[R-br] Ajuda para criar um grafico

Heloíse Pavanato helopavanato em gmail.com
Quinta Outubro 25 13:30:39 BRST 2012


Use barplot (........,xaxt='n') para excluir os números.

Att,
Heloise

Em 25 de outubro de 2012 13:18, Humberto <hghazin em hotmail.com> escreveu:

>  Olá Andre, Ivan e Leonard
>
> Muito obrigado pela ajuda! eu consegui dessa forma aqui! Porém no eixo dos
> x esta aperecendo numeros que se sobrepostos aos nomes das espécies que não
> estou conseguindo retirar. Alguem poderia me ajudar nesse sentido!
>
> Gostei dessa alternativa do forestplot. Como faço para retirar esse
> background (cinza) do forestplot e adicionar a linha vertical no 1?
>
> E mais uma vez obrigado a todos pela ajuda
>
> tableMat1a é a tabela abaixo
>
>                     Specie    lci     or   uci
> 1             Bigeye tuna 0.0952 0.1293 0.176
> 2          Yellowfin tuna 0.0916 0.1255 0.172
> 3                Albacore 0.0913 0.1562 0.267
> 4               Swordfish 0.1311 0.1565 0.187
> 5                Sailfish 0.0368 0.0923 0.231
> 6            White marlim 0.1300 0.2161 0.359
> 7             Blue marlim 0.0738 0.1471 0.293
> 8              Blue shark 0.1303 0.1653 0.210
> 9         Crocodile shark 0.1123 0.1792 0.286
> 10       Pelagic stingray 0.1074 0.2052 0.392
> 11           Turtle oliva 0.1275 0.3802 1.134
> 12 Oceanic whitetip shark 0.1658 0.3788 0.866
>
>
>
> par(mar=c(2, 8, 0, 0))
> y.axis <- c(length(tableMat1a$or):1)
> plot(tableMat1a$or,y.axis, type = "p", axes = F, xlab = "", ylab = "", pch
> = 19, cex = 1.2,
>      xlim = c(0,1.2), xaxs = "r", main = "")
> segments(tableMat1a$lci, y.axis, tableMat1a$uci, y.axis, lwd =  1.5)
> axis(1, at = seq(0,1.2,by=0.2), labels = NA, tick = T,
>      cex.axis = 1.2, mgp = c(2,.7,0))
> axis(2, at = y.axis, label = tableMat1a$Specie, las = 1, tick = F, ,mgp =
> c(2,.6,0),cex.axis = 1.2)
> segments(1,1,1,30,lty=1)
>
>
>
>
>
>
>
>
>
> Em 10/25/2012 12:09 AM, Leonard de Assis escreveu:
>
> Andre,
>
> vi a pouco na lista do ggplot2 um script que pode ser o que voce procura.
>
> # d is a data frame with 4 columns
> # d$x gives variable names
> # d$y gives center point
> # d$ylo gives lower limits
> # d$yhi gives upper limits
> forestplot <- function(d, xlab="Odds Ratio", ylab="Study"){
>   require(ggplot2)
>   p <- ggplot(d, aes(x=x, y=y, ymin=ylo, ymax=yhi)) +
>     geom_pointrange() +
>     coord_flip() +
>     geom_hline(aes(x=0), lty=2) +
>     ylab(xlab) +
>     xlab(ylab) #switch because of the coord_flip() above
>   return(p)
> }
>
> # Create some dummy data.
> d <- data.frame(x = toupper(letters[1:10]),
>                 y = rnorm(10, .05, 0.1))
> d <- transform(d, ylo = y-1/10, yhi=y+1/10)
>
> forestplot(d)
>
> []s
> Leonard de Assis
> assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com
>
> Em 24/10/2012 23:55, andrebvs escreveu:
>
> Olá Humberto!
>
> Eu até começei a fazer o que estava querendo, porém, não consegui
> implementar os intervalos de confianças com as respectivas médias. Segue um
> script abaixo até onde cheguei, se alguém puder continuar e sanar sua
> dúvida, seria uma grande ajuda!
>
> library(fields)
> plot(xlim=c(0,1.8),5:10, bty='n',type="n",axes=F,xlab="Relative
> catchability",ylab="")
> x <- seq(0.0,1.8,by=0.2)
> y <- seq(5,14)
> u <- 1
> v <- 50
>
> axis(1,lwd=2,at = x,labels = formatC(x, format="fg"))
> abline(v = 1, col = "black",lty=1,lwd=2)
> arrow.plot(x[6],y[6],v,u,arrow.ex=.4, length=.2, col='black', lwd=2)
> arrow.plot(x[6],y[6],u-360,v-45,arrow.ex=.5, length=.2, col='black',
> lwd=2)
>
> text(0,7,"Bigeye\nYellowfin tuna\nAlbacore\nSwordfish\nSailfish\nWhite
> marlim\nBlue marlim\nBlue shark\nCrocodile shark\nPelagic stingray\nTurtle
> oliva\nOceanic whitetip shark",cex = 0.8,adj=c(0,0))
>
> text(1.1,5,"Species\nBigeye tuna\nYellowfin
> tuna\nAlbacore\nSwordfish\nSailfish\nWhite marlim\nBlue marlim\nBlue
> shark\nCrocodile shark\nPelagic stingray\nTurtle oliva\nOceanic whitetip
> shark",cex = 0.8,adj=c(0,0))
>
>
>  *Att.*
> *André Barbosa Ventura da Silva*
>
>
> ------------------------------
> Em 24/10/2012 20:38, *Ivan Bezerra Allaman < ivanalaman em yahoo.com.br >*escreveu:
>  Utilize as funções plot, segments e par para obter êxito! O link abaixo
> será útil também.
>
> http://gallery.r-enthusiasts.com/
>
> (S,f,P)
>  Allaman
>
> * *
> \begin{signature}
> <<>>=
> Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman
> Universidade Estadual de Santa Cruz
> Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas
> Ilhéus/BA - Brasil
> Fone: +55 73 3680-5596
> E-mail: ivanalaman em yahoo.com.br/ivanalaman em gmail.com
> @
> \end{signature}
>
>
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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