[R-br] loops no R
Humberto Hazin
hghazin em hotmail.com
Sexta Março 30 13:02:50 BRT 2012
Olá Benilto,
Segue em anexo os resultados gerados pelo teu codigo (result.csv) para
que vc possa ter uma ideia do que foi gerado. o que estava perguntando
era se seria possivel deixar da seguinte forma anexo (result1.csv)
Obrigado mais uma vez
Humberto
Em 3/30/2012 12:46 PM, Benilton Carvalho escreveu:
> nao tenho como ter ideia sobre as "5 colunas", afinal escrevi o codigo
> sem saber o que sao os dados.
>
> se vc se refere a concatenar todos os data.frames resultantes num
> data.frame maior, use:
>
> resultados = do.call(rbind, resultados)
>
> b
>
> 2012/3/30 Humberto Hazin <hghazin em hotmail.com
> <mailto:hghazin em hotmail.com>>
>
> Benilton,
>
> Muito obrigado! Resolveu meu problema!
> So mais uma pergunta. Caso eu queira que os valores fique em
> apenas 5 colunas como o exemplo abaixo
> Lat Long Year Mes SST
> 23 49 2009 1
> 22 49 2007 1
> 21 49 2009 2
> 21 49 2010 1
> . . . .
> . . . .
> . . . .
>
>
> Obrigado também ao Cleber!
>
> Um abraço
>
> Humberto
>
> Em 3/30/2012 12:10 PM, Benilton Carvalho escreveu:
>> f = function(fname){
>> year = substr(fname, 2, 5)
>> day1 = as.integer(substr(fname, 6, 8))
>> month = format(as.Date(strptime(paste(year, "01", "01",
>> sep='-'), '%Y-%m-%d'))+day1-1, '%m')
>> objOut = paste('m', substr(year, 3, 4), month, sep='')
>>
>> hdf4to5(fname)
>> assign(objOut, satinGet(paste(fname, 5, sep=''), lats=c(10,
>> -30), lons=c(-20, -50), itype='oceancolor'))
>> assign(objOut, data.frame(extract(simplifySat(get(objOut),
>> extent=1))))
>> assign(objOut, cbind(get(objOut), mes=as.integer(month),
>> year=as.integer(year)))
>> return(get(objOut)
>> }
>>
>> ## vetor com o nome de todos os arquivos hdf4
>> fns = list.files(pattern='\\.hdf$')
>> resultados = lapply(fns, f)
>>
>> Claramente, eu nao experimentei o codigo acima... e fica pra vc a
>> tarefa de testar e corrigir algum parenteses que esteja faltando
>> ou algum outro problema.
>>
>> benilton
>>
>> 2012/3/30 Humberto Hazin <hghazin em hotmail.com
>> <mailto:hghazin em hotmail.com>>
>>
>> Bom dia Benilton,
>>
>> Obrigado por responder!
>>
>> É o seguinte quando baixo a imagem ela já vem com esse número
>> todo (S20040322004060) onde S=seawifs, em seguida vem o ano
>> 2004032 2004060 significa o periodo da coleta do satélite ou
>> seja 032-60 dias de 2004, ou seja mes 2. Assim para o outro
>> arquivo S20040012004031 001-31 dias de 2004 ou seja mes 1
>>
>> Esse arquivos estão em hdf4 porém preciso converter para hdf5
>> para poder trabalhar! Então criei uma função no R (hdf4to5)
>> para para ler um executavel de um programa
>> (H4H5TOOLS-2.2.1-win764-vs10static) em segundo plano para
>> esse fim! Uso o pacote Satin para ler o arquivo convertido em
>> hdf5 e fazer as extrações da área que quero ter esses dados
>> "satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10, -30), lons=c(-20,
>> -50), itype="oceancolor")" como preciso de quadrantes de 1x1
>> grau uso a função "simplifySat(m0401, extent=1)" em seguida
>> criei uma função no R "extract(m0401)" para extrair tudo em
>> coluna Lat, Long, Parametro...
>>
>>
>> hdf4to5("S20040012004031.hdf");m0401 <-
>> satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10, -30), lons=c(-20,
>> -50), itype="oceancolor")
>> m0401<-(simplifySat(m0401,
>> extent=1));m0401<-extract(m0401);m0401<-data.frame(m0401);m0401$mes<-1;
>> m0401$year<-2004
>>
>> hdf4to5("S20040322004060.hdf");m0402 <-
>> satinGet("S20040322004060.hdf5",lats=c(10, -30), lons=c(-20,
>> -50), itype="oceancolor")
>> m0402<-(simplifySat(m0402,
>> extent=1));m0402<-extract(m0402);m0402<-data.frame(m0402);m0402$mes<-2;
>> m0402$year<-2004
>>
>> Eu não sei se ficou mais claro agora!
>>
>> Humberto
>>
>>
>> Em 3/29/2012 9:25 PM, Benilton Carvalho escreveu:
>>> Sim, alguem pode te ajudar... mas depende muito de vc ajudar
>>> o alguem primeiro.... Qual o truque para sair
>>> de S20040322004060 para "mes 2"? (minha bola de cristal diz
>>> que o ano corresponde aos 4 primeiros digitos apos S, mas
>>> isso eh soh uma hipotese, jah que vc nao disse explicitamente)
>>>
>>> b
>>>
>>> 2012/3/29 Humberto Hazin <hghazin em hotmail.com
>>> <mailto:hghazin em hotmail.com>>
>>>
>>> Prezados,
>>>
>>> Venho mais uma vez pedir ajuda a voces para resolver um
>>> problema!
>>>
>>> baixei uma série de images de satelite, por ano e mes
>>> (2004 a 2010) totalizando 163 arquivos ate ai tudo bem!
>>> Por termos de comodidade gostaria de criar um loop para
>>> nao ter que digitar essas 163 linhas ou mais para
>>> extrair latitude, longitude e SST. conforme o codigo abaixo:
>>>
>>> hdf4to5("S20040012004031.hdf");m0401 <-
>>> satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10, -30),
>>> lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")
>>> m0401<-(simplifySat(m0401,
>>> extent=1));m0401<-extract(m0401);m0401<-data.frame(m0401);m0401$mes<-1;
>>> m0401$year<-2004
>>>
>>> hdf4to5("S20040322004060.hdf");m0402 <-
>>> satinGet("S20040322004060.hdf5",lats=c(10, -30),
>>> lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")
>>> m0402<-(simplifySat(m0402,
>>> extent=1));m0402<-extract(m0402);m0402<-data.frame(m0402);m0402$mes<-2;
>>> m0402$year<-2004
>>>
>>> Alguem poderia me ajudar!
>>>
>>> Nao coloquei o arquivo pois é muito grande quase 36gigas
>>> porém caso precisem posso colocar o parte do codigo para
>>> baixarem um ou mais arquivos e testarem
>>>
>>> Humberto
>>>
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>>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br em listas.c3sl.ufpr.br>
>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>> Leia o guia de postagem
>>> (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código
>>> mínimo reproduzível.
>>>
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