[R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.

Quinta Novembro 15 12:24:42 BRST 2012

Olá  Tiago de Souza como vai? Obrigado pela ajuda. No arquivo .Rd que você
me enviou está ocorrendo o erro que segue:

* checking examples ... ERROR
Running examples in ‘PRDM-Ex.R’ failed
The error most likely occurred in:

> ### Name: prdm
> ### Title: Meu Pacote
> ### Aliases: prdm
>
> ### ** Examples
>
>  fdp<- #defina o quem e esta variavel
+  fda<- #defina o quem e esta variavel
+  chuetes<- #defina o quem e esta variavel
+  dados<- #defina qual o conjunto de dados
+  prdm(fdp, fda, chutes, dados, method = "Nelder-Mead")
Error in optim(chutes, fn = vero, x = dados, control = list(maxit =
50000),  :
  object 'chutes' not found
Calls: prdm -> optim
Execution halted

Você acredita que o erro estava no exemplo?

[   ],
Pedro Rafael Diniz Marinho.

Em 15 de novembro de 2012 10:02, Tiago de Souza [via R-br] <
ml-node+s2285057n4657020h97 em n4.nabble.com> escreveu:

>  Pedro, fiz algumas alterações no tópico arguments da uma olhada para ver
> se você concorda. Deixei algumas instruções no tópico examples caso o
> problema persista me envie este arquivo com as variáveis fdp, fda, chutes e
> dados definidas no tópico examples e eu posso tentar te ajudar.
>
> Att.
>
> Tiago.
>
>
>
> ------------------------------
> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:42 -0300
>
> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=0>
> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=1>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> Segue em anexo o pacote. Basta descompactar. Não estou vendo o erro.
>
>
>
> Obrigado.
>
>
>
>
> [   ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 15 de novembro de 2012 08:52, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=2>
> > escreveu:
>
> No INSTALL não deu nenhum erro. O processo de instalação foi normal. Será
> que eu poderia anexar meu exemplos para vocês dá uma olhada?
>
>
> Obrigado.
>
> [   ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 15 de novembro de 2012 08:42, Tiago de Souza [via R-br] <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=3>
> > escreveu:
>
>  Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------
> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200
>
> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=0>
> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=1>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que
> estamos usando.
>
> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei
> quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os
> 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
>
> []s
> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>
> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
>
>  Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso
> o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD
> Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do
> MikTex que eu não estou usando.
>
>  Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação
> do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o
> problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi
> retornado pra você um  WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas
> mensagens de erro.
>
>  Espero ter te ajudado.
>
>  Att.
>
>  Tiago.
>
>  ------------------------------
> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300
> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=2>
> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=3>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na
> hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da
> documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
>
> OBS: Estou em uma máquina Linux.
>
> * using log directory
> ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’
> * using R version 2.15.1 (2012-06-22)
> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
> * using session charset: UTF-8
> * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK
> * checking extension type ... Package
> * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’
> * checking package namespace information ... OK
> * checking package dependencies ... OK
> * checking if this is a source package ... OK
> * checking if there is a namespace ... OK
> * checking for executable files ... OK
> * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK
> * checking installed package size ... OK
> * checking package directory ... OK
> * checking for portable file names ... OK
> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK
> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK
> * checking top-level files ... OK
> * checking index information ... OK
> * checking package subdirectories ... OK
> * checking R files for non-ASCII characters ... OK
> * checking R files for syntax errors ... OK
> * checking whether the package can be loaded ... OK
> * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ...
> OK
> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
> * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies
> ... OK
> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
> * checking for unstated dependencies in R code ... OK
> * checking S3 generic/method consistency ... OK
> * checking replacement functions ... OK
> * checking foreign function calls ... OK
> * checking R code for possible problems ... OK
> * checking Rd files ... WARNING
> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section
> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section
> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value
> * checking Rd metadata ... OK
> * checking Rd cross-references ... OK
> * checking for missing documentation entries ... OK
> * checking for code/documentation mismatches ... OK
> * checking Rd \usage sections ... OK
> * checking Rd contents ... OK
> * checking for unstated dependencies in examples ... OK
> * checking examples ... OK
> * checking PDF version of manual ... ERROR
> Rd conversion errors:
> Warning: unknown option '-'
> Warning in file(con, "r") :
>   cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or
> directory
> Error in file(con, "r") : cannot open the connection
>
>
> [   ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=4>
> > escreveu:
>
> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações.
> Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos.
> Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT  que eu não acho
> muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida
> sobre a licença GPL ou GPL2  é se uma pessoa poderá desmanchar algum código
> que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores,
> etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e
> depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora  e
> reimplementou  o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita
> luta o nome dessas pessoas permaneceu  como "autores antigos". Isso ocorre
> com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote
> que deve ser respeitada?
>
> [   ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
>  Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden
> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=5>> escreveu:
>
>
>
> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
>
> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo
> de submissão?
>
>  1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions"  que descreve isto em
> detalhes.
>
> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
>
> R CMD check SEU_PACOTE
>
> e corrija todos os eventuais problemas
>
> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira
> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu
> tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as
> atualizações
> > fiquem disponíveis?
>
>  Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
>
> >
> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
> seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
> > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem
> que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela
> primeira
> > vez?
> >
>
>  Bem vindo ao Universo do Software livre
>
> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que
> quiser
>
> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca.
> Leia sobre licxancas GPL e análogas
>
> Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e
> livre-se  destas preocupacoes
>
> >
> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
>
>  Nao sao somente suas.
> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem
> controvérsias!
>
> >
> > Obrigado à todos.
> > [   ],
> > Pedro Rafael Diniz Marinho.
> >
> >
> >
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