[R-br] Contrastes para interação significativa em GLM

Wirton Macedo Coutinho wirton_coutinho em yahoo.com.br
Domingo Junho 23 21:08:39 BRT 2013


Boa noite a todos,

Tenho um conjunto de dados em arranjo fatorial que não atendem as pressuposições de normalidade e homocesdacidade de variâncias. Para contornar esse problema, optei por fazer a análise do mesmo por GLM; no entanto,como houve efeito significativo da interação, fiquei na dúvida de como proceder para fazer o desdobramento e fazer comparações múltiplas entre os tratamentos.

Pesquisando na internet, encontrei um post que recomendava fazê-lo por meio de constrastes utilizando o pacote multcomp. Assim o fiz (como vcs podem conferir pelo código abaixo). No entanto, como migrei recentemente para o R, surgiu a dúvida se isso que fiz está correto ou não. Assim, gostaria da opinião de vcs sobre o código ou se tem uma outra forma de fazê-lo.


da <- expand.grid(rep=1:4, isol=factor(1:6), cult=factor(1:2))
da$y <- c(4.5, 25.5, 8.5, 12, 123, 19.5, 111.5, 83.5, 10, 4, 4.5,
           90.5, 46.5, 61.5, 20.5, 33.5, 47.5, 39, 131.5, 68.5, 4,
           10, 13.5, 10, 9, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 12.5, 4.5, 6.5,
           1, 0, 0, 1, 0, 0, 0.5, 0, 2, 2, 0.5, 0.5)

g0 <- glm(y~isol + cult + isol:cult, family=poisson, data=da)
summary(g0)
anova(g0, test="Chisq")

isolcult <- interaction(da$isol, da$cult, drop=TRUE)
m0 <- glm(da$y~isolcult, family=poisson)
require(multcomp)
glht.m0 <- glht(m0, mcp(isolcult = "Tukey"))
summary(glht.m0)


Certo de contar com a boa vontade de todos, agradeço antecipadamente.

Att.,

--
Wirton Macedo Coutinho
Pesquisador Fitopatologia
Embrapa Algodão
Rua Oswaldo Cruz, 1143, Centenário
Campina Grande PB
CEP 28428-095
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