[R-br] Modificar valores de dataframe com base em outro dataframe

[João José de Simoni Gouveia]

Prezados,

Possuo dois dataframes (nomeados aqui de 1 e 2). Preciso modificar os valores do dataframe1 com base no dataframe2.
Mais precisamente:
Se os valores da coluna snp1 (dataframe1) forem iguais ao valor da linha snp1 (dataframe2), preciso converter estes valores para 0 (zero), caso contrário o valor deve ser convertido para 1 (um).
Alguém tem alguma dica?
Att
JJ
Abaixo uma ilustração do que eu tenho
DataFrame 1 -->
   snp1 snp2 snp3 snp4
1     A    A    C    T
2     A    G    T    G
3     A    G    C    G
4     A    A    C    T
5     T    G    T    T

DataFrame 2 -->
   snp       anc
1 snp1         A
2 snp2         G
3 snp3         C
4 snp4         T

E o que eu preciso ter:
Dataframe final -->
   snp1 snp2 snp3 snp4
1     0    1    0    0
2     0    0    1    1
3     0    0    0    1
4     0    1    0    0
5     1    0    1    0

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 João José de Simoni Gouveia                                                    
 Médico Veterinário, Msc.
 Doutorando em Zootecnia - PDIZ (UFC/UFPB/UFRPE)                                                          
 Professor Assistente I - Colegiado Acadêmico de Zootecnia    
 Universidade Federal do Vale do São Francisco (UNIVASF)       
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 Endereço: UNIVASF (Campus Ciências Agrárias)                     
 Rodovia BR 407, Km 12, Lote 543                                            
 Projeto de Irrigação Senador Nilo Coelho, s/nº-C1                  
 Petrolina, PE - CEP 56.300-000                                                
 Telefone: (87)3986-3800/3804-3801
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 E-mail alternativo: jjsgouveia em gmail.com                                       
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