[R-br] Arquivos hdf

[Thiago V. dos Santos]

Tito, 

Você pode mostrar a imagem que está tentando abrir?

Idealmente, importá-la no R deveria ser tão fácil quanto isso:

library(raster)
r <- raster('A20072132007243.L3m_MO_CHL_chlor_a_4km')
 
Porém, dependendo de como o hdf estiver organizado, o mais recomendado é usar o gdal_translate para converter a banda que você quer em um formato mais acessível, digamos .tif:

system('gdal_translate -of GTiff HDF4_SDS:SEAWIFS_L2:"S2006365040146.L2_GAC_OC":26 /home/thiago/Downloads/seawifs.tif')
library(raster)
r<-raster('seawifs.tif')

O comando acima converterá a banda 26 do arquivo S2006365040146.L2_GAC_OC no arquivo seawifs.tif, que depois é facilmente aberto pelo raster.

Você pode ver as bandas disponíveis no HDF usando o gdalinfo ou abrindo o arquivo no QGIS. Você precisará instalar o GDAL para usar essas ferramentas. Se estiver no ubuntu, o pacote é o gdal-bin.

Saudações,
--
Thiago V. dos Santos
PhD student
Land and Atmospheric Science
University of Minnesota
http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm
Phone: (612) 323 9898


________________________________
 From: Tito Conte <tito.conte em gmail.com>
To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>; Thiago V. dos Santos <thi_veloso em yahoo.com.br> 
Sent: Monday, August 12, 2013 8:03 PM
Subject: Re: [R-br] Arquivos hdf
 


Benilton, o hdf5 não abre o arquivo

Thiago os arquivos são do seawifs, ao que parece não tem que processar a imagem, o problema é abri-los mesmo


Tito Conte
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