[R-br] Fwd: Fwd: [=?ISO-8859-1?Q?D=FAvida?=] Ler dados direto no HD

Segunda Março 28 11:51:52 BRT 2011

Luiz,

se você for trabalhar com mais de 4Gb de RAM use tudo 64-bits (processador e sistema) senão use tudo 32-bits

[]s
Tura

---------- Original Message -----------
From: Luis Iván Ortiz Valencia <liov2067 em gmail.com> 
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br 
Sent: Mon, 28 Mar 2011 09:25:42 -0300 
Subject: Re: [R-br] Fwd: Fwd: [Dúvida] Ler dados direto no HD

> Pegando a linha, desculpem o OFF TOPIC, recomendam o UBUNTU 32 ou o UBUNTU 64 bits?
> 
> Luis Ivan.
> 
> Em 28 de março de 2011 08:54, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho em gmail.com> escreveu:
> É Tura, vou voltar ao Free BSD ou mesmo o Linux devido estes gerenciar de uma melhor forma a memória. Vou investir alguns reais em uma CPU. Meu problema eu já resolvi filtrando as variáveis de interesse o que reduziu  e muito em MB a o tamanho da base de dados. Estou agora tentando entender e me pondo em uma situação que tenho uma base de dados enorme e como tratar esse problema no R. Estou percebendo que caso o que eu precise trabalha em uma base de dados que seja realmente grande, ou seja, se mesmo depois de filtrar meus interesses no banco o a base continua com vários GB tenho que ter uma memória RAM elevada. Vou olhar com mais carinho o pacote bigmemory e o SOAR.
> 
> Pedro
> 
> ---------- Mensagem encaminhada ----------
> De: Bernardo Rangel Tura [via R-br] <ml-node+3411136-758674982-223914 em n4.nabble.com>
> Data: 28 de março de 2011 06:21
> Assunto: Re: [R-br] Fwd: [Dúvida] Ler dados direto no HD
> 
> Para: Pedro Rafael Diniz Marinho <pedro.rafael.marinho em gmail.com>
> 
> On Sun, 2011-03-27 at 15:20 -0300, Pedro Rafael wrote:
> 
> > Tura,
> >  
> > mas mesmo assim isso é um grande problema. Você leu uma base de 12 gb.
> > Se tivesse lido uma de 1 tera. O R iria tentar colocar tudo na RAM?
> > Era pra existir algum gerenciamente automático de memória. Se agrava
> > ainda mais quando estou no Windows. Eu trabalho na secretaria de saúde
> > com dados do SIM, SINAN e SINASC e na verdade não tenho grandes
> > problemas mas tava pensando como seria trabalhar com uma base de dados
> > 50 vezes maior como seria usando o R....? Acho que vou montar um bom
> > computador com memória RAM lá em cima e comprar uma placa de vídeo da
> > nvidia e programar em Cuda para fazer as contas diretamente na placa
> > de video que é mais rápido kkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk
> > Sim Tura ajudou as dicas, como você falou para as base de dados os
> > comandos que você me passou em que não trasformam em fatores algumas
> > variaveis melhorou um pouco o problema.
> >  
> > -- 
> > Saudações,
> > Pedro Rafael Diniz Marinho - Estatístico SES-PB
> Rafael,
> 
> Acho que você não entende o problema ...
> 
> Se você precisa realmente manipular X Gb de dados você tem que ter mais
> de X Gg de RAM. Volto a repetir nenhum programa do mundo pode trabalhar
> com dados fora da RAM. Se você usar o dado ele tem que estar na RAM.
> 
> Acho que você está confundindo o tamanho da base de dados com quanto de
> RAm você precisa para trabalhar. Recentemente para uma demanda precisei
> avaliar todas as internações no Brasil em 2008. Ao todo são 324 arquivos
> totalizando 4,8 Gb logo a maior parte das pessoa dirão preciso de 6 Gb
> ou mais para mexer nesta base. Porém o conjunto de dados que preciso
> para a análise totalizava 141 Mb. 
> 
> Desta form fiz um script que li cada base de dados em um diretório
> selecionava o conjunto de dados (subset) num arquivo temporário e
> escrevia em csv no disco. Após isto lia todos os arquivos csv de uma vez
> só e os unificava com rbind em um único arquivo que utilizando save se
> transformou em 1 arquivo .RData de 141 mb.
> 
> Este script pode se rodado num computador com 2 Gb de RAM! Afinal o
> maior arquivo tem menos de 100 Mb.
> 
> Vou te dar um conselho de alguém que mexe com bases DATASUS faz tempo.
> larga o windows, os paciente com demência gerenciam suas memorias melhor
> que ele em 2006 larguei o windows justamente por isso.
> 
> Se quiser comprar um computador escolha um com vários núcleos (Phenom X6
> por exemplo)  e compre RAM. Na minha experiência usar CUDA não vale a
> pena para isto. CUDA é bom para situações onde vc tem uma quantidade
> enorme de cálculos e não manipulação de dados
> 
> -- 
> []s
> Tura
> 
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email]
> 
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> 
> 
-----------------------------------------------------------------------

> 
> If you reply to this email, your message will be added to the discussion below:http://r-br.2285057.n4.nabble.com/Duvida-Ler-dados-direto-no-HD-tp3400886p3411136.html
> 
> To unsubscribe from R-br, click here.
> 
> -- 
> 
> Saudações,
> Pedro Rafael Diniz Marinho - Estatístico SES-PB
> 
> Currículo Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.jsp?id=K4250792T6
> 
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> 
> 
> 
> -- 
> Luis Iván Ortiz Valencia
> Doutorando Saúde Pública - Epidemiologia, IESC, UFRJ
> Estatístico Msc.
> Spatial Analyst Msc.
> ...............................................
> Curriculum Lattes
> 
> http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.jsp?id=K4778724J3
> ...............................................
> Aquarela Cusco Hostel Perú
> 
> http://www.aquarelacuscohostel.com/
> ...............................................
------- End of Original Message -------
 
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20110328/c08b97c6/attachment-0001.html>