[R-br] Blocos com algumas repetições do material

[Fabio Mathias Corrêa]

Não tem bloco dentro de local?


Foi inteiramente casualizado?

Valeu!

 
        Fábio Mathias Corrêa


   Universidade Estadual de Santa Cruz
Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET


Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna
CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia


Tel.: 73-3680-5076


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 De: Walmes Zeviani <walmeszeviani em gmail.com>
Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br 
Enviadas: Domingo, 21 de Outubro de 2012 16:30
Assunto: Re: [R-br] Blocos com algumas repetições do material
 

Éder,

Agora entendi suas colocações. Bem, dessa maneira acredito que o modelo deva ser declarado dessa maneira.

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# modelo com efeito aleatório e local, cultivar, local:cultivar e resídual
# só é possível estimar resídual se haver repetições dentro de locais:cultivar

# número de níveis
nl <- 10; nc <- 8; nr <- 3
# efeitos aleatórios
l <- rnorm(nl,0,2);      # de local
c <- rnorm(nc,0,1.5);    # de cultivar
lc <- rnorm(nl*nc,0,1);  # de local:cultivar (interação genótipo:ambiente)
e <- rnorm(nl*(nc+nr),0,0.5) # residual, var entre rep no mesmo local:cult

# dados artificiais
da1 <- expand.grid(local=gl(nl,1), cultivar=gl(nc,1), r=1)
da2 <- expand.grid(local=gl(nl,1), cultivar=gl(nr,1), r=2)
da <- rbind(da1, da2)

# matriz de delineamento
Z <- with(da, cbind(model.matrix(~-1+local),
                    model.matrix(~-1+cultivar),
                    model.matrix(~-1+local:cultivar)))
dim(Z)
ranef <- c(l, c, lc)
length(ranef)
y <- Z%*%ranef+e

require(lme4)

m0 <- lmer(y~(1|local)+(1|cultivar)+(1|local:cultivar), data=da)
summary(m0)

#------------------------------------------------------------------------------------------

À disposição.
Walmes.
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Walmes Marques Zeviani
LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
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