[R-br] ANOVA por medidas repetidas
Edson Lira
edinhoestat em yahoo.com.br
Sexta Junho 3 11:44:23 BRT 2011
Evandro, pelo que entendi seu experimento quer comparar a concordância das leituras dos analisadores,
nesse caso tem um pacote no R chamado psych, que tem uma rotina chamada wkappa que dá a medida de concordância entre os analisadores. Instale o pacote psych e veja ?wkappa.
Quanto as técnicas: existe alguma padrão? Caso haja,tem um pacote no R chamado DiagnosisMedque calcula ROC´s, sensibilidade e especificidade da técnica. Instale o pacote DiagnosisMed e veja ?ROC.
Como em todos os pacotes do R, existem exemplo de rotinas.
Espero ter te ajudado.
Edson Lira
Estatístico
Manaus-Amazonas
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De: Evandro Malanski <evanmal em hotmail.com>
Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Enviadas: Sexta-feira, 3 de Junho de 2011 9:59
Assunto: [R-br] ANOVA por medidas repetidas
Pessoal, tenho algumas dúvidas quanto a ANOVA. Se puderem me ajudar, ficarei muito grato.
Montei o seguinte experimento com medição de organismos:
3 analisadores diferentes
3 magnificações no microscópio possíveis
2 técnicas de medição diferentes
90 organismos
Dos 90 organismos, 30 foram medidos pela magnificação 1, outros 30 na magnificação 2, e os últimos 30 na magnificação 3, por cada um dos 3 analisadores, e usando as 2 técnicas.
Ou seja, para cada organismo, tenho 6 medidas.
Eu montei a planilha da seguinte forma, mostrando somente as 10 primeiras medições:
> compara
Larva Técnica Analisador Magnificação Medida
1 1 1 1 20x 3.8303
2 2 1 1 20x 4.2159
3 3 1 1 20x 4.4470
4 4 1 1 20x 4.9549
5 5 1 1 20x 4.0265
6 6 1 1 20x 3.9235
7 7 1 1 20x 3.7697
8 8 1 1 20x 3.9166
9 9 1 1 20x 3.5777
10 10 1 1 20x 3.7515
...
Como eu tenho medidas repetidas, usei a seguinte análise do R:
compara.aov<- aov(Medida~Analisador+Magnificação+Técnica+
Analisador:Magnificação+Analisador:Técnica+Magnificação:Técnica+
Analisador:Magnificação:Técnica)
Ou seja, até mesmo a interação entre os fatores analiso.
Contudo, agora que enviei para correção o meu trabalho, questionaram que a análise está incorreta.
Segue o sumário da análise que fiz, e destaco o grau de liberdade do resíduo, que foi a partir daí que me questionaram:
> summary(compara.aov)
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
Analisador 2 0.43 0.21 0.2253 0.7984
Magnificação 2 1278.94 639.47 672.4928 <2e-16 ***
Técnica 1 0.03 0.03 0.0288 0.8654
Analisador:Magnificação 4 0.13 0.03 0.0330 0.9979
Analisador:Técnica 2 0.44 0.22 0.2336 0.7918
Magnificação:Técnica 2 0.86 0.43 0.4521 0.6366
Analisador:Magnificação:Técnica 4 0.10 0.03 0.0269 0.9986
Residuals 522 496.37 0.95
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
Esta análise eu fiz para observar se haveriam diferenças significativas entre técnicas.
Falaram que minha comparação não está baseada nas 90 larvas medidas, mas sim em todas as 540 medidas que eu tenho, como verificado nos graus de liberdade dos resíduos.
Alguém saberia me explicar melhor isso?
E, como eu poderia solucionar esse erro? Modificando a organização da planilha dos dados? Modificando a análise?
Agradeço a ajuda.
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Evandro Malanski, Oc.
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