[R-br] GEE2 - dados correlacionados no espaço

Sexta Fevereiro 1 21:01:48 BRST 2013

Prezados colegas,
preciso de um script do R, caso alguém tenha, de um exemplo que contemple uma avaliação de pontos (oriundos de riqueza e abundancia spp) distribuidos no espaço. Creio que o pacote GEE2 do R seria a ferramenta mais adequada por se tratar de dados possivelmente correlacionados no espaço.
Agradeço a atenção de todos

Márcio

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 De: "r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br>
Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br 
Enviadas: Sexta-feira, 1 de Fevereiro de 2013 11:00
Assunto: Digest R-br, volume 24, assunto 1

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Tópicos de Hoje:

   1. Nayara Santos is out of the office. (Nayara Santos)
   2. Informação: R como software livre... (andrebvs em bol.com.br)
   3. Re: Informação: R como software livre... (Manoel Galdino)
   4. Gráfico dupla entrada (Stephan M. CARVALHO)
   5. Re: Gráfico dupla entrada (Paulo Justiniano)
   6. Re: Índice fora de limites (Leonard de Assis)
   7. Re: Gráfico dupla entrada (Luciano F. Sgarbi)
   8. Re: Informação: R como software livre... (Leonard de Assis)
   9. Re: Informação: R como software livre... (Manoel Galdino)
  10. Re: Gráfico dupla entrada (Stephan M. CARVALHO)

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Message: 1
Date: Thu, 31 Jan 2013 15:03:11 -0300
From: Nayara Santos <nayara.santos em br.zurich.com>
To: r-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Nayara Santos is out of the office.
Message-ID:
    <OF50BC777C.036D38FD-ON83257B04.00632B35-83257B04.00632B35 em email.zurich.com>

Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1

I will be out of the office starting  30/01/2013 and will not return until
14/02/2013.

Gentileza entrar em contato com:
Flávia Novaes para testes.
Marcelo Prieto e Vicente Venancio para definições, dúvidas e aprovações.

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Message: 2
Date: Thu, 31 Jan 2013 17:47:00 -0200
From: andrebvs em bol.com.br
To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Informação: R como software livre...
Message-ID: <510aca34847f8_356468b6c7093e em a4-winter20.tmail>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

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Message: 3
Date: Thu, 31 Jan 2013 17:51:47 -0200
From: Manoel Galdino <mcz.fea em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Informação: R como software livre...
Message-ID:
    <CA+kPArkJSN773t+G=VFTzpRBY4eSrH5ZxTY-rQ4DXmFc0HDykw em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Para todos os itens:
1. Redução de custos ( o R é grátis, exceto pelo Revolutions)
2. Por ter código aberto, é mais fácil checar a análise feita.

Para pesquisa:
A comunidade de usuários dá tanto suporte que ajuda o pesquisador a criar
laços com outros pesquisadores

abçs
Manoel

2013/1/31 <andrebvs em bol.com.br>

> Olá à todos!
>
> O programa R, sem dúvida, é a ferramenta estatística ideal nas mãos de
> quem o conhece, mas, porque universidades ainda insistem em utilizar
> programas comerciais (propriétarios) em seus laboratórios? acredito que
> esse fato, ainda seja pela falta de interesse de professores
> "tradicionalistas" que não instigam mudanças (inovações) na forma de
> ensino. Talvez, falta a esses professores, a informação sobre os beneficios
> que os softwares livres trazem para a instituição e para o governo. Então,
> diante disso, como justificar o uso do programa R como software livre em
> cada uma das etapas a seguir dentro das Universidades:
>
> 1) ensino
> 2) pesquisa
> 3) extensão
>
> desde já agradeço!
>
> *Att.*
> *André*
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>

-- 
Manoel Galdino
https://sites.google.com/site/galdinomcz/
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Message: 4
Date: Fri, 01 Feb 2013 11:37:59 -0300
From: "Stephan M. CARVALHO" <smalfitano em uol.com.br>
To: R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Gráfico dupla entrada
Message-ID: <510BD347.7050209 em uol.com.br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"

Bom dia pessoal,

     Preciso plotar dados em um gráfico de dupla entrada, como ocorre 
por exemplo com dados climatológicos (temperatura/precipitação ~ tempo).

     Por acaso alguém conhece alguma forma de fazer?

     Obrigado,

     Stephan

-- 

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               STEPHAN M. CARVALHO

     "Honeybee protection and ecotoxicology"

        Universidade Estadual Paulista
      Centro de Estudo de Insetos Sociais

               Av. 24A, 1515
                Bela Vista
          13.506-900 Rio Claro/SP
                    Brazil

           smalfitano em uol.com.br

+55 19 3526-4284 (university)
+55 19 3534-8523 (fax)
+55 35 9103-9822 (mobile)
+55 35 9949-0707 (mobile)

Antes de imprimir, pense no ambiente!
Before printing, think in the environment!
Avant d'imprimer, pensez à l'environnement!

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Tipo: text/x-vcard
Tamanho: 352 bytes
Descrição: não disponível
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130201/ba8d54f0/attachment-0001.vcf>

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Message: 5
Date: Fri, 1 Feb 2013 09:10:36 -0200 (BRST)
From: Paulo Justiniano <paulojus em leg.ufpr.br>
To: R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] Gráfico dupla entrada
Message-ID: <alpine.DEB.2.00.1302010907590.7577 em pataxo.est.ufpr.br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"

O segredo está em usar par(new=T) npara justapor gráficos
O exemplo a seguir foi tirado dos arquivos da lista
http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Grafico-com-dois-eixos-y-outra-solucao-mais-simples-td3384529.html

x <- 1:20
x1 <- rnorm(20)
x2 <- rpois(20, lam=50)
plot(x, x1, type="l")
par(new=T)
plot(x, x2, type="l", axes=F, frame=T, ann=F, col=2)
axis(4)

e um exemplo mais completo tb apontado em um email da lista:
http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-graficos-com-dois-eixos-y-td3566075.html
sugere procurar em:
http://www.leg.ufpr.br/doku.php/ridiculas
por
Gráfico com dois eixos coordenados

On Fri, 1 Feb 2013, Stephan M. CARVALHO wrote:

> Bom dia pessoal,
>
>
>    Preciso plotar dados em um gráfico de dupla entrada, como ocorre por 
> exemplo com dados climatológicos (temperatura/precipitação ~ tempo).
>
>    Por acaso alguém conhece alguma forma de fazer?
>
>    Obrigado,
>
>
>    Stephan
>
>
> -- 
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Message: 6
Date: Fri, 01 Feb 2013 09:36:18 -0200
From: Leonard de Assis <assis.leonard em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Índice fora de limites
Message-ID: <510BA8B2.4000401 em gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"

Pela quantidade de observações (192) e o número de respostas possíveis 
(7), e o número de itens (22),é bem provável que algum item seu não 
tenha algum dos níveis.

será que SETE níveis são mesmo necessários?

Em 30/01/2013 21:45, Thiago de Andrade escreveu:
> Leonard,
> Não postei o CMR porque não tenho como disponibilizar os dados. É uma 
> matriz 22 (itens) x192 (sujeitos), assumindo valores entre 1 e 7. Não 
> há dados omissos nem fora desse intervalo (1-7). Você acha que a baixa 
> frequência de alguns vaalores pode estar causando o erro? (desculpa 
> minha ignorância, sou só um psicólogo rsrs).
>
> Em 30 de janeiro de 2013 20:40, Leonard de Assis 
> <assis.leonard em gmail.com <mailto:assis.leonard em gmail.com>> escreveu:
>
>     Thiago,
>     não lembro mais como é a codificação das variáveis pra rodar TRI
>     no LTM, mas o erro (vc não postou CMR, portanto é chute)  tem toda
>     a cara de codificação errada em alguma variável.
>
>     Em 30/01/2013 19:18, Thiago de Andrade escreveu:
>>     Amigos, estou tentando rodar uns dados de um amigo com o pacote
>>     ltm, (Teoria da Resposta ao Item). Estou recebendo uma mensagem
>>     de erro "índice fora de limites". Algum de vocês pode me dar
>>     alguma luz acerca da localização deste problema?
>>
>>     Obrigado.
>>
>>     -- 
>>     Thiago de Andrade
>>     Mestrando em Psicologia Social, PPGP-UFPB
>>     Núcleo de Pesquisas em Desenvolvimento Sócio-Moral (NPDSM)
>>     (83) 9642 4099
>>
>>
>>
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>>     R-br mailing list
>>    R-br em listas.c3sl.ufpr.br  <mailto:R-br em listas.c3sl.ufpr.br>
>>    https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>     Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
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>    https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>     Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
>     forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>
>
> -- 
> Thiago de Andrade
> Mestrando em Psicologia Social, PPGP-UFPB
> Núcleo de Pesquisas em Desenvolvimento Sócio-Moral (NPDSM)
> (83) 9642 4099
>
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Message: 7
Date: Fri, 1 Feb 2013 09:37:30 -0200
From: "Luciano F. Sgarbi" <luciano.f.sgarbi em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Gráfico dupla entrada
Message-ID:
    <CAJpKj8kaKxN-y3e2MgozV9A1=HRTOA7ZKbigfjwu6uZr_ZyY5Q em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Olá Stephan,
Dê uma olhada nesse site (http://gallery.r-enthusiasts.com/)
Com certeza você vai encontrar.
Abraços,
Luciano

Em 1 de fevereiro de 2013 12:37, Stephan M. CARVALHO
<smalfitano em uol.com.br>escreveu:

> Bom dia pessoal,
>
>
>     Preciso plotar dados em um gráfico de dupla entrada, como ocorre por
> exemplo com dados climatológicos (temperatura/precipitação ~ tempo).
>
>     Por acaso alguém conhece alguma forma de fazer?
>
>     Obrigado,
>
>
>     Stephan
>
>
> --
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>

-- 

*Luciano F. Sgarbi*

Mestrando em Ecologia e Evolução
Laboratório de Ecologia de Insetos (sl. 222)
Departamento de Ecologia
Instituto de Ciências Biológicas - ICB 1
Universidade Federal de Goiás, campus II
Goiânia-GO
74001-970
Brazil
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Message: 8
Date: Fri, 01 Feb 2013 09:42:18 -0200
From: Leonard de Assis <assis.leonard em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Informação: R como software livre...
Message-ID: <510BAA1A.6030504 em gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"

uso academico, o RevoR também é gratis
Em 31/01/2013 17:51, Manoel Galdino escreveu:
> Para todos os itens:
> 1. Redução de custos ( o R é grátis, exceto pelo Revolutions)
> 2. Por ter código aberto, é mais fácil checar a análise feita.
>
> Para pesquisa:
> A comunidade de usuários dá tanto suporte que ajuda o pesquisador a 
> criar laços com outros pesquisadores
>
> abçs
> Manoel
>
> 2013/1/31 <andrebvs em bol.com.br <mailto:andrebvs em bol.com.br>>
>
>     Olá à todos!
>
>     O programa R, sem dúvida, é a ferramenta estatística ideal nas
>     mãos de quem o conhece, mas, porque universidades ainda insistem
>     em utilizar programas comerciais (propriétarios) em seus
>     laboratórios? acredito que esse fato, ainda seja pela falta de
>     interesse de professores "tradicionalistas" que não instigam
>     mudanças (inovações) na forma de ensino. Talvez, falta a esses
>     professores, a informação sobre os beneficios que os softwares
>     livres trazem para a instituição e para o governo. Então, diante
>     disso, como justificar o uso do programa R como software livre em
>     cada uma das etapas a seguir dentro das Universidades:
>
>     1) ensino
>     2) pesquisa
>     3) extensão
>     desde já agradeço!
>     /Att./
>     /André/
>
>     _______________________________________________
>     R-br mailing list
>    R-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br em listas.c3sl.ufpr.br>
>    https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>     Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
>     forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>
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> -- 
> Manoel Galdino
> https://sites.google.com/site/galdinomcz/
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Message: 9
Date: Fri, 1 Feb 2013 09:57:47 -0200
From: Manoel Galdino <mcz.fea em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Informação: R como software livre...
Message-ID:
    <CA+kPArkb57RT3cNupTjuG3BMiAt_BCfEx6+ZWQN1HPm=AmBfXw em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

é verdade!
abç
M

2013/2/1 Leonard de Assis <assis.leonard em gmail.com>

>  uso academico, o RevoR também é gratis
> Em 31/01/2013 17:51, Manoel Galdino escreveu:
>
> Para todos os itens:
> 1. Redução de custos ( o R é grátis, exceto pelo Revolutions)
> 2. Por ter código aberto, é mais fácil checar a análise feita.
>
>  Para pesquisa:
> A comunidade de usuários dá tanto suporte que ajuda o pesquisador a criar
> laços com outros pesquisadores
>
>  abçs
> Manoel
>
> 2013/1/31 <andrebvs em bol.com.br>
>
>> Olá à todos!
>>
>>  O programa R, sem dúvida, é a ferramenta estatística ideal nas mãos de
>> quem o conhece, mas, porque universidades ainda insistem em utilizar
>> programas comerciais (propriétarios) em seus laboratórios? acredito que
>> esse fato, ainda seja pela falta de interesse de professores
>> "tradicionalistas" que não instigam mudanças (inovações) na forma de
>> ensino. Talvez, falta a esses professores, a informação sobre os beneficios
>> que os softwares livres trazem para a instituição e para o governo. Então,
>> diante disso, como justificar o uso do programa R como software livre em
>> cada uma das etapas a seguir dentro das Universidades:
>>
>> 1) ensino
>> 2) pesquisa
>> 3) extensão
>>
>> desde já agradeço!
>>
>> *Att.*
>> *André*
>>
>> _______________________________________________
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>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
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>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
>
>
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> Manoel Galdino
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>

-- 
Manoel Galdino
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Message: 10
Date: Fri, 01 Feb 2013 13:12:01 -0300
From: "Stephan M. CARVALHO" <smalfitano em uol.com.br>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Gráfico dupla entrada
Message-ID: <510BE951.4060808 em uol.com.br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"

     Obrigado pessoal!

     Agora sim posso finalizar meu paper!!!

     Att,

     Stephan

Em 1/2/2013 08:10, Paulo Justiniano escreveu:
> O segredo está em usar par(new=T) npara justapor gráficos
> O exemplo a seguir foi tirado dos arquivos da lista
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Grafico-com-dois-eixos-y-outra-solucao-mais-simples-td3384529.html 
>
>
> x <- 1:20
> x1 <- rnorm(20)
> x2 <- rpois(20, lam=50)
> plot(x, x1, type="l")
> par(new=T)
> plot(x, x2, type="l", axes=F, frame=T, ann=F, col=2)
> axis(4)
>
> e um exemplo mais completo tb apontado em um email da lista:
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-graficos-com-dois-eixos-y-td3566075.html 
>
> sugere procurar em:
> http://www.leg.ufpr.br/doku.php/ridiculas
> por
> Gráfico com dois eixos coordenados
>
>
>
>
>
> On Fri, 1 Feb 2013, Stephan M. CARVALHO wrote:
>
>> Bom dia pessoal,
>>
>>
>>    Preciso plotar dados em um gráfico de dupla entrada, como ocorre 
>> por exemplo com dados climatológicos (temperatura/precipitação ~ tempo).
>>
>>    Por acaso alguém conhece alguma forma de fazer?
>>
>>    Obrigado,
>>
>>
>>    Stephan
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               STEPHAN M. CARVALHO

     "Honeybee protection and ecotoxicology"

        Universidade Estadual Paulista
      Centro de Estudo de Insetos Sociais

               Av. 24A, 1515
                Bela Vista
          13.506-900 Rio Claro/SP
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          smalfitano em uol.com.br

+55 19 3526-4284 (university)
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