[R-br] Fwd: Fwd: [Dúvida] Ler dados direto no HD

Segunda Março 28 10:16:43 BRT 2011

64 bits, desde que seu processador suporte 64 bits
On 28/03/2011, at 09:25, Luis Iván Ortiz Valencia wrote:

> Pegando a linha, desculpem o OFF TOPIC, recomendam o UBUNTU 32 ou o UBUNTU
> 64 bits?
> 
> Luis Ivan.
> 
> Em 28 de março de 2011 08:54, Pedro Rafael
> <pedro.rafael.marinho em gmail.com>escreveu:
> 
>> É Tura, vou voltar ao Free BSD ou mesmo o Linux devido estes gerenciar de
>> uma melhor forma a memória. Vou investir alguns reais em uma CPU. Meu
>> problema eu já resolvi filtrando as variáveis de interesse o que reduziu  e
>> muito em MB a o tamanho da base de dados. Estou agora tentando entender e me
>> pondo em uma situação que tenho uma base de dados enorme e como tratar esse
>> problema no R. Estou percebendo que caso o que eu precise trabalha em uma
>> base de dados que seja realmente grande, ou seja, se mesmo depois de filtrar
>> meus interesses no banco o a base continua com vários GB tenho que ter uma
>> memória RAM elevada. Vou olhar com mais carinho o pacote bigmemory e o SOAR.
>> 
>> Pedro
>> 
>> ---------- Mensagem encaminhada ----------
>> De: Bernardo Rangel Tura [via R-br] <
>> ml-node+3411136-758674982-223914 em n4.nabble.com>
>> Data: 28 de março de 2011 06:21
>> Assunto: Re: [R-br] Fwd: [Dúvida] Ler dados direto no HD
>> 
>> Para: Pedro Rafael Diniz Marinho <pedro.rafael.marinho em gmail.com>
>> 
>> 
>> On Sun, 2011-03-27 at 15:20 -0300, Pedro Rafael wrote:
>> 
>>> Tura,
>>> 
>>> mas mesmo assim isso é um grande problema. Você leu uma base de 12 gb.
>>> Se tivesse lido uma de 1 tera. O R iria tentar colocar tudo na RAM?
>>> Era pra existir algum gerenciamente automático de memória. Se agrava
>>> ainda mais quando estou no Windows. Eu trabalho na secretaria de saúde
>>> com dados do SIM, SINAN e SINASC e na verdade não tenho grandes
>>> problemas mas tava pensando como seria trabalhar com uma base de dados
>>> 50 vezes maior como seria usando o R....? Acho que vou montar um bom
>>> computador com memória RAM lá em cima e comprar uma placa de vídeo da
>>> nvidia e programar em Cuda para fazer as contas diretamente na placa
>>> de video que é mais rápido kkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk
>>> Sim Tura ajudou as dicas, como você falou para as base de dados os
>>> comandos que você me passou em que não trasformam em fatores algumas
>>> variaveis melhorou um pouco o problema.
>>> 
>>> --
>>> Saudações,
>>> Pedro Rafael Diniz Marinho - Estatístico SES-PB
>> 
>> Rafael,
>> 
>> Acho que você não entende o problema ...
>> 
>> Se você precisa realmente manipular X Gb de dados você tem que ter mais
>> de X Gg de RAM. Volto a repetir nenhum programa do mundo pode trabalhar
>> com dados fora da RAM. Se você usar o dado ele tem que estar na RAM.
>> 
>> Acho que você está confundindo o tamanho da base de dados com quanto de
>> RAm você precisa para trabalhar. Recentemente para uma demanda precisei
>> avaliar todas as internações no Brasil em 2008. Ao todo são 324 arquivos
>> totalizando 4,8 Gb logo a maior parte das pessoa dirão preciso de 6 Gb
>> ou mais para mexer nesta base. Porém o conjunto de dados que preciso
>> para a análise totalizava 141 Mb.
>> 
>> Desta form fiz um script que li cada base de dados em um diretório
>> selecionava o conjunto de dados (subset) num arquivo temporário e
>> escrevia em csv no disco. Após isto lia todos os arquivos csv de uma vez
>> só e os unificava com rbind em um único arquivo que utilizando save se
>> transformou em 1 arquivo .RData de 141 mb.
>> 
>> Este script pode se rodado num computador com 2 Gb de RAM! Afinal o
>> maior arquivo tem menos de 100 Mb.
>> 
>> Vou te dar um conselho de alguém que mexe com bases DATASUS faz tempo.
>> larga o windows, os paciente com demência gerenciam suas memorias melhor
>> que ele em 2006 larguei o windows justamente por isso.
>> 
>> Se quiser comprar um computador escolha um com vários núcleos (Phenom X6
>> por exemplo)  e compre RAM. Na minha experiência usar CUDA não vale a
>> pena para isto. CUDA é bom para situações onde vc tem uma quantidade
>> enorme de cálculos e não manipulação de dados
>> 
>> 
>> 
>> --
>> []s
>> Tura
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