[R-br] Mensagem de erro no teste exato de Fisher

Emerson Cotta Bodevan bodevan.ec em gmail.com
Quinta Agosto 23 11:09:59 BRT 2012


Obrigado Benilton e demais.

Problema resolvido.

Abs,
Emerson.

Em 23 de agosto de 2012 09:30, Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com
> escreveu:

> a msg de erro diz:
>
> "Try increasing the size of the workspace."
>
> dai' decido ler a pagina de ajuda de fisher.test, que mostra que o 3o
> argumento e' algo chamado "workspace"... hmmm..... "estraaaanho"...
> mas enfim, diz q o treco e' 200mil...
>
> entao experimento aumentar o tal, so pra ver o q acontece:
>
> > teste<-matrix(c(3,8,15,75,1,12,0,2,18,49,27,56),nrow=4)
> >  fisher.test(teste)
> Error in fisher.test(teste) : FEXACT error 6.
> LDKEY is too small for this problem.
> Try increasing the size of the workspace.
> >  fisher.test(teste, workspace=1e6)
>
>         Fisher's Exact Test for Count Data
>
> data:  teste
> p-value = 6.97e-12
> alternative hypothesis: two.sided
>
>
>
> outrem diria rtfm... :P
>
> hth
>
> 2012/8/23 Fernando Colugnati <fcolugnati em gmail.com>:
> > Existe sim, é um teste permutacional, pode ser em qualquer dimensão. O
> > problema é que isso passa a ser computacionalmente intensivo, apesar de
> > parecer um teste simples...
> > Esta mensagem deve ter a ver com algum problema do tipo memória do
> > workspace, etc...não entendo muito do core do R, mas a mensagem deixa
> isso
> > claro.
> >
> > Abs
> >
> > Em 22 de agosto de 2012 23:03, Leonard de Assis <assis.leonard em gmail.com
> >
> > escreveu:
> >
> >> Desculpe minha ignorância, mas ...
> >> existe teste exato de Fisher pra matriz diferente de 2x2?
> >>
> >> sinceramente não recordo disto.
> >>
> >> []s
> >> Leonard de Assis
> >> assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com
> >>
> >> Em 22/08/2012 22:52, Emerson Cotta Bodevan escreveu:
> >>
> >> Prezados,
> >>
> >> considere os dados
> >>
> >> >teste<-matrix(c(3,8,15,75,1,12,0,2,18,49,27,56),nrow=4)
> >>
> >> ao executar o comando
> >>
> >> > fisher.test(teste)
> >>
> >> aparece a mensagem abaixo.
> >>
> >> >Erro em fisher.test(teste) : FEXACT error 6.
> >>
> >> >LDKEY is too small for this problem.
> >>
> >> >Try increasing the size of the workspace.
> >>
> >>
> >> Alguém sabe o que significa?
> >>
> >> Agradeço qualquer ajuda.
> >>
> >> Abs,
> >> Emerson.
> >>
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