[R-br] Cluster para r

[Benilton Carvalho]

no 'R normal', vc deve usar HDF5 ou NetCDF combinado com Rmpi para
trabalhar com volumes de dados maiores.


2012/11/18 Diogo Ferrari <diogoferrari em gmail.com>

> Oi Benilton
>
> Valeu pela dica. Eu me referia ao proc paralelo com o R revolution mesmo,
> não com o pacote rmpi. Fiz isso por causa do tamanho do banco que precisava
> utilizar, que com o R normal (carregando na memoria) seria muito
> problematico e impossível em certas tarefas.
>
> abs
>
>
> 2012/11/18 Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
>
>> Diogo, sua afirmação é incorreta. Eu uso o R diariamente em cluster MPI
>> sem problemas. Divido as tarefas sem problemas entre os nós.... Veja o
>> pacote Rmpi... Depois disso, vc pode começar a ver os outros pacotes
>> associados. b
>>  On 18 Nov 2012 14:07, "Diogo Ferrari" <diogoferrari em gmail.com> wrote:
>>
>>> Ola Regis,
>>>
>>> Já trabalhei, ou melhor, tentei trabalhar, com R operando em servidor
>>> linux. O principal problema é a divisão do processamento. Não é possível
>>> dividir o processamento entre os nós. é possível apenas dividir dentro do
>>> próprio núcleo do processador. Eu trabalhei com bases na casa de 20x10^9. A
>>> melhor solução que encontrei foi o RevolutionR, fazer proc. paralelo local
>>> e converter os arquivos para .xdf (usado pelo revolution). Se o seu
>>> problema é computar sobre os dados, e não fazer simulações por exemplo, vc
>>> tem que encontrar uma solução que permita isso. É mais um problema de
>>> geranciamento e acesso aos dados do que capaciadade de processamento. O R
>>> tradicional carrega tudo na memória e, portanto, limita o uso de big data.
>>> O .xdf e o RevolutionR solucionam isso permitindo trabalhar com os dados
>>> sem carregá-los, além de dividir e indexar o banco, como se faz em SQL, por
>>> exemplo. Mas isso vai depender do que vc precisa fazer com os dados. As
>>> funções disponível para o RevolutionR são as mais simples.estão no pacote
>>> RevoscaleR.
>>>
>>> abs
>>>
>>>
>>> 2012/11/18 regis barros <regisgbarros em yahoo.com.br>
>>>
>>>> Bom dia Pessoal
>>>> Gostaria de saber de pessoas que trabalham com cluster para linux e
>>>> usam o r para executar os cálculos e modelos que venho trabalhando. Li nos
>>>> e-mails anteriores que pessoas que estavam usando uma base de dados de
>>>> 1*10^9, todavia gostaria de trabalhar com mais do que isto alguém trabalha?
>>>> Grato
>>>> Regis Godoy Barros
>>>>
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>>> University of San Paulo (USP)
>>> Faculty of Philosophy, Languages, Literature and Human Sciences (FFLCH)
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>>> San Paulo/SP - Brazil
>>> E-mail: diogo.ferrari em usp.br
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>>> Open Source! Use R! Use Linux!
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>>> "A vida é a arte de tirar conclusões suficientes de dados insuficientes"
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