[R-br] Erro ao carregar lme4

Walmes Zeviani walmeszeviani em gmail.com
Sexta Setembro 9 12:31:54 BRT 2011


Benilton,

Usando o R com R --vanilla consegui usar a lme4, veja

> require(lme4)
Carregando pacotes exigidos: lme4
Carregando pacotes exigidos: Matrix
Carregando pacotes exigidos: lattice

Anexando pacote: 'Matrix'

The following object(s) are masked from 'package:base':

    det


Anexando pacote: 'lme4'

The following object(s) are masked from 'package:stats':

    AIC, BIC

> sigma <- 1 # desvio-padrão do efeito de lote
> i <- 10    # níveis de lote
> j <- 4     # número de repetições por lote
> m <- 50    # número de sementes por ensaio
> b <- rnorm(10, 0, sigma) # efeitos dos lotes
> z <- gl(i, j)            # vetor de níveis de lote
> y <- rbinom(i*j, size=m, prob=1/(1+exp(-rep(b, e=j)))) # germinação
observada
> plot(y, col=z)
> mm0 <- glmer(cbind(y, 50-y)~(1|z), family=binomial)
> summary(mm0)
Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation
Formula: cbind(y, 50 - y) ~ (1 | z)
   AIC   BIC logLik deviance
 77.98 81.36 -36.99    73.98
Random effects:
 Groups Name        Variance Std.Dev.
 z      (Intercept) 0.66017  0.81251
Number of obs: 40, groups: z, 10

Fixed effects:
            Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept)  -0.1926     0.2615  -0.736    0.462
>

O que esse "vanilla" faz e como eu posso usar o R assim por meio do Emacs, o
meu editor de código?

Grato.
Walmes.

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Walmes Marques Zeviani
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