[R-br] falha na instalação pacote maps no ubuntu
Adriano S. Melo
asm.adrimelo em gmail.com
Quarta Fevereiro 15 19:09:53 BRST 2012
oi Daniel e Paulo,
Muito obrigado pelas sugestões.
Tentei a sugestão do Daniel mas continuei com o problema.
Sobre as sugestões do Paulo, removi e reinstalei o gcc (era isto?) mas não
funcionou. Na página do 'maps' (
http://cran.r-project.org/web/packages/maps/index.html) não é citado
dependência externa.
Vou tentar atualizar o Ubuntu.
De qualquer forma, obrigado pelas sugestões.
Adriano
Em 14 de fevereiro de 2012 16:18, Paulo J Ribeiro Jr
<paulojus em leg.ufpr.br>escreveu:
> Adriano
>
> eu consegui aqui no meu Ubuntu 10.04
> mas realmente nao sei o que houve ai
> pela msg de erro
>
> talvez reinstalar/verificar opcoes e pacotes relacionados ao
> compuilador?
>
> de uma olhada na pagina do pacote para ver se há dependencias externas
>
>
> > install.packages("maps", dep=T)
> --- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
> Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto
> tentando a URL
> 'http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/maps_2.2-5.tar.gz'
> Content type 'application/x-gzip' length 1428846 bytes (1.4 Mb)
> URL aberta
> ==================================================
> downloaded 1.4 Mb
>
> * installing *source* package ‘maps’ ...
> ** package ‘maps’ successfully unpacked and MD5 sums checked
> ** libs
> ** arch -
> gcc -std=gnu99 -g -O2 -I/usr/local/include -L/usr/local/lib Gmake.c
> -o Gmake
> gcc -std=gnu99 -g -O2 -I/usr/local/include -L/usr/local/lib Lmake.c
> -o Lmake
> Converting world to world2
> gawk -f convert.awk < world.line > world2.line
> make county.L state.L usa.L nz.L world.L world2.L italy.L france.L
> state.vbm.L state.carto.L
> make[1]: Entrando no diretório
> `/tmp/Rtmpo3pSb1/R.INSTALL12d468bce883/maps/src'
> ./Lmake 0 s b county.line county.linestats ../inst/mapdata/county.L
> ./Lmake 0 s b state.line state.linestats ../inst/mapdata/state.L
> ./Lmake 0 s b usa.line usa.linestats ../inst/mapdata/usa.L
> ./Lmake 0 s b nz.line nz.linestats ../inst/mapdata/nz.L
> ./Lmake 0 s b world.line world.linestats ../inst/mapdata/world.L
> ./Lmake 0 s b world2.line world2.linestats ../inst/mapdata/world2.L
> ./Lmake 0 s b italy.line italy.linestats ../inst/mapdata/italy.L
> ./Lmake 0 s b france.line france.linestats ../inst/mapdata/france.L
> ./Lmake 0 p b state.vbm.line
> state.vbm.linestats ../inst/mapdata/state.vbm.L
> ./Lmake 0 p b state.carto.line
> state.carto.linestats ../inst/mapdata/state.carto.L
> make[1]: Saindo do diretório
> `/tmp/Rtmpo3pSb1/R.INSTALL12d468bce883/maps/src'
> make county.G state.G usa.G nz.G world.G world2.G italy.G france.G
> state.vbm.G state.carto.G
> make[1]: Entrando no diretório
> `/tmp/Rtmpo3pSb1/R.INSTALL12d468bce883/maps/src'
> ./Gmake b county.gon
> county.gonstats ../inst/mapdata/county.G ../inst/mapdata/county.L
> ./Gmake b state.gon
> state.gonstats ../inst/mapdata/state.G ../inst/mapdata/state.L
> ./Gmake b usa.gon
> usa.gonstats ../inst/mapdata/usa.G ../inst/mapdata/usa.L
> ./Gmake b nz.gon nz.gonstats ../inst/mapdata/nz.G ../inst/mapdata/nz.L
> ./Gmake b world.gon
> world.gonstats ../inst/mapdata/world.G ../inst/mapdata/world.L
> ./Gmake b world2.gon
> world2.gonstats ../inst/mapdata/world2.G ../inst/mapdata/world2.L
> ./Gmake b italy.gon
> italy.gonstats ../inst/mapdata/italy.G ../inst/mapdata/italy.L
> ./Gmake b france.gon
> france.gonstats ../inst/mapdata/france.G ../inst/mapdata/france.L
> ./Gmake b state.vbm.gon
> state.vbm.gonstats ../inst/mapdata/state.vbm.G ../inst/mapdata/state.vbm.L
> ./Gmake b state.carto.gon
> state.carto.gonstats ../inst/mapdata/state.carto.G
> ../inst/mapdata/state.carto.L
> make[1]: Saindo do diretório
> `/tmp/Rtmpo3pSb1/R.INSTALL12d468bce883/maps/src'
> make county.N state.N usa.N nz.N world.N world2.N italy.N france.N
> state.vbm.N state.carto.N
> make[1]: Entrando no diretório
> `/tmp/Rtmpo3pSb1/R.INSTALL12d468bce883/maps/src'
> make[1]: Saindo do diretório
> `/tmp/Rtmpo3pSb1/R.INSTALL12d468bce883/maps/src'
> gcc -std=gnu99 -I/usr/local/lib/R/include -I/usr/local/include -fpic
> -g -O2 -c mapget.c -o mapget.o
> gcc -std=gnu99 -I/usr/local/lib/R/include -I/usr/local/include -fpic
> -g -O2 -c smooth.c -o smooth.o
> gcc -std=gnu99 -I/usr/local/lib/R/include -I/usr/local/include -fpic
> -g -O2 -c thin.c -o thin.o
> /usr/local/lib/R/bin/R CMD SHLIB -o maps.so mapget.o smooth.o thin.o
> make[1]: Entrando no diretório
> `/tmp/Rtmpo3pSb1/R.INSTALL12d468bce883/maps/src'
> gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/local/lib -o maps.so mapget.o smooth.o
> thin.o -L/usr/local/lib/R/lib -lR
> make[1]: Saindo do diretório
> `/tmp/Rtmpo3pSb1/R.INSTALL12d468bce883/maps/src'
> installing to /usr/local/lib/R/library/maps/libs
> ** R
> ** data
> ** inst
> ** byte-compile and prepare package for lazy loading
> ** help
> *** installing help indices
> ** building package indices ...
> ** testing if installed package can be loaded
>
> * DONE (maps)
>
> The downloaded packages are in
> ‘/tmp/Rtmp743Xz4/downloaded_packages’
> Updating HTML index of packages in '.Library'
> Making packages.html ... done
>
>
> Em Ter, 2012-02-14 às 11:27 -0200, Adriano S. Melo escreveu:
> > Prezados colegas,
> > Não estou conseguindo instalar o pacote 'maps'. Uso ubuntu 10.04 e R
> > 2.14.1.
> >
> >
> > Consigo instalar outros pacotes normalmente, mas não o 'maps'.
> > Já tentei baixar os arquivos manualmente (inclusive de versões
> > anteriores), mas sempre tenho erro, aparentemente na compilação. A
> > mensagem de erro segue abaixo.
> > Fico grato por qualquer ajuda.
> > Abraços,
> > Adriano S. Melo
> > Dep. Ecologia - UFG
> >
> >
> > install.packages('maps')
> > Installing package(s) into ‘/home/aa/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14’
> > (as ‘lib’ is unspecified)
> > --- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
> > Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto
> > tentando a URL
> > 'http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/maps_2.2-5.tar.gz'
> > Content type 'application/x-gzip' length 1428846 bytes (1.4 Mb)
> > URL aberta
> > ==================================================
> > downloaded 1.4 Mb
> >
> >
> > * installing *source* package ‘maps’ ...
> > ** package ‘maps’ successfully unpacked and MD5 sums checked
> > ** libs
> > ** arch -
> > gcc -std=gnu99 -g -O2 Gmake.c -o Gmake
> > gcc -std=gnu99 -g -O2 Lmake.c -o Lmake
> > Converting world to world2
> > f convert.awk < world.line > world2.line
> > /bin/bash: f: comando não encontrado
> > make: [world2.line] Erro 127 (ignorado)
> > make county.L state.L usa.L nz.L world.L world2.L italy.L france.L
> > state.vbm.L state.carto.L
> > make[1]: Entrando no diretório
> > `/tmp/RtmpOHSZmi/R.INSTALL79b85cf8d6ef/maps/src'
> > ./Lmake 0 s b county.line county.linestats ../inst/mapdata/county.L
> > ./Lmake 0 s b state.line state.linestats ../inst/mapdata/state.L
> > ./Lmake 0 s b usa.line usa.linestats ../inst/mapdata/usa.L
> > ./Lmake 0 s b nz.line nz.linestats ../inst/mapdata/nz.L
> > ./Lmake 0 s b world.line world.linestats ../inst/mapdata/world.L
> > ./Lmake 0 s b world2.line world2.linestats ../inst/mapdata/world2.L
> > Cannot read left and right at line 1
> > make[1]: ** [world2.L] Erro 1
> > make[1]: Saindo do diretório
> > `/tmp/RtmpOHSZmi/R.INSTALL79b85cf8d6ef/maps/src'
> > make: ** [ldata] Erro 2
> > ERROR: compilation failed for package ‘maps’
> > * removing ‘/home/aa/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14/maps’
> >
> >
> > The downloaded packages are in
> > ‘/tmp/RtmpSDbTyV/downloaded_packages’
> > Mensagens de aviso perdidas:
> > In install.packages("maps") :
> > installation of package ‘maps’ had non-zero exit status
> >
> >
> >
> >
> > _______________________________________________
> > R-br mailing list
> > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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> Paulo Justiniano Ribeiro Jr
> LEG (Laboratorio de Estatistica e Geoinformacao)
> Universidade Federal do Parana
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> Curitiba, PR - Brasil
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