed; DelSp=Yes
>
> Olá,
> quando leio o ficheiro que envio em anexo o R vai considerar que os
> dados estão em colunas ou em linhas.
> Como posso distinguir essa diferença para poder padronizar os dados.
>
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 9
> Date: Mon, 24 Jun 2013 07:11:55 -0300
> From: Marcelo Laia <marcelolaia em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] olá leitura de ficheiros no R
> Message-ID: <20130624101155.GG8073 em localhost>
> Content-Type: text/plain; charset=iso-8859-1
>
> Olá.
>
> A lista não aceita anexos.
>
> Por favor, disponibilize o arquivo que você deseja anexar em um
> compartilhamento virtual (dropbox - veja link abaixo -, pastebin,
> 4shared, google drive, etc) e envie o link para a lista.
>
> Para instalar o dropbox (que eu utilizo e recomendo), visite o link abaixo:
>
> http://db.tt/iduTtNp
>
> Caso você se cadastrar por meio do link acima, eu ganharei 16Gb na
> minha conta dropbox a mais de espaço.
>
> Marcelo
>
> On 24/06/13 at 10:34am, alanarocha em sapo.pt wrote:
>> Olá,
>> quando leio o ficheiro que envio em anexo o R vai considerar que os
>> dados estão em colunas ou em linhas.
>> Como posso distinguir essa diferença para poder padronizar os dados.
>>
>> _______________________________________________
>> R-br mailing list
>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
>> forneça código mínimo reproduzível.
>
> --
> Marcelo
> Brasil (Brazil, for English Speakers)
> Linux user number 487797
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 10
> Date: Mon, 24 Jun 2013 08:26:14 -0300
> From: Rodrigo Coster <rcoster em gmail.com>
> To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] olá leitura de ficheiros no R
> Message-ID:
> <CAKU4wouztf7g09qp-6UO+btDk7Utp11s-xGKPB_zXZt+ioCpbw em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Ana,
>
> os comandos padrões de leitura do R vão sempre interpretar desta maneira:
>
> Colunas: Variaveis
> Linhas: Observações/Título de variáveis (1a linha, dependendo do parâmetro
> header)
>
>
> 2013/6/24 Marcelo Laia <marcelolaia em gmail.com>
>
>> Olá.
>>
>> A lista não aceita anexos.
>>
>> Por favor, disponibilize o arquivo que você deseja anexar em um
>> compartilhamento virtual (dropbox - veja link abaixo -, pastebin,
>> 4shared, google drive, etc) e envie o link para a lista.
>>
>> Para instalar o dropbox (que eu utilizo e recomendo), visite o link abaixo:
>>
>> http://db.tt/iduTtNp
>>
>> Caso você se cadastrar por meio do link acima, eu ganharei 16Gb na
>> minha conta dropbox a mais de espaço.
>>
>> Marcelo
>>
>> On 24/06/13 at 10:34am, alanarocha em sapo.pt wrote:
>> > Olá,
>> > quando leio o ficheiro que envio em anexo o R vai considerar que os
>> > dados estão em colunas ou em linhas.
>> > Como posso distinguir essa diferença para poder padronizar os dados.
>> >
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>> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
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>> Brasil (Brazil, for English Speakers)
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>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL:
> <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130624/60c466ff/attachment.html>
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> Subject: Legenda do Digest
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> Fim da Digest R-br, volume 30, assunto 35
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