[R-br] Desdobramento da interação via glht:multcomp

[Emmanuel Arnhold]

Ok Walmes. Já tinha visto seu exemplo e outros também. Mas queria algo mais simples. O exemplo que apresentei funciona quando uso subset para L1. Não funcina quando fraciono em L2. Aí eu troquei o nome dos níveis de Linhagens e obtive o resultado correto. 
Não fosse a necessidade de trocar os nomes (códigos) dos níveis dos fatores seria bastante prático. 
 
Obrigado.
 
Emmanuel Arnhold
 

--- Em sex, 1/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani em gmail.com> escreveu:


De: Walmes Zeviani <walmeszeviani em gmail.com>
Assunto: Re: [R-br] Desdobramento da interação via glht:multcomp
Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Data: Sexta-feira, 1 de Abril de 2011, 17:28


Emmanuel,

Para usar a multcomp::glht() para fazer desdobramentos o procedimento é diferente da agricole::HSD.test(). A glht() não faz desdobramentos por padrão, e nem consulta o data.frame original, ou seja, não adianta dar subset() como na HSD.test(). Tudo que a glht() precisa para fazer o teste está armazenado no objeto lm passado como primeiro argumento da função. De lá ela tira coisas como estimativas, matriz de covariâncias, matriz de contrastes. Por padrão, com a opção glht(..., linfct=mcp(fator="Tukey")) vai fazer o teste para os efeitos principais. Ela até dá um warning dizendo algo sobre interações. Para desdobrar a interação, você terá que passar a matriz de comparações múltiplas que identifica cada o desdobramente para a linfct=. Fiz CMR sobre isso que está na página de Ridículas do R (www.leg.ufpr.br/ridiculas). Tente entender o que foi feito em termos de modelos lineares, ok?

À disposição.
Walmes.

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