[R-br] Simbolos pré-definidos em função das linhas de uma tabela

Sexta Abril 8 14:23:56 BRT 2011

Olha aqui um exemplo com MDS
Vc tira a informação de onde vai os pontos ai pode mudar tudo que quiser,
cor, tipo de símbolo ou tamanho.
Aqui, pequei uma matriz de distancia que de exemplo, fiz o mds dai tirei os
valores e plotei com 2 símbolos diferentes.
Pro biplot dai vc teria que ainda tirar as setinhas e plotar elas com o
comando arrows.
É mais ou menos isso não?

Tirei o exemplo desse site e dei uma adaptada pra ser símbolos no comando
plot
http://www.statmethods.net/advstats/mds.html

require(graphics)
fit<-cmdscale(eurodist,k=2)
resultados
fit

#Plotando a solução
#extraindo os valores
x <- fit[,1]
y <- fit[,2]
#plotando, olha o pch la
plot(x,y,xlab="Coordenadas 1",ylab="Coordenadas
2",main="MDS",type="p",pch=c(rep(c(19,1),ech=10),1),cex=1.5)

Em 8 de abril de 2011 13:01, Marcelo Claro de Souza <
marcelo_claro em yahoo.com.br> escreveu:

> Olá, infelizmente não deu certo. Continua aparecendo o nome da linha na
> figura ao invés de aparecer os símbolos.
> Eu tentei os comandos sugeridos tanto p biplot quanto p plot e mesmo assim
> não deu certo.
> Tem alguma outra forma que eu possa tentar?
> Em anexo segue o conjunto de dados que estou utilizando para vcs fazerem
> alguns testes.
>
> Muito obrigado.
>
> Marcelo Claro de Souza
> Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP.
> 16 - 91914780
> http://lattes.cnpq.br/5691388412841376
>
>
> --- Em *sex, 8/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani em gmail.com>* escreveu:
>
>
> De: Walmes Zeviani <walmeszeviani em gmail.com>
> Assunto: Re: [R-br] Simbolos pré-definidos em função das linhas de uma
> tabela
> Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Data: Sexta-feira, 8 de Abril de 2011, 0:42
>
>
> Marcelo,
>
> Seria isso
>
> biplot(dados.pca, xlab="pc1", ylab="pc2", pch=rep(c(19,1,2), each=6))
>
> Espero que dê certo.
>
> À disposição.
> Walmes.
>
> ==========================================================================
> Walmes Marques Zeviani
> LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
> Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
> fone: (+55) 41 3361 3573
> VoIP: (3361 3600) 1053 1173
> e-mail: walmes em ufpr.br <http://mc/compose?to=walmes@ufpr.br>
> twitter: @walmeszeviani
> homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
> linux user number: 531218
> ==========================================================================
>
>
> Em 7 de abril de 2011 23:12, Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com<http://mc/compose?to=ribas.aca@gmail.com>
> > escreveu:
>
> Tipo, um numero corresponde um simbulo.
> Por exemplo 19 é bolinha preta fechada
> 1 é bolinha com contorno preto e interior branco.
>
> digita ?pch ou ?points que vai ter uma parte que fala qual numero faz cada
> simbulo.
> então segundo seu exemplo vc deveria fazer algo como:
>
>  biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(rep(19,6),rep(1,6),rep(2,6))
>
> ai no caso repete o valor 19 que é bolinha preta  6 vez que é sua primeira
> especies e assim vai.
> a segunda especie vai ser bolinha aberta, que é o numero 1.
> O vertor tem que ter o mesmo tamanho do numero de pontos que vai ter no
> grafico, numero de linhas no caso.
> Acho que é mais ou menos isso :)
>
>
> Em 7 de abril de 2011 22:01, Marcelo Claro de Souza <
> marcelo_claro em yahoo.com.br<http://mc/compose?to=marcelo_claro@yahoo.com.br>
> > escreveu:
>
>   Walmes,
> Eu sou bem novato em R e não entendi direito.
> No caso eu devo usar da seguinte forma por exemplo:
> biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(1:7,8:14,15:21))
> é mais ou menos isso que tenho de fazer?
>
> Muito obrigado.
>
> Marcelo Claro de Souza
> Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP.
> 16 - 91914780
> http://lattes.cnpq.br/5691388412841376
>
>
> --- Em *qui, 7/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani em gmail.com<http://mc/compose?to=walmeszeviani@gmail.com>
> >* escreveu:
>
>
> De: Walmes Zeviani <walmeszeviani em gmail.com<http://mc/compose?to=walmeszeviani@gmail.com>
> >
> Assunto: Re: [R-br] Simbolos pré-definidos em função das linhas de uma
> tabela
> Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br<http://mc/compose?to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
> Data: Quinta-feira, 7 de Abril de 2011, 14:51
>
>
> Marcelo,
>
> O controle dos símbolos é com o argumento pch= {p}oint {ch}aracter dentro
> das funções gráficas. Em gráficos de dispersão, basta passar um vetor com os
> índices que identificam os símbolos. Para conhecer os símbolos faça
>
> plot(1:30, pch=1:30)
>
> Espero que no biplot() seja assim também. Caso não dê certo, forneça um
> exemplo reproduzível e destaque o erro para que possamos ajudar.
>
> À disposição.
> Walmes.
>
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>
> Em 7 de abril de 2011 13:44, Marcelo Claro de Souza <
> marcelo_claro em yahoo.com.br<http://mc/compose?to=marcelo_claro@yahoo.com.br>
> > escreveu:
>
>   Possuo um conjunto de dados composto por 21 linhas e 3 colunas.
> Ao importar os dados eu utilizo o comando row.names e atribuo nome as
> linhas para facilitar a visualização das espécies na pca (no caso utilizo o
> pacote vegan e uso o comando rda(dados,scale=TRUE)
> nesse conjunto de dados da linha 1 a 7 são plantas da mesma espécie, de 8 a
> 14 outra e de 16 a 21 a outra. Como eu faço p atribuir um símbolo único para
> cada espécie (ex: quadrado, circulo e triângulo) ao plotar um biplot?
> Muito obrigado.
>
> Marcelo Claro de Souza
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