[R-br] Digest R-br, volume 8, assunto 22
Cassiano
cassianosr em gmail.com
Quinta Outubro 20 12:29:47 BRST 2011
Re: Barra de erros usando Binomial Negativa (Walmes Zeviani)
Walmes,
Acho que é exatamente isso que estava procurando.
Mas eu não entendi o output que o comando me ofereceu. Ou pelo menos, não
sei usá-lo para construir meu gráfico.
> confint(m2)
Waiting for profiling to be done...
2.5 % 97.5 %
(Intercept) 0.7804852 1.2279976
predadorsem -1.0985071 -0.3178279
Eu tenho as categorias com e sem predador. Ok, o Intercept é com o predador
e a linha seguinte, sem o predador. Qual é o valor da minha barra superior e
inferior da barra com predador, p.ex.?
Como ploto isso em um barplot2?
Obrigado!
Cassiano
Em 20 de outubro de 2011 12:00, <r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
> Enviar submissões para a lista de discussão R-br para
> r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou
> corpo da mensagem para
> r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo
> endereço
> r-br-owner em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será
> mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."
>
>
> Tópicos de Hoje:
>
> 1. ajuda ks.test (Rodrigo Plei)
> 2. Re: ajuda ks.test (Gustavo Henrique M. A. Rocha)
> 3. Re: ajuda ks.test (Rodrigo Plei)
> 4. Re: ajuda ks.test (Gustavo Henrique M. A. Rocha)
> 5. Barra de erros usando Binomial Negativa (Cassiano)
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> 10. recuperar coeficientes da função discriminante quadrática
> (Guilherme Moraes Ferraudo)
> 11. Re: recuperar coeficientes da função discriminante quadrática
> (Benilton Carvalho)
>
>
> ----------------------------------------------------------------------
>
> Message: 1
> Date: Wed, 19 Oct 2011 14:04:34 -0200
> From: Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: [R-br] ajuda ks.test
> Message-ID:
> <CACs_BFNAu-TBO+q1eUQWG1e2yRGYnCgUmt6M7vuASiqBNAkgBQ em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Pessoal,
>
> Estou tentando utilizar o kolgomorov-smirnov test (ks test, pacote
> "stats"),
> para comparar frequências de comprimentos de peixes de duas áreas de pesca
> distintas, mas algo está emperrando a análise:
>
> x <- data # frequência de comprimentos de peixes da área x
> y <- data2 # frequência de comprimentos de peixes na área y
> ks.test(x, y)
> Erro em ks.test(x, y) :
> 'y' deve ser numérico ou uma cadeia nomeando uma função válida
>
> O formado dos dados é:
>
> area_x area_y
> 23 29
> 25 30
> 23.8 26
> 19 28
>
> Será que estou entrando os dados de maneira errada?
>
> Agradeço qualquer ajuda desde logo.
>
> Rodrigo
>
> --
> =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
>
> Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
>
> Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
> Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
> Butantã - São Paulo/SP, Brasil
> 05508-900
> Tel: +55 11 3091 6549
> Email: rodrigo.plei em gmail.com ; ocersm em lycos.com; rsmartins em usp.br
>
> CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111019/96e46770/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 2
> Date: Wed, 19 Oct 2011 14:12:28 -0200
> From: "Gustavo Henrique M. A. Rocha" <ghmarbr em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] ajuda ks.test
> Message-ID:
> <CADsPq2q4g6W-abJ1gXWBbnUCqbd+MrzVkRUWC6iSag39v3k=2g em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1
>
> Rodrigo,
>
> possivelmente seus dados não estão definidos como numéricos.
>
> Use a função is.numeric para verificar se os dados são numéricos ou não.
>
> Fazendo um teste com os dados que você mostrou consegui rodar o teste
> normalmente.
>
> x = c(23,25,23.8,19)
> y = c(29,30,26,28)
> ks.test(x,y)
>
> Abraços!
>
>
> Gustavo Henrique Mitraud Assis Rocha
> Doutorando em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> Mestre em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> Bacharel em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
>
>
>
> Em 19 de outubro de 2011 14:04, Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> escreveu:
> > Pessoal,
> > Estou tentando utilizar o kolgomorov-smirnov test (ks test, pacote
> "stats"),
> > para comparar frequências de comprimentos de peixes de duas áreas de
> pesca
> > distintas, mas algo está emperrando a análise:
> > x <- data # frequência de comprimentos de peixes da área x
> > y <- data2 # frequência de comprimentos de peixes na área y
> > ks.test(x, y)
> > Erro em ks.test(x, y) :
> > 'y' deve ser numérico ou uma cadeia nomeando uma função válida
> > O formado dos dados é:
> > area_x area_y
> > 23 29
> > 25 30
> > 23.8 26
> > 19 28
> >
> > Será que estou entrando os dados de maneira errada?
> > Agradeço qualquer ajuda desde logo.
> >
> > Rodrigo
> > --
> > =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
> >
> > Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> > Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
> >
> > Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
> > Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> > Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
> > Butantã - São Paulo/SP, Brasil
> > 05508-900
> > Tel: +55 11 3091 6549
> > Email: rodrigo.plei em gmail.com ; ocersm em lycos.com; rsmartins em usp.br
> >
> > CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
> >
> >
> >
> >
> >
> >
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> >
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> > _______________________________________________
> > R-br mailing list
> > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código
> > mínimo reproduzível.
> >
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 3
> Date: Wed, 19 Oct 2011 14:24:04 -0200
> From: Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] ajuda ks.test
> Message-ID:
> <CACs_BFN4zjFaY264+5GVONMhq1ZUC7kwyxzKaZqPtsTQNMYYGg em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Parece que é isso mesmo, Gustavo.
>
> Mas o que eu não entendo é que o comando "is.numeric" não está funcionando
> para meus dados:
>
> > x1 <-is.numeric(x)
> > x1
> [1] FALSE
>
> Alguma idéia?
>
> Obrigado desde logo.
>
> R.
>
> Em 19 de outubro de 2011 14:12, Gustavo Henrique M. A. Rocha <
> ghmarbr em gmail.com> escreveu:
>
> > Rodrigo,
> >
> > possivelmente seus dados não estão definidos como numéricos.
> >
> > Use a função is.numeric para verificar se os dados são numéricos ou não.
> >
> > Fazendo um teste com os dados que você mostrou consegui rodar o teste
> > normalmente.
> >
> > x = c(23,25,23.8,19)
> > y = c(29,30,26,28)
> > ks.test(x,y)
> >
> > Abraços!
> >
> >
> > Gustavo Henrique Mitraud Assis Rocha
> > Doutorando em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> > Mestre em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> > Bacharel em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >
> >
> >
> > Em 19 de outubro de 2011 14:04, Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> > escreveu:
> > > Pessoal,
> > > Estou tentando utilizar o kolgomorov-smirnov test (ks test, pacote
> > "stats"),
> > > para comparar frequências de comprimentos de peixes de duas áreas de
> > pesca
> > > distintas, mas algo está emperrando a análise:
> > > x <- data # frequência de comprimentos de peixes da área x
> > > y <- data2 # frequência de comprimentos de peixes na área y
> > > ks.test(x, y)
> > > Erro em ks.test(x, y) :
> > > 'y' deve ser numérico ou uma cadeia nomeando uma função válida
> > > O formado dos dados é:
> > > area_x area_y
> > > 23 29
> > > 25 30
> > > 23.8 26
> > > 19 28
> > >
> > > Será que estou entrando os dados de maneira errada?
> > > Agradeço qualquer ajuda desde logo.
> > >
> > > Rodrigo
> > > --
> > > =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
> > >
> > > Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> > > Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
> > >
> > > Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
> > > Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> > > Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
> > > Butantã - São Paulo/SP, Brasil
> > > 05508-900
> > > Tel: +55 11 3091 6549
> > > Email: rodrigo.plei em gmail.com ; ocersm em lycos.com; rsmartins em usp.br
> > >
> > > CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
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> > > R-br mailing list
> > > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> > código
> > > mínimo reproduzível.
> > >
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> > R-br mailing list
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> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> > código mínimo reproduzível.
> >
>
>
>
> --
> =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
>
> Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
>
> Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
> Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
> Butantã - São Paulo/SP, Brasil
> 05508-900
> Tel: +55 11 3091 6549
> Email: rodrigo.plei em gmail.com ; ocersm em lycos.com; rsmartins em usp.br
>
> CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
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> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 4
> Date: Wed, 19 Oct 2011 14:26:13 -0200
> From: "Gustavo Henrique M. A. Rocha" <ghmarbr em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] ajuda ks.test
> Message-ID:
> <CADsPq2qQ1uAoUiE5uFD6262e_CFWBYXTcKzF4G0eE80rpw-nsA em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1
>
> Rodrigo,
>
> no caso o resultado diz que sua variável x não é numérica.
>
> Como não sei a estrutura de seus dados, tente usar
> ks.test(as.numeric(x),as.numeric(y))
>
>
> Gustavo Henrique Mitraud Assis Rocha
> Doutorando em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> Mestre em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> Bacharel em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
>
>
>
> Em 19 de outubro de 2011 14:24, Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> escreveu:
> > Parece que é isso mesmo, Gustavo.
> > Mas o que eu não entendo é que o comando "is.numeric" não está
> funcionando
> > para meus dados:
> >> x1 <-is.numeric(x)
> >> x1
> > [1] FALSE
> > Alguma idéia?
> > Obrigado desde logo.
> > R.
> > Em 19 de outubro de 2011 14:12, Gustavo Henrique M. A. Rocha
> > <ghmarbr em gmail.com> escreveu:
> >>
> >> Rodrigo,
> >>
> >> possivelmente seus dados não estão definidos como numéricos.
> >>
> >> Use a função is.numeric para verificar se os dados são numéricos ou não.
> >>
> >> Fazendo um teste com os dados que você mostrou consegui rodar o teste
> >> normalmente.
> >>
> >> x = c(23,25,23.8,19)
> >> y = c(29,30,26,28)
> >> ks.test(x,y)
> >>
> >> Abraços!
> >>
> >>
> >> Gustavo Henrique Mitraud Assis Rocha
> >> Doutorando em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >> Mestre em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >> Bacharel em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >>
> >>
> >>
> >> Em 19 de outubro de 2011 14:04, Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> >> escreveu:
> >> > Pessoal,
> >> > Estou tentando utilizar o kolgomorov-smirnov test (ks test, pacote
> >> > "stats"),
> >> > para comparar frequências de comprimentos de peixes de duas áreas de
> >> > pesca
> >> > distintas, mas algo está emperrando a análise:
> >> > x <- data # frequência de comprimentos de peixes da área x
> >> > y <- data2 # frequência de comprimentos de peixes na área y
> >> > ks.test(x, y)
> >> > Erro em ks.test(x, y) :
> >> > 'y' deve ser numérico ou uma cadeia nomeando uma função válida
> >> > O formado dos dados é:
> >> > area_x area_y
> >> > 23 29
> >> > 25 30
> >> > 23.8 26
> >> > 19 28
> >> >
> >> > Será que estou entrando os dados de maneira errada?
> >> > Agradeço qualquer ajuda desde logo.
> >> >
> >> > Rodrigo
> >> > --
> >> > =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
> >> >
> >> > Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> >> > Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
> >> >
> >> > Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
> >> > Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> >> > Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
> >> > Butantã - São Paulo/SP, Brasil
> >> > 05508-900
> >> > Tel: +55 11 3091 6549
> >> > Email: rodrigo.plei em gmail.com ; ocersm em lycos.com; rsmartins em usp.br
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> >> > CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > _______________________________________________
> >> > R-br mailing list
> >> > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> >> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> >> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> >> > código
> >> > mínimo reproduzível.
> >> >
> >> _______________________________________________
> >> R-br mailing list
> >> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> >> código mínimo reproduzível.
> >
> >
> >
> > --
> > =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
> >
> > Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> > Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
> >
> > Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
> > Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> > Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
> > Butantã - São Paulo/SP, Brasil
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> > Tel: +55 11 3091 6549
> > Email: rodrigo.plei em gmail.com ; ocersm em lycos.com; rsmartins em usp.br
> >
> > CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
> >
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> >
> >
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> >
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> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código
> > mínimo reproduzível.
> >
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 5
> Date: Wed, 19 Oct 2011 14:27:28 -0200
> From: Cassiano <cassianosr em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: [R-br] Barra de erros usando Binomial Negativa
> Message-ID:
> <CAF78VjJQ8vpJkBFnXWzp02Mn8EMwe69sNFfRfA+HjosuHsVeWg em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Olá a todos,
>
> Tenho dados de contagem de indivíduos (no y) e a distribuição mais adequada
> foi a Bionmial Negativa.
> Como meu x são categorias, vou demostrar isso com um barplot.
> Porém não sei como gerar as barras de erro assimétricas, uma vez que meus
> dados não são Normais.
>
> Como eu devo calcular o desvio padrão nestes casos?
>
> Obrigado!
> Cassiano
>
> --
> =======================================
> MSc Cassiano S. Rosa
> Universidade Federal de Viçosa -UFV
> Dept. Biologia Animal
> Pós-graduação em Entomologia
> Lab. Termitologia
>
> Curriculo lattes:
> http://lattes.cnpq.br/3030825329622014
> =======================================
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111019/0739ccfe/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 6
> Date: Wed, 19 Oct 2011 17:29:42 +0100
> From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] ajuda ks.test
> Message-ID:
> <CAO-arWPcFfQ=jD8Duvn1UQB0sLHTHn0LTF6kh2-TSb0yuTixzA em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1
>
> talvez vc queira "as.numeric" (assumindo q seja algo q possa ser
> convertido para numeric).
>
> mas, o melhor de tudo mesmo seria um exemplo reproduzivel... tipo
> (voltando ao seu exemplo inicial)
>
> dput(data)
> dput(data2)
>
> veja tbm o topico para algumas sugestoes:
>
>
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Produzindo-um-Codigo-Minimo-Reproduzivel-CMR-td3674188.html
>
> http://goo.gl/wlNWC
>
> b
>
> 2011/10/19 Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>:
> > Parece que é isso mesmo, Gustavo.
> > Mas o que eu não entendo é que o comando "is.numeric" não está
> funcionando
> > para meus dados:
> >> x1 <-is.numeric(x)
> >> x1
> > [1] FALSE
> > Alguma idéia?
> > Obrigado desde logo.
> > R.
> > Em 19 de outubro de 2011 14:12, Gustavo Henrique M. A. Rocha
> > <ghmarbr em gmail.com> escreveu:
> >>
> >> Rodrigo,
> >>
> >> possivelmente seus dados não estão definidos como numéricos.
> >>
> >> Use a função is.numeric para verificar se os dados são numéricos ou não.
> >>
> >> Fazendo um teste com os dados que você mostrou consegui rodar o teste
> >> normalmente.
> >>
> >> x = c(23,25,23.8,19)
> >> y = c(29,30,26,28)
> >> ks.test(x,y)
> >>
> >> Abraços!
> >>
> >>
> >> Gustavo Henrique Mitraud Assis Rocha
> >> Doutorando em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >> Mestre em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >> Bacharel em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >>
> >>
> >>
> >> Em 19 de outubro de 2011 14:04, Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> >> escreveu:
> >> > Pessoal,
> >> > Estou tentando utilizar o kolgomorov-smirnov test (ks test, pacote
> >> > "stats"),
> >> > para comparar frequências de comprimentos de peixes de duas áreas de
> >> > pesca
> >> > distintas, mas algo está emperrando a análise:
> >> > x <- data # frequência de comprimentos de peixes da área x
> >> > y <- data2 # frequência de comprimentos de peixes na área y
> >> > ks.test(x, y)
> >> > Erro em ks.test(x, y) :
> >> > 'y' deve ser numérico ou uma cadeia nomeando uma função válida
> >> > O formado dos dados é:
> >> > area_x area_y
> >> > 23 29
> >> > 25 30
> >> > 23.8 26
> >> > 19 28
> >> >
> >> > Será que estou entrando os dados de maneira errada?
> >> > Agradeço qualquer ajuda desde logo.
> >> >
> >> > Rodrigo
> >> > --
> >> > =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
> >> >
> >> > Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> >> > Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
> >> >
> >> > Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
> >> > Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> >> > Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
> >> > Butantã - São Paulo/SP, Brasil
> >> > 05508-900
> >> > Tel: +55 11 3091 6549
> >> > Email: rodrigo.plei em gmail.com ; ocersm em lycos.com; rsmartins em usp.br
> >> >
> >> > CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
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> >> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> >> > código
> >> > mínimo reproduzível.
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> >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> >> código mínimo reproduzível.
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> > =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
> >
> > Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> > Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
> >
> > Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
> > Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> > Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
> > Butantã - São Paulo/SP, Brasil
> > 05508-900
> > Tel: +55 11 3091 6549
> > Email: rodrigo.plei em gmail.com ; ocersm em lycos.com; rsmartins em usp.br
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> > CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
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> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código
> > mínimo reproduzível.
> >
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> Successful people ask better questions, and as a result, they get
> better answers. (Tony Robbins)
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 7
> Date: Wed, 19 Oct 2011 10:01:01 -0700 (PDT)
> From: Edson Lira <edinhoestat em yahoo.com.br>
> To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] ajuda ks.test
> Message-ID:
> <1319043661.15905.YahooMailNeo em web160713.mail.bf1.yahoo.com>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Se já resolveu, ótimo, se não é bom você usar a função str(data) que te
> dará qual a estrutura de todas as variáveis de seu banco de dados.
>
> Depois disso, pode-se usar as.numeric, caso alguma variável não seja
> numérica. Mas antes cheque o seu banco, pode ser que ao digitar tenha havido
> alguns erros: por exemplo, pode ser que tenha um ponto no lugar de uma
> vírgula, ou outro problema similar.
>
>
> []'s.
>
>
> Edson Lira
> Estatístico
> Manaus-Amazonas
>
>
> ________________________________
> De: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
> Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Enviadas: Quarta-feira, 19 de Outubro de 2011 12:29
> Assunto: Re: [R-br] ajuda ks.test
>
> talvez vc queira "as.numeric" (assumindo q seja algo q possa ser
> convertido para numeric).
>
> mas, o melhor de tudo mesmo seria um exemplo reproduzivel... tipo
> (voltando ao seu exemplo inicial)
>
> dput(data)
> dput(data2)
>
> veja tbm o topico para algumas sugestoes:
>
>
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Produzindo-um-Codigo-Minimo-Reproduzivel-CMR-td3674188.html
>
> http://goo.gl/wlNWC
>
> b
>
> 2011/10/19 Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>:
> > Parece que é isso mesmo, Gustavo.
> > Mas o que eu não entendo é que o comando "is.numeric" não está
> funcionando
> > para meus dados:
> >> x1 <-is.numeric(x)
> >> x1
> > [1] FALSE
> > Alguma idéia?
> > Obrigado desde logo.
> > R.
> > Em 19 de outubro de 2011 14:12, Gustavo Henrique M. A. Rocha
> > <ghmarbr em gmail.com> escreveu:
> >>
> >> Rodrigo,
> >>
> >> possivelmente seus dados não estão definidos como numéricos.
> >>
> >> Use a função is.numeric para verificar se os dados são numéricos ou não.
> >>
> >> Fazendo um teste com os dados que você mostrou consegui rodar o teste
> >> normalmente.
> >>
> >> x = c(23,25,23.8,19)
> >> y = c(29,30,26,28)
> >> ks.test(x,y)
> >>
> >> Abraços!
> >>
> >>
> >> Gustavo Henrique Mitraud Assis Rocha
> >> Doutorando em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >> Mestre em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >> Bacharel em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais
> >>
> >>
> >>
> >> Em 19 de outubro de 2011 14:04, Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> >> escreveu:
> >> > Pessoal,
> >> > Estou tentando utilizar o kolgomorov-smirnov test (ks test, pacote
> >> > "stats"),
> >> > para comparar frequências de comprimentos de peixes de duas áreas de
> >> > pesca
> >> > distintas, mas algo está emperrando a análise:
> >> > x <- data # frequência de comprimentos de peixes da área x
> >> > y <- data2 # frequência de comprimentos de peixes na área y
> >> > ks.test(x, y)
> >> > Erro em ks.test(x, y) :
> >> > 'y' deve ser numérico ou uma cadeia nomeando uma função válida
> >> > O formado dos dados é:
> >> > area_x area_y
> >> > 23 29
> >> > 25 30
> >> > 23.8 26
> >> > 19 28
> >> >
> >> > Será que estou entrando os dados de maneira errada?
> >> > Agradeço qualquer ajuda desde logo.
> >> >
> >> > Rodrigo
> >> > --
> >> > =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
> >> >
> >> > Rodrigo Silvestre Martins, PhD
> >> > Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
> >> >
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> >> > Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
> >> > Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
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> >> > 05508-900
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> >> > mínimo reproduzível.
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> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111019/f9a23689/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 8
> Date: Wed, 19 Oct 2011 15:33:45 -0200
> From: Rodrigo Plei <rodrigo.plei em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br, Edson Lira <edinhoestat em yahoo.com.br>
> Subject: Re: [R-br] ajuda ks.test
> Message-ID:
> <CACs_BFOF_qeBoNNO9K8KJOxN01D95JfCCuKpGH244PFw_3+GMA em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Prezados todos,
>
> Consegui resolver o problema.
>
> Bastou dizer ao R que o separador decimal dos dados originais erma vírgulas
> e não pontos.
>
> 1 abraço e obrigado pela ajuda!
>
> Rodrigo
>
> --
> =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->
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> Rodrigo Silvestre Martins, PhD
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> CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
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> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 9
> Date: Wed, 19 Oct 2011 15:41:16 -0200
> From: Walmes Zeviani <walmeszeviani em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Barra de erros usando Binomial Negativa
> Message-ID:
> <CAFU=EkY7mwOG-wJrVUL=md5nSAMdndrhGt_7GQR5pvjrbdr_3w em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Pode-se usar um intervalo baseado em perfil de verossimilhança. Para
> objetos
> de classe lm, glm e nls, tem-se a função confint() que faz isso. Veja se
> serve.
>
> À disposição.
> Walmes.
>
> ==========================================================================
> Walmes Marques Zeviani
> LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
> Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
> fone: (+55) 41 3361 3573
> VoIP: (3361 3600) 1053 1173
> e-mail: walmes em ufpr.br
> twitter: @walmeszeviani
> homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
> linux user number: 531218
> ==========================================================================
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111019/a62ea65f/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 10
> Date: Wed, 19 Oct 2011 18:49:49 -0200
> From: Guilherme Moraes Ferraudo <guiferraudo em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: [R-br] recuperar coeficientes da função discriminante
> quadrática
> Message-ID:
> <CA++u5Oh9FOsU=ezJeqJ4NKEMWtxxGPB910VhckLfDNATrZS+7A em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Boa noite,
>
> por favor, preciso dos coeficientes da função discriminante quadrática.
> Estou usando o exemplo da função "qda" para tentar enteder a função.
>
> #código R
> tr <- sample(1:50, 25)
> train <- rbind(iris3[tr,,1], iris3[tr,,2], iris3[tr,,3])
> test <- rbind(iris3[-tr,,1], iris3[-tr,,2], iris3[-tr,,3])
> cl <- factor(c(rep("s",25), rep("c",25), rep("v",25)))
> z <- qda(train, cl)
> predict(z,test)$class
>
>
> Desde já, muito obrigado.
>
> Att
>
> --
> Guilherme Moraes Ferraudo
> Jaboticabal/Campinas - SP
> http://lattes.cnpq.br/2096118558794430
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111019/c0c3cc72/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 11
> Date: Wed, 19 Oct 2011 22:05:09 +0100
> From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] recuperar coeficientes da função discriminante
> quadrática
> Message-ID:
> <CAO-arWNp8_h=WEDx9dsjFeOMd-4=dwSnjfyuBeN4zGGvbuFE6Q em mail.gmail.com
> >
> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1
>
> nao existe tal conceito em qda.
>
> vc tem as medias, matrizes de variancia-covariacia e prioris de cada
> grupo... uma vez com elas, vc determina a posteriori de cada
> observacao e classifica-a no grupo que der a probabilidade maxima.
>
> b
>
>
> ------------------------------
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>
>
> Fim da Digest R-br, volume 8, assunto 22
> ****************************************
>
--
=======================================
MSc Cassiano S. Rosa
Universidade Federal de Viçosa -UFV
Dept. Biologia Animal
Pós-graduação em Entomologia
Lab. Termitologia
Curriculo lattes:
http://lattes.cnpq.br/3030825329622014
=======================================
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
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