[R-br] geoestatística - ajuste de modelo
Paulo Justiniano
paulojus em leg.ufpr.br
Segunda Junho 13 08:57:43 BRT 2011
É importante voce fazer algums analises explortorios para verificar o
compotamento dos dados anted de variograms ou likfit.
em qualquer caso abaixo a assimetria é nitida e gtransformação é
recomendada
plot(jura_dados.Cu, low=T)
plot(jura_dados.Cu, trend=~Landuse, low=T)
plot(jura_dados.Cu, trend=~Rock, low=T)
plot(jura_dados.Cu, trend=~Rock+Landuse, low=T)
require(MASS)
boxcox(jura_dados.Cu, trend=~Rock+Landuse)
plot(jura_dados.Cu, trend=~Rock+Landuse, low=T, lambda=0)
Siga as analises considerando esta (ou alguma outra TRANSFORMACAO)
likfit() retorna logLik, AIC, BIC para os odelos ajustados e portanto
é só estratir e comparar, em especial apra avaliar os efeitos das
potencias covariaveis (landuse e rock) por algum teste
Lembre que na pagina da geoR tem uma sessao de tutotias e varios scripts
com exemplo, alem do vignette do pacote
On Sun, 12 Jun 2011, nani.design em bol.com.br wrote:
>
> Boa noite,
>
> Estive tentando estudar um pouco de Geoestatística, conhecer sobre o assunto e tenho algumas dúvidas com relação ao
> R na hora de fazer as devidas modelagens.
> Estou utilizando o conjunto de dados "Jura", incluido no pacote "gstat", para um pequeno estudo. O conjunto de dados
> contém as coordenadas espaciais X e Y (Xloc e Yloc), duas variáveis categóricas Landuse e Rock, e a leitura de 7
> metais em ppm. Onde:
> Landuse: 1 = floresta;
> 2 = pastagem;
> 3 = campo;
> 4 = lavoura
>
> Rock: 1 = Argovian;
> 2 = Kimmeridgian;
> 3 = Sequanian;
> 4 = Portlandian;
> 5 = Quaternary
>
> Utilizando o pacote "geoR", gerei os variogramas de cada metal através da função "variog". Por exemplo, o variograma
> do metal Cobre através do R:
>
> library(gstat)
> library(geoR)
>
> data(jura)
> prediction.dat # conjun to de dados Jura para o estudo
>
> jura_dados.Cu <- as.geodata(prediction.dat, data.col = 8, covar.col = 3:4)
> varioJura.Cu <- variog(jura_dados.Cu, max.dist=4.5) # variograma do Cobre
> plot(varioJura.Cu, main="Variograma - Cobre", type="b")
>
> Gostaria agora de ajustar um modelo para este variograma através da função "likfit", mas não consigo. Não sei se há
> a necessidade de fazer algumas transformações antes, ou definir de alguma forma o modelo a ser ajustado, etc.
>
> Além disto, gostaria de fazer testes através da razão de máxima verossimilhança de modelos reduzidos (por exemplo,
> testando o efeito da rocha "Argovian" vamos supor, entre outros). Como faço isto na função "likfit"? Existe outras
> funções melhores neste caso para fazer os devidos ajustes?
>
> Não sei se consegui ser bem clara na minha dúvida, mas se alguém souber me ajudar ficarei imensamente gra ta.
> Obrigada,
>
>
> Ariane
>
>
>
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