[R-br] AJUDA - amova (package ade4)
Ricardo Fernandes Campos Junior
ricardofcj em gmail.com
Quinta Julho 14 17:04:37 BRT 2011
Olá, pessoal. Estou tentando usar a função "amova" do pacote ade4, mas não
consigo. Comparei a estrutura dos meus objetos com a dos objetos do HELP da
função, mas me parece tudo ok.
A função roda tudo bem, mas recebo o seguinte resultado:
amova(samples,sqrt(distance),structure)
$call
amova(samples = samp3, distances = sqrt(distance), structures = structurss)
$results
Df Sum Sq Mean Sq
Between regions 2 0.1371102 0.06855508
Between samples Within regions 0 0.0000000 NaN
Within samples 41 1.7349423 0.04231567
Total 43 1.8720525 0.04353610
$componentsofcovariance
Sigma %
Variations Between regions NaN NaN
Variations Between samples Within regions NaN NaN
Variations Within samples 0.04231567 NaN
Total variations NaN NaN
$statphi
Phi
Phi-samples-total NaN
Phi-samples-regions NA
Phi-regions-total NaN
Abaixo o resultado de 'str' dos meus objetos.
str(samples)
'data.frame': 19 obs. of 3 variables:
$ AF : int 0 7 1 4 0 1 2 4 1 1 ...
$ Caatinga: int 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ Cerrado : int 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 ...
str(distance)
Class 'dist' atomic [1:171] 0.0411 0.1007 0.0919 0.1007 0.0919 ...
..- attr(*, "Labels")= chr [1:19] "4" "12" "17" "19" ...
..- attr(*, "Size")= int 19
..- attr(*, "call")= language as.dist.default(m = mat)
..- attr(*, "Diag")= logi FALSE
..- attr(*, "Upper")= logi FALSE
str(structure)
'data.frame': 3 obs. of 1 variable:
$ regions: Factor w/ 3 levels "AF","Caatinga",..: 1 2 3
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Abraços,
Ricardo Fernandes Campos Junior
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