[R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pedro Rafael
pedro.rafael.marinho em gmail.com
Sexta Novembro 16 14:49:53 BRST 2012
Pessoal consegui. Agora está redondinho. O problema foi simplesmente no
nome de uma pasta em que meu pacote estava. Jogue em outra pasta e deu
certo. Era o nome de uma pasta que tinha um pequeno problema.
Acabei de ler as politicas do CRAN para submeter um pacote em:
http://cran.r-project.org/web/packages/policies.html
Uma duvida que tenho é: Se eu preciso por exemplo melhorar a documentação
eu teria que submeter novamente o pacote com um versão diferente? Se as
alterações não forem tão significativas eu poderia simplesmente enviar
apenas o pdf ou submeter novamente o pacote com a mesma versão? A última
dúvida é com respeito a periodicidade das versões. Tenho que constantemente
está atualizando meu pacote?
Obrigado à todos pelas ajudas.
[ ],
Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 16 de novembro de 2012 13:32, beniltoncarvalho [via R-br] <
ml-node+s2285057n4657061h68 em n4.nabble.com> escreveu:
> mais provavelmente *precedencia* na variavel PATH... se vc tiver 2
> instalacoes de MikTeX e o caminho para a mais antiga aparece antes em PATH,
> entao o R vai "enxergar" o MikTeX velho.
>
>
> 2012/11/16 Leonard Mendonça de Assis <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=0>
> >
>
> na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o
>> rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
>>
>> []s
>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>
>> Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
>>
>> O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD
>> Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9,
>> entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
>>
>> Att.
>>
>> Tiago.
>>
>> ------------------------------
>> Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200
>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=1>
>> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=2>
>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>
>> RTools, errei o nome
>>
>> voce acha no CRAN
>>
>> []s
>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>
>> Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
>>
>> Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
>>
>> Att.
>>
>> Tiago.
>>
>> ------------------------------
>> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200
>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=3>
>> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=4>
>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>
>> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que
>> estamos usando.
>>
>> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei
>> quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os
>> 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
>>
>> []s
>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>
>> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
>>
>> Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu
>> caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R
>> CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão
>> antiga do MikTex que eu não estou usando.
>>
>> Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de
>> instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este
>> pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd.
>> Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd
>> com algumas mensagens de erro.
>>
>> Espero ter te ajudado.
>>
>> Att.
>>
>> Tiago.
>>
>> ------------------------------
>> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300
>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=5>
>> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=6>
>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>
>> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na
>> hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da
>> documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
>>
>> OBS: Estou em uma máquina Linux.
>>
>> * using log directory
>> ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’
>> * using R version 2.15.1 (2012-06-22)
>> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
>> * using session charset: UTF-8
>> * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK
>> * checking extension type ... Package
>> * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’
>> * checking package namespace information ... OK
>> * checking package dependencies ... OK
>> * checking if this is a source package ... OK
>> * checking if there is a namespace ... OK
>> * checking for executable files ... OK
>> * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK
>> * checking installed package size ... OK
>> * checking package directory ... OK
>> * checking for portable file names ... OK
>> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK
>> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK
>> * checking top-level files ... OK
>> * checking index information ... OK
>> * checking package subdirectories ... OK
>> * checking R files for non-ASCII characters ... OK
>> * checking R files for syntax errors ... OK
>> * checking whether the package can be loaded ... OK
>> * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ...
>> OK
>> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
>> * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies
>> ... OK
>> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
>> * checking for unstated dependencies in R code ... OK
>> * checking S3 generic/method consistency ... OK
>> * checking replacement functions ... OK
>> * checking foreign function calls ... OK
>> * checking R code for possible problems ... OK
>> * checking Rd files ... WARNING
>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section
>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section
>> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value
>> * checking Rd metadata ... OK
>> * checking Rd cross-references ... OK
>> * checking for missing documentation entries ... OK
>> * checking for code/documentation mismatches ... OK
>> * checking Rd \usage sections ... OK
>> * checking Rd contents ... OK
>> * checking for unstated dependencies in examples ... OK
>> * checking examples ... OK
>> * checking PDF version of manual ... ERROR
>> Rd conversion errors:
>> Warning: unknown option '-'
>> Warning in file(con, "r") :
>> cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or
>> directory
>> Error in file(con, "r") : cannot open the connection
>>
>>
>> [ ],
>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>
>>
>> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=7>
>> > escreveu:
>>
>> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações.
>> Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos.
>> Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho
>> muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida
>> sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código
>> que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores,
>> etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e
>> depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e
>> reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita
>> luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre
>> com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote
>> que deve ser respeitada?
>>
>> [ ],
>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>
>>
>> Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden
>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=8>> escreveu:
>>
>>
>>
>> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
>>
>> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo
>> de submissão?
>>
>> 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto
>> em
>> detalhes.
>>
>> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
>>
>> R CMD check SEU_PACOTE
>>
>> e corrija todos os eventuais problemas
>>
>> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira
>> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu
>> tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as
>> atualizações
>> > fiquem disponíveis?
>>
>> Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
>>
>> >
>> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
>> seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
>> > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem
>> que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela
>> primeira
>> > vez?
>> >
>>
>> Bem vindo ao Universo do Software livre
>>
>> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que
>> quiser
>>
>> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca.
>> Leia sobre licxancas GPL e análogas
>>
>> Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e
>> livre-se destas preocupacoes
>>
>> >
>> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
>>
>> Nao sao somente suas.
>> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem
>> controvérsias!
>>
>> >
>> > Obrigado à todos.
>> > [ ],
>> > Pedro Rafael Diniz Marinho.
>> >
>> >
>> >
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>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
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