[R-br] Problemas ao instalar pacote EBImage em windows.

Benilton Carvalho beniltoncarvalho em gmail.com
Quarta Julho 18 16:55:25 BRT 2012


o GTK nao esta' no seu PATH....

2012/7/18 Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com>:
> C:\Users\Augusto Notebook>gtk-demo
> 'gtk-demo' não é reconhecido como um comando interno
> ou externo, um programa operável ou um arquivo em lotes.
>
> C:\Users\Augusto Notebook>display
>
> C:\Users\Augusto Notebook>echo %PATH%
> C:\Program Files\ImageMagick-6.7.8-Q16;C:\Program Files\Common Files\Microsoft S
> hared\Windows Live;C:\Program Files\MiKTeX 2.9\miktex\bin;C:\Windows\system32;C:
> \Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:
> \Program Files\Windows Live\Shared
>
> C:\Users\Augusto Notebook>
>
>
> No caso do display obtive a msg:
> display.exe: unable to open X server `' @
> error/display.c/DisplayImageCommand/428[No such file or directory]
>
> Em 18 de julho de 2012 15:37, Benilton Carvalho
> <beniltoncarvalho em gmail.com> escreveu:
>> a partir de um prompt do DOS, o q vc obtem ao digitar:
>>
>> gtk-demo
>>
>> e
>>
>> display
>>
>> ???
>>
>> depois disso, qual o resultado de
>>
>> echo %PATH%
>>
>> b
>>
>> 2012/7/18 Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com>:
>>>> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
>>> BiocInstaller version 1.4.7, ?biocLite for help
>>>> biocLite("EBImage")
>>> BioC_mirror: http://bioconductor.org
>>> Using R version 2.15, BiocInstaller version 1.4.7.
>>> Installing package(s) 'EBImage'
>>> tentando a URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.10/bioc/bin/windows/contrib/2.15/EBImage_3.12.0.zip'
>>> Content type 'application/zip' length 5294891 bytes (5.0 Mb)
>>> URL aberta
>>> downloaded 5.0 Mb
>>>
>>> package ‘EBImage’ successfully unpacked and MD5 sums checked
>>>
>>> The downloaded binary packages are in
>>>         C:\Users\Augusto
>>> Notebook\AppData\Local\Temp\RtmpO4qrS2\downloaded_packages
>>>> library(EBImage)
>>> Carregando pacotes exigidos: abind
>>> Error in inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...) :
>>>   impossível carregar objeto compartilhado 'C:/Program
>>> Files/R/R-2.15.1/library/EBImage/libs/i386/EBImage.dll':
>>>   LoadLibrary failure:  Não foi possível encontrar o módulo especificado.
>>>
>>> Erro: package/namespace load failed for ‘EBImage’
>>>>
>>>
>>> Em 18 de julho de 2012 15:18, Luciano F. Sgarbi
>>> <luciano.f.sgarbi em gmail.com> escreveu:
>>>> Eu tive um problema semelhante com um outro pacote (não lembro-me qual era).
>>>> Naquele caso nem os scripts abriam mais.
>>>> A solução (mas deve existir uma melhor) que eu encontrei foi reinstalar o R
>>>> e todos os pacotes novamente.
>>>> Depois disso tudo funcionou perfeitamente.
>>>> Abraços
>>>>
>>>> 2012/7/18 Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com>
>>>>>
>>>>> Boa tarde a todos.
>>>>>
>>>>> Eu estou com problemas para instalar o pacote EBImage aqui.
>>>>>
>>>>> Eu instalo ele com os comandos:
>>>>> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
>>>>> biocLite("EBImage")
>>>>>
>>>>> Mas qd vou abrir ele eu tenho:
>>>>> > library(EBImage)
>>>>> Carregando pacotes exigidos: abind
>>>>> Error in inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...) :
>>>>>   impossível carregar objeto compartilhado 'C:/Program
>>>>> Files/R/R-2.15.1/library/EBImage/libs/i386/EBImage.dll':
>>>>>   LoadLibrary failure:  Não foi possível encontrar o módulo especificado.
>>>>>
>>>>> Erro: package/namespace load failed for ‘EBImage’
>>>>>
>>>>> Eu segui o manual aqui:
>>>>>
>>>>> http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/EBImage/inst/doc/EBImage-installation.pdf
>>>>>
>>>>> E instalei o o gtk antes (gtk+-bundle_2.24.10-20120208_win32), e mudei
>>>>> no meu computador->propriedades->Configurações Avançadas do sistema->
>>>>> Variaveis de ambiente->Variavel do sistema Novo coloquei o caminho pro gtk
>>>>> E também instalei o ImageMagick, marcando pra colocar as opções `Update
>>>>> exe-
>>>>> cutable search path' e `Install developement headers and libraries' .
>>>>> Que foram a segunda e a quinta caixinha em portugues.
>>>>> Eu instalei a versão 6.7.8.... Q16
>>>>>
>>>>> E por ultimo ainda instalei o Microsoft VC++ 2008 Redistributable Package
>>>>>
>>>>> Ainda sim não vai.
>>>>> Abrindo pelo Tinn-R da ainda a msg:
>>>>> O programa não pode ser iniciado porque está faltando o
>>>>> libgdk-win32-2.0-0.dll no seu computador. Tente reinstalá-lo para
>>>>> resolver o problema.
>>>>>
>>>>> Mas esse arquivo ta la no gtk.
>>>>>
>>>>> Alguem tem alguma ideia?
>>>>>
>>>>> Segue meu sessionInfo se for de alguma ajuda:
>>>>> > sessionInfo()
>>>>> R version 2.15.1 (2012-06-22)
>>>>> Platform: i386-pc-mingw32/i386 (32-bit)
>>>>>
>>>>> locale:
>>>>> [1] LC_COLLATE=Portuguese_Brazil.1252  LC_CTYPE=Portuguese_Brazil.1252
>>>>> [3] LC_MONETARY=Portuguese_Brazil.1252 LC_NUMERIC=C
>>>>> [5] LC_TIME=Portuguese_Brazil.1252
>>>>>
>>>>> attached base packages:
>>>>> [1] stats     graphics  grDevices datasets  utils     methods   base
>>>>>
>>>>> other attached packages:
>>>>> [1] abind_1.4-0
>>>>>
>>>>> loaded via a namespace (and not attached):
>>>>> [1] tools_2.15.1
>>>>>
>>>>>
>>>>>
>>>>> --
>>>>> Grato
>>>>> Augusto C. A. Ribas
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>>>>> código mínimo reproduzível.
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>>>> Luciano F. Sgarbi
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>>>> Mestrando em Ecologia e Evolução - UFG
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