[R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Leonard Mendonça de Assis
assis.leonard em gmail.com
Quinta Novembro 15 09:28:46 BRST 2012
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que
estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei
quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os
'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s
Leonard de Assis
http://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
> Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu
> caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R
> CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão
> antiga do MikTex que eu não estou usando.
>
> Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de
> instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este
> pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do
> arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos
> arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
>
> Espero ter te ajudado.
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300
> From: pedro.rafael.marinho em gmail.com
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro
> na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da
> documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
>
> OBS: Estou em uma máquina Linux.
>
> * using log directory
> '/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck'
> * using R version 2.15.1 (2012-06-22)
> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
> * using session charset: UTF-8
> * checking for file 'PRDM/DESCRIPTION' ... OK
> * checking extension type ... Package
> * this is package 'PRDM' version '1.0'
> * checking package namespace information ... OK
> * checking package dependencies ... OK
> * checking if this is a source package ... OK
> * checking if there is a namespace ... OK
> * checking for executable files ... OK
> * checking whether package 'PRDM' can be installed ... OK
> * checking installed package size ... OK
> * checking package directory ... OK
> * checking for portable file names ... OK
> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK
> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK
> * checking top-level files ... OK
> * checking index information ... OK
> * checking package subdirectories ... OK
> * checking R files for non-ASCII characters ... OK
> * checking R files for syntax errors ... OK
> * checking whether the package can be loaded ... OK
> * checking whether the package can be loaded with stated dependencies
> ... OK
> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
> * checking whether the namespace can be loaded with stated
> dependencies ... OK
> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
> * checking for unstated dependencies in R code ... OK
> * checking S3 generic/method consistency ... OK
> * checking replacement functions ... OK
> * checking foreign function calls ... OK
> * checking R code for possible problems ... OK
> * checking Rd files ... WARNING
> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section
> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section
> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value
> * checking Rd metadata ... OK
> * checking Rd cross-references ... OK
> * checking for missing documentation entries ... OK
> * checking for code/documentation mismatches ... OK
> * checking Rd \usage sections ... OK
> * checking Rd contents ... OK
> * checking for unstated dependencies in examples ... OK
> * checking examples ... OK
> * checking PDF version of manual ... ERROR
> Rd conversion errors:
> Warning: unknown option '-'
> Warning in file(con, "r") :
> cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or
> directory
> Error in file(con, "r") : cannot open the connection
>
>
> [ ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael
> <pedro.rafael.marinho em gmail.com
> <mailto:pedro.rafael.marinho em gmail.com>> escreveu:
>
> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas
> informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou
> publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com
> a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem
> quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou
> GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou
> mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores,
> etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma
> pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro
> cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores
> antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como
> "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma
> periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
>
> [ ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br]
> <ml-node+s2285057n4657009h56 em n4.nabble.com
> <mailto:ml-node+s2285057n4657009h56 em n4.nabble.com>> escreveu:
>
>
>
> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
>
> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona
> o professo de submissão?
>
> 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que
> descreve isto em
> detalhes.
>
> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
>
> R CMD check SEU_PACOTE
>
> e corrija todos os eventuais problemas
>
> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira
> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas
> modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o
> mesmo nome para que as atualizações
> > fiquem disponíveis?
>
> Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo
> DESCRIPTION
>
> >
> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu
> pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse
> pacote e alterar ele
> > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer
> modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa
> que submeteu o pacote pela primeira
> > vez?
> >
>
> Bem vindo ao Universo do Software livre
>
> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e
> mudar o que
> quiser
>
> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca.
> Leia sobre licxancas GPL e análogas
>
> Minha sugestao: internalize completamente o conceito de
> software livre e
> livre-se destas preocupacoes
>
> >
> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
>
> Nao sao somente suas.
> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas,
> não sem
> controvérsias!
>
> >
> > Obrigado à todos.
> > [ ],
> > Pedro Rafael Diniz Marinho.
> >
> >
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