[R-br] Modelo Random Forest em ambiente de produção.

Elias Teixeira Krainski eliaskrainski em yahoo.com.br
Segunda Agosto 19 15:23:12 BRT 2013


Fabrício,

O randomForest tem suas principais funções implementadas em C.  É 
possível um programa standalone em C para chamar essas funções. Veja o 
código fonte do pacote para isso.

Veja também classes em C++ feitas para funções C desse pacote em
https://code.google.com/p/randomforest-matlab/source/browse/trunk/RF_Class_C/src/
emboram sejam para serem chamadas em matlab, fica a idéia.

Att.
Elias.

On 19/08/13 20:10, Fabrício Barth wrote:
> Escrever um componente que lê a estrutura de árvores do randomForest e 
> cria uma estrutura em ruby/python é factível. No entanto, eu queria 
> ter certeza que não existam componentes que façam isto antes de 
> começar a implementação de um componente novo.
>
> Manoel, você conhece algo que converte um modelo em R para python?
>
> Valeu!
>
>
> 2013/8/19 Manoel Galdino <mcz.fea em gmail.com <mailto:mcz.fea em gmail.com>>
>
>     Talvez seja mais fácil vc implementar em python, e depois chamar o
>     python do ruby?
>
>     Ou então, usa o r só pra privatização mesmo e reimplementa no ruby.
>
>     Abçs
>     M
>
>     Em 19/08/2013 13:35, "Fabrício Barth" <fabricio.barth em gmail.com
>     <mailto:fabricio.barth em gmail.com>> escreveu:
>
>         Pessoal,
>
>         Usei o algoritmo randomForest do pacote
>         http://cran.r-project.org/web/packages/randomForest/randomForest.pdf para
>         criar um classificador com 80% de acurácia. Quero utilizar
>         este modelo (classificador) em ambiente de produção, integrado
>         a uma aplicação escrita em Ruby.
>
>         Para implementar a integração eu já fiz alguns testes com:
>
>         1) RApache: http://rapache.net/
>         2) Rserver: http://www.rforge.net/Rserve/doc.html
>         3) RinRuby: https://sites.google.com/a/ddahl.org/rinruby-users/
>         4) RScript:
>         http://stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/utils/html/Rscript.html
>         5) R com a opção "-e EXPR" via bash do unix.
>         6) Exportar o modelo usando PMML
>         (http://journal.r-project.org/archive/2009-1/RJournal_2009-1_Guazzelli+et+al.pdf)
>         e importá-lo no ruby.
>
>         No entanto, nenhuma das opções é rápida e robusta o sufiente
>         para processar 4e+09 requisições em no máximo 4 horas. Aliás,
>         se eu fosse fazer um ranking das opções, eu diria que em
>         primeiro lugar está "R com a opção "-e EXPR" via bash do
>         unix", seguido por RScript, depois RinRuby e depois todas as
>         outras alternativas.
>
>         A parte em Ruby já foi desenvolvida para processar
>         paralelamente em várias máquinas. No entanto, o gargalo da
>         aplicação está sendo a execução do modelo em R.
>
>         Alguém conhece alguma forma para converter um modelo preditivo
>         em R (no caso, randomForest) para uma estrutura em C ou Ruby?
>
>         Valeu!
>         -- 
>         Fabrício J. Barth
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>         Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
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